2015 Fiscal Year Research-status Report
肺がんにおけるRNA編集の異常に着目した個別化医療の確立
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15K20917
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
渡邊 広祐 東京大学, 医学部附属病院, 助教 (50644291)
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| Project Period (FY) |
2015-04-01 – 2017-03-31
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| Keywords | miRNA / RNA編集 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
①RNA編集を受けるmiRNAの同定
公開されているsmall RNAのRNA sequenceのデータベースを元に、肺がんにおいてRNA編集が変化しているmiRNAを検索した。mir-381, mir-200bではRNA編集の増加が認められ、mir-379, mir-99a, mir-411, mir-497ではRNA編集の減少が認められた。また肺がん以外の複数のがん腫（肝臓がん、副腎がん、大腸がん）についても同様の解析を行った。
②RNA編集酵素の機能解析
Crisper/Cas9によるゲノム編集技術を用いて、RNA編集酵素(ADAR1,ADAR2)を欠失した肺がん細胞株を樹立した。この細胞株を用いて、RNA編集の報告のあるタンパクをコードする遺伝子についてRNA編集を検討したところ、RNA編集酵素の欠失によりRNA編集が失われることが確認された。
③RNA編集を定量する系の確立
HRM（high resolution melting)法を用いてmiRNAの編集の比率を定量する系を確立した。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
ゲノム編集技術やHRM法は当研究室では初めての経験だったが、1年間で系を確立出来た。
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| Strategy for Future Research Activity |
①RNA編集酵素の機能解析
ADAR1,ADAR2遺伝子を欠失させた肺がん細胞株を用いて、増殖・遊走・浸潤などの形質の変化を評価する。
②RNA編集をうけるmiRNAの機能解析
RNA編集をうけるmiRNAについて、edited form、unedited formそれぞれの機能を解析する。
③肺がん臨床検体を用いた解析
肺がん手術検体を用いて、miRNAのRNA編集のバイオマーカーとしての意義を検討する。
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[Journal Article] The chimeric transcript RUNX1-GLRX5: a biomarker for good postoperative prognosis in Stage IA non-small-cell lung cancer2016
Author(s)
Ishikawa R, Amano Y, Kawakami M, Sunohara M, Watanabe K, Kage H, Ohishi N, Yatomi Y, Nakajima J, Fukayama M, Nagase T, Takai D
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Journal Title
Jpn J Clin Oncol
Volume: 46
Pages: 185-9
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] Histone methylation-mediated silencing of miR-139 enhances invasion of non-small-cell lung cancer2015
Author(s)
Kousuke Watanabe, Yosuke Amano, Rie Ishikawa, Mitsuhiro Sunohara, Hidenori Kage, Junji Ichinose, Atsushi Sano, Jun Nakajima, Masashi Fukayama, Yutaka Yatomi, Takahide Nagase, Nobuya Ohishi and Daiya Takai
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Journal Title
Cancer Medicine
Volume: 4
Pages: 1573-82
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Presentation] High expression of endoplasmic reticulum oxidoreductin (ERO) 1L is associated with resistance to cisplatin2016
Author(s)
Toshio Sakatani, Keita Maemura, Noriko Hiyama, Yousuke Amano, Kousuke Watanabe, Hidenori Kage, Masashi Fukayama, Jun Nakajima, Yutaka Yatomi, Takahide Nagase, Daiya Takai
Organizer
Fourth AACR-IASLC International Joint Conference: Lung Cancer Translational Science from the Bench to the Clinic
Place of Presentation
San Diego, USA
Year and Date
2016-01-04 – 2016-01-07
Int'l Joint Research
