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2018 Fiscal Year Annual Research Report

Reconstruction of signal transduction machinary in the cell membrane

Research Project

Project/Area Number 15KT0087
Research InstitutionInstitute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

佐甲 靖志  国立研究開発法人理化学研究所, 開拓研究本部, 主任研究員 (20215700)

Project Period (FY) 2015-07-10 – 2019-03-31
Keywordsシグナル伝達 / ナノマシン
Outline of Annual Research Achievements

本研究は、上皮成長因子受容体 (EGFR) による細胞膜情報処理システムの再構成系を開発し、情報伝達と分岐の分子機構を解明することを目的とした。EGFRの分子数と密度を制御してナノメートルサイズの微小平面膜に再構成し、細胞内外の情報伝達、情報処理反応場の構築、動的な情報分岐・処理能力の創発に関する構成的システム研究を行った。生体膜における複雑に絡み合った反応の実体を捉えて、リポソームなど再構成膜系を利用した構成的システム研究へ基盤情報を与えるとともに、分子ダイナミクスを利用した高機能素子開発のヒントを得ることを目指した。
再構成系は直径10~15 nmの微小平面膜であるナノディスクを基盤とし、3種の再構成系の作成に成功した。すなわち精製した全長EGFRとMSP蛋白質、脂質による全長ナノディスク。人工合成したEGFRの膜貫通領域-細胞質側膜近傍領域を含むTM-JMナノディスク。SMAにより細胞膜から直接切り出した全長受容体を含むSMAナノディスクである。これらの再構成系による実験から、EGF受容体の2量体化が酸性脂質PS, PIP2と膜近傍領域の相互作用によって誘起されること。膜近傍領域T654のリン酸化は酸性脂質との相互作用を介して2量体形成を阻害すること。膜のコレステロールは2量体化を促進するが、形成される2量体構造はコレステロールを含まない膜でできる2量体とは異なっている可能性、などが示唆された。これらの現象の構造的基盤を明らかにするため、共同研究によりMDシミュレーションを行い、構造変化に重要と考えられるPIP2と膜近傍領域のアルギニン残基との相互作用を推定した。受容体の変異体による細胞生物学実験は推定結果を支持している。

  • Research Products

    (6 results)

All 2019 2018

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 4 results) Presentation (2 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 2 results)

  • [Journal Article] Shift in Conformational Equilibrium Induces Constitutive Activity of G-Protein-Coupled Receptor, Rhodopsin2018

    • Author(s)
      Maeda Ryo、Hiroshima Michio、Yamashita Takahiro、Wada Akimori、Sako Yasushi、Shichida Yoshinori、Imamoto Yasushi
    • Journal Title

      The Journal of Physical Chemistry B

      Volume: 122 Pages: 4838~4843

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.8b02819

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Automated single-molecule imaging in living cells2018

    • Author(s)
      Yasui Masato、Hiroshima Michio、Kozuka Jun、Sako Yasushi、Ueda Masahiro
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 9 Pages: 1-11

    • DOI

      10.1038/s41467-018-05524-7

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Single-molecule diffusion-based estimation of ligand effects on G protein coupled receptors2018

    • Author(s)
      Yanagawa Masataka、Hiroshima Michio、Togashi Yuichi、Abe Mitsuhiro、Yamashita Takahiro、Shichida Yoshinori、Murata Masayuki、Ueda Masahiro、Sako Yasushi
    • Journal Title

      Science Signaling

      Volume: 11 Pages: eaao1917

    • DOI

      10.1126/scisignal.aao1917

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Single-Molecule Foerster Resonance Energy Transfer Measurement Reveals the Dynamic Partially Ordered Structure of the Epidermal Growth Factor Receptor C-Tail Domain2018

    • Author(s)
      Okamoto Kenji、Sako Yasushi
    • Journal Title

      The Journal of Physical Chemistry B

      Volume: 123 Pages: 571~581

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.8b10066

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Sinlgle-molecular pharmacology of GPCRs.2019

    • Author(s)
      Sako, Y.
    • Organizer
      The 3rd Biosignal Research Center International Symposium “Modulation of GPCR Signaling by Membrane Heterogeneity and Molecular Clustering”
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] In cell automated single-molecule analysis and its extensive applications.2018

    • Author(s)
      Hiroshima, M., Yasui, M., Kozuka, J., Sako, Y., and Ueda, M.
    • Organizer
      日本生物物理学会第56回年会
    • Int'l Joint Research / Invited

URL: 

Published: 2019-12-27  

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