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2017 Fiscal Year Annual Research Report

Self-organization of chromosome territories within the cell nucleus with regard to chromosome evolution

Research Project

Project/Area Number 15KT0149
Research InstitutionThe Graduate University for Advanced Studies

Principal Investigator

田辺 秀之  総合研究大学院大学, 先導科学研究科, 准教授 (50261178)

Project Period (FY) 2015-07-10 – 2018-03-31
Keywords染色体テリトリー / 染色体 / FISH法 / 3D-FISH法 / 核内配置 / テナガザル科 / 転座切断点 / 自己組織化
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、細胞核内の染色体がどのような仕組みで核内空間に配置されているのか、システムとしての「染色体テリトリー」の進化的な創成と核内配置の仕組みに関して、構成的アプローチにより探ることを目指している。具体的には、テナガザル科における「核型高速進化」の現象に着目し、ヒトおよびアジルテナガザル培養細胞を用いて、進化的転座切断部位(Evolutionary Conserved Breakpoints; ECBs)がどのような放射状核内配置を示すかを3D-FISH法により解析した。昨年度までに、36ヶ所(Rバンド、Gバンド由来のものが18ヶ所ずつ)のECBsを選定し、それらの領域に由来するBAC-DNAをプローブとした3D-FISH法により比較検討を行った。その結果、ECBsは特定な放射状核内配置ゾーンに分布するということではなく、核内空間に一様に分布する傾向が見られた。ECBsが核内空間にランダムで一様に分布する場合は、自己組織化・ランダム分布モデル、これに対し、特定の放射状ゾーンにおいて染色体領域間の組み合わせで顕著に転座が生じている場合は、何らかの制御因子が関与することが考えられ、制御因子誘導モデルと呼ぶことができるが、実験結果より、前者の「自己組織化・ランダム分布モデル」が適用されるものと考えられた。また、ヒトとアジルテナガザル細胞核内のECBs全体の分布域を比較すると、アジルテナガザルの方がより核中心に密集して分布する傾向が見られた。さらにECBsのうち、RバンドとGバンド由来の領域の分布を比べると、Rバンド由来の領域がわずかに核中心近くに分布する傾向が見られた。反復配列の放射状核内配置の解析から、FISHシグナルがより強い領域が核中心付近に分布しており、反復配列の増幅が核中心付近で生じている、もしくは核膜周辺部では塩基置換速度が上昇している可能性が考えられた。

  • Research Products

    (10 results)

All 2017 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (4 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 3 results) Presentation (3 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] University of Florence(Italy)

    • Country Name
      Italy
    • Counterpart Institution
      University of Florence
  • [Int'l Joint Research] Ludwig Maximilians University, Munich(Germany)

    • Country Name
      Germany
    • Counterpart Institution
      Ludwig Maximilians University, Munich
  • [Journal Article] 3D-FISH法の新たな展開-マウス初期胚への応用2017

    • Author(s)
      田辺秀之、中家雅隆、三谷 匡
    • Journal Title

      生体の科学

      Volume: 68 (3) Pages: 237-242

    • DOI

      10.11477/mf.2425200619

  • [Journal Article] Co-Opted Megasatellite DNA Drives Evolution of Secondary Night Vision in Azara's Owl Monkey2017

    • Author(s)
      Koga A, Tanabe H, Hirai Y, Imai H, Imamura M, Oishi T, Stanyon R, Hirai H
    • Journal Title

      Genome Biology and Evolution

      Volume: 9 (7) Pages: 1963-1970

    • DOI

      10.1093/gbe/evx142

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Visualization of the spatial arrangement of nuclear organization using three-dimensional fluorescence in situ hybridization in early mouse embryos: A new “EASI-FISH chamber glass” for mammalian embryos2017

    • Author(s)
      Nakaya M, Tanabe H, Takamatsu S, Hosokawa M, Mitani T
    • Journal Title

      The Journal of Reproduction and Development

      Volume: 63 (2) Pages: 167-174

    • DOI

      10.1262/jrd.2016-172

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] A pair of maternal chromosomes derived from meiotic nondisjunction in trisomy 21 affects nuclear architecture and transcriptional regulation2017

    • Author(s)
      Omori S, Tanabe H, Banno K, Tsuji A, Nawa N, Hirata K, Kawatani K, Kokubu C, Takeda J, Taniguchi H, Arahori H, Wada K, Kitabatake Y, Ozono K
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 7 (1) Pages: 764

    • DOI

      10.1038/s41598-017-00714-7

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] EVOLUTIONARY CONSIDERATION FOR THE RADIAL DISTRIBUTION OF CHROMOSOME TERRITORIES IN HUMAN AND GIBBON CELL NUCLEI2017

    • Author(s)
      Hideyuki Tanabe
    • Organizer
      4D Nucleome: Cell Nucleus in Space and Time 2017
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] A NEW “EASI-FISH CHAMBER GLASS” FOR USE BY 3D-FISH TECHNIQUE: VISUALIZATION OF NUCLEAR SPATIAL ORGANIZATION IN EARLY MOUSE EMBRYOS2017

    • Author(s)
      Masataka Nakaya, Hideyuki Tanabe, Shingo Takamatsu, Misaki Hosokawa, Tasuku Mitani
    • Organizer
      4D Nucleome: Cell Nucleus in Space and Time 2017
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 染色体テリトリー・クロマチン・DNA構造の細胞核内における空間配置の特性について2017

    • Author(s)
      田辺秀之
    • Organizer
      第40回 日本分子生物学会年会
  • [Remarks] 田辺 秀之 准教授 分子細胞遺伝学・染色体ゲノム進化学

    • URL

      http://www.esb.soken.ac.jp/research/index.html#hideyuki_tanabe

URL: 

Published: 2018-12-17  

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