2017 Fiscal Year Research-status Report
1塩基単位の組換え率推定に基づく病原細菌13種のゲノムの組換えのホット領域の解析
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15K21554
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| Research Institution | National Institute of Infectious Diseases |
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Principal Investigator |
矢原 耕史 国立感染症研究所, 薬剤耐性研究センター, 主任研究官 (70542356)
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| Project Period (FY) |
2015-04-01 – 2019-03-31
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| Keywords | 組換え / 進化 / 細菌 / ゲノム / 自然選択 / 病原性 / 集団遺伝 / 情報 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究課題で目標としていた成果は既に論文（Yahara et al, 2016, Molecular Biology and Evolution; Yahara et al, 2016, DNA Research）として発表することができ、それに基づいて、国際カンファレンスRecent Advances in Biological Sciences: A Roadmap for Island Communities（http://www.br.uipr.edu/icrabs2017/）で招待講演を行う予定であった（しかし、同カンファレンスはハリケーンのため延期となった）。一方、国内で、分子生物学会のワークショップの発展系として国立遺伝学研究所で企画された研究会「生物種間における遺伝情報の水平移動」で依頼講演を行った。また、国立感染症研究所の細菌第一部でもセミナー発表を行った。
加えて、ピロリ菌種を研究材料とした発展的な研究成果（ゲノムワイドな組換えの痕跡の推定に基づき、微細な集団構造、集団間交雑、集団の進化とその過程で生じた自然選択を研究するための、新たな解析の枠組みとパイプラインの開発（Thorell*, Yahara* (equal contribution) et al, 2017, PLoS Genetics））を、国際ワークショップApplied Bioinformatics and Public Health Microbiology 2017でe-poster発表した。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
1: Research has progressed more than it was originally planned.
Reason
論文出版と学会・セミナー発表の双方で、計画以上の達成を得ることが出来た。
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| Strategy for Future Research Activity |
今年度の達成度を継続していけるよう、今後も日々出来る限りの努力する。
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| Causes of Carryover |
理由:年度末納品等にかかる支払いが平成30年4月1日以降となったため、当該支出分については次年度の実支出額に計上予定。平成29年度分についてはほぼ使用済みである。
使用計画:上記のとおり。
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Research Products
(7 results)
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[Presentation] Rapid evolution of distinct Helicobacter pylori subpopulations in the Americas - showcase of stratified chromosome painting -2017
Author(s)
Koji Yahara*, Kaisa Thorell*, Elvire Berthenet, Daniel J. Lawson, Jane Mikhail, Ikuko Kato, Alfonso Mendez, Cosmeri Rizzato, Mar?´a Mercedes Bravo, Rumiko Suzuki, Yoshio Yamaoka, Javier Torres, Samuel K. Sheppard, Daniel Falush
Organizer
Applied Bioinformatics and Public Health Microbiology 2017
Int'l Joint Research
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