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2004 Fiscal Year Annual Research Report

抗原抗体反応における特異性・親和性創出と水分子との関連に関する実験的考察

Research Project

Project/Area Number 16041204
Research InstitutionTohoku University

Principal Investigator

熊谷 泉  東北大学, 大学院・工学研究科, 教授 (10161689)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 津本 浩平  東北大学, 大学院・工学研究科, 助教授 (90271866)
Keywords抗原 / 抗原抗体相互作用 / 結晶構造解析 / 特異性・親和性 / 熱力学 / 分子認識 / 変異導入 / 相補性
Research Abstract

本研究では、抗体への変異の導入が可能でかつ研究代表者らがその複合体の構造解析をすでに明らかにしている二つの抗原抗体相互作用(リゾチーム-HyHEL-10相互作用、低分子毒素シガトキシン-1C49相互作用)について、相互作用界面に存在し、水素結合を介して界面に存在するアミノ酸残基と結合している水分子の、相互作用における特異性・親和性に対する寄与を実験的に考察することにより、生命分子間相互作用に一般的に見られる、不完全な相補性を補う界面水分子が相互作用の特異性・親和性創出に果たす役割を明らかにすることを目的としている。本年度の成果は以下の通りである。
1 HyHEL-10-HEL相互作用
抗原と結合していない可変領域断片の結晶構造を明らかにし、抗原認識領域における特徴的な水和構造と変異導入による相互作用の熱力学的パラメーターの変化との対応の議論を進めた。本抗体をヒト型化した分子種、ならびにその変異体について相互作用を解析し、水分子の相補、構造変化を中心に各種パラメーターとの対応を考察した。現在、ヒト型化抗体-抗原複合体について、結晶構造解析を進めている。また、部位特異的飽和変異導入とファージ提示法を組み合わせた相互作用解析をスタートさせた。
2 CTX3C-1C49相互作用
抗原認識に関与するアミノ酸残基を中心に、Ala置換した変異体を調製し、抗原との相互作用を、表面プラズモン共鳴法による解析を中心に行い、一つのTyrとTrpがEnergetic Hot Spotであることを明らかにした。水分子を介した水素結合は抗体側のTyrの水酸基によるものであり、水酸基を除去したPhe変異体、他のアミノ酸残基に置換した変異体についても現在解析を進めている。

  • Research Products

    (17 results)

All 2005 2004

All Journal Article (16 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Tumor-directed lymphocyte-activating cytokines : refolding-based preparation of recombinant human interleukin-12 and an antibody variable domain-fused protein by additives-introduced stepwise dialysis2005

    • Author(s)
      Koki Makabe, et al.
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications 328

      Pages: 98-105

  • [Journal Article] Non-denaturing solubilization of β2 microglobulin from inclusion bodies by L-arginine2005

    • Author(s)
      Mitsuo Umetsu, et al.
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications 328

      Pages: 189-197

  • [Journal Article] Herpes simplex virus targeting to the EGF receptor by a gD-specific soluble bridging molecule2005

    • Author(s)
      Kenji Nakano, et al.
    • Journal Title

      Molecular Therapy (印刷中)

  • [Journal Article] Structural Implications for heavy metal-induced reversible assembly and aggregation of a protein : Crystal structure and metal binding properties of Pyrococcus horikoshii CutA2004

    • Author(s)
      Yoshikazu Tanaka, et al.
    • Journal Title

      FEBS Letters 556

      Pages: 167-174

  • [Journal Article] Structural characteristics and refolding of in vivo aggregates of archaeon proteins2004

    • Author(s)
      Mitsuo Umetsu, et al.
    • Journal Title

      FEBS Letters 557

      Pages: 49-56

  • [Journal Article] An Anti-Epidermal Growth Factor Receptor (EGFR) x Anti-CD3 Bispecific Diabody for Targeting T-LAK Cells to Bile Duct Caricinoma Cells.2004

    • Author(s)
      Hiroki Hayashi, et al.
    • Journal Title

      Cancer Immunology Immunotherapy 53

      Pages: 497-504

  • [Journal Article] AMEGA : antigen-mediated genetically modified cell amplification2004

    • Author(s)
      Masahiro Kawahara, et al.
    • Journal Title

      Journal of Immunological Methods 284

      Pages: 187-194

  • [Journal Article] Fucose Depletion from Human IgG1 Oligosaccharide Enhances Binding Enthalpy and Association Rate between IgG1 and FcγRIIIa2004

    • Author(s)
      Akira Okazaki, et al.
    • Journal Title

      Journal of Molecular Biology 336

      Pages: 1239-1249

  • [Journal Article] Phage-Display Selection of Antibodies to the Left End of CTX3C Using Synthetic Fragments2004

    • Author(s)
      Yoko Nagumo, et al.
    • Journal Title

      The Journal of Immunological Methods 289

      Pages: 137-146

  • [Journal Article] Reversal of antigen-dependent signaling by two mutations in antibody/receptor chimera : implication of inverse agonism in cytokine receptor superfamily.2004

    • Author(s)
      Kawahara M, et al.
    • Journal Title

      Biochemical Pharmacology 68

      Pages: 539-548

  • [Journal Article] How oligomerization contributes to the stability of archaeon proteins : The case of protein L-isoaspartyl-O-methyltransferase from Sulfolobus tokodaii2004

    • Author(s)
      Yoshikazu, Tanaka, et al.
    • Journal Title

      The Journal of Biological Chemistry 279

      Pages: 32957-32967

  • [Journal Article] Review : Role of arginine in protein refolding, solubilization, and purification.2004

    • Author(s)
      Kouhei Tsumoto, et al.
    • Journal Title

      Biotechnology Progress 20

      Pages: 301-308

  • [Journal Article] Crystal Structure of a Hyperthermophilic CutA from Pyrococcus horikoshii in 3 M Guanidine Hydrochloride : Implication for Guanidine -Side Chain Interactions2004

    • Author(s)
      Yoshikazu Tanaka, et al.
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications 323

      Pages: 185-191

  • [Journal Article] Characterization of Insoluble Aggregates Formed during Refolding of a Single-Chain Antibody2004

    • Author(s)
      Mitsuo Umetsu, et al.
    • Journal Title

      Chemistry Letters 30

      Pages: 1600-1601

  • [Journal Article] 凝集蛋白質の効率的再生と分光学的フォールディング研究の接点-抗体分子を中心として-2004

    • Author(s)
      梅津光央ら
    • Journal Title

      生物物理 (印刷中)

  • [Journal Article] 抗体療法-最近の進歩、概論:抗体療法の進歩-臨床応用への期待2004

    • Author(s)
      浅野竜太郎ら
    • Journal Title

      医学のあゆみ (印刷中)

  • [Book] コンビナトリアルバイオエンジニアリングの展開 (担当部分)ファージディスプレイの現状と今後:プロテオミクスと蛋白質工学2004

    • Author(s)
      津本浩平ら
    • Publisher
      CMC社(印刷中)

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Published: 2006-07-12   Modified: 2016-04-21  

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