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2007 Fiscal Year Annual Research Report

集団遺伝学を取り入れた種形成機構の解析

Research Project

Project/Area Number 16057201
Research InstitutionKyushu University

Principal Investigator

舘田 英典  Kyushu University, 大学院・理学研究院, 教授 (70216985)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 西田 睦  東京大学, 海洋研究所, 教授 (90136896)
隅山 健太  九州大学, 国立遺伝学研究所, 助教 (00370114)
黒岩 麻里  北海道大学, 創成科学共同研究機構, 講師 (20372261)
Keywords種分化 / 適応進化 / 集団遺伝学 / 集団間分化 / 遺伝的変異 / シクリッド / 染色体 / 遺伝子間機能部位
Research Abstract

この研究では種多様化が急速に進んだと考えられる生物種群、特に東アフリカ・ビクトリア湖のシクリッド等を中心に、現存集団の遺伝的変異を解析することによって、集団のサイズや地理的構造などが、どのように種分化に寄与したかを明らかにすることを目的とする。ビクトリア湖のシクリッドについては岩場性、沿岸性の3属5種(Paralabidochromis)"rockkribensis",Lithochromis rubripinnis, L.rufus, Neochromis greenwoodi, N.rufocaudalis)でマイクロサテライト12遺伝子座の多型を調査した。沖合性二種(Haplochromis pyrrhocephalus, H.laparogramma)のデータも合わせて解析したところ、生態的に異なる岩場性・沿岸性・沖合性の種群間、及び種群内の種問に、弱いながらも階層的な遺伝的分化ができつつあることを見いだした。染色体の解析では東工大岡田グループと共同で単離したBACクローン24個のうち、20個が染色体マーカーとして使用可能なことが判明した。20個全てにおいて、マルチカラーFISH法による解析を終了させ、これら20個は18対の染色体を識別できることがわかった。一方TAARと呼ばれる化学受容体遺伝子ファミリーの進化について、9種の脊椎動物のゲノム情報を使って解析した。魚類では四足動物に較べ特に遺伝子数が増えており、また多くの遺伝子が嗅覚器官で発現していることが明らかになった。嗅覚遺伝子の分化が種の認識に関与している可能性もあり興味深い。更に、系統特異的に進化したシス転写制御領域の分子進化学を取り入れた比較ゲノムによる推定法と、トランスジェニックマウスを用いたシス転写制御領域の機能解析法の開発を行い、哺乳類特異的な転写制御領域を発見した。

  • Research Products

    (4 results)

All 2008 2007

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (1 results)

  • [Journal Article] Isolation and charcterization of microsatellite loci in the cichlid fish in Lake Victoria, Haplochromis chilotes.2008

    • Author(s)
      K., Maeda, et. al.
    • Journal Title

      Mol. Ecol. Resources 8

      Pages: 428-430

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Possible involvement of SINEs in mammalian-specific brain formation.2008

    • Author(s)
      T., Sasaki, et. al.
    • Journal Title

      Proceedings of the National Academy of Sciences of United States of America 105

      Pages: 4220-4225

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Evolution of trace amine-associated receptor(TAAR) gene family in vertebrates: lineage-specific expansions and degradations of a second class of vertebrate chemosensory receptors expressed in the olfactory epithelium.2007

    • Author(s)
      Y., Hashiguchi・M., Nishida
    • Journal Title

      Molecular Biology and Evolution 24

      Pages: 2099-2107

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Identification and evolutionary origin of a limb enhancer in the Dlx3-7 bigene cluster.2007

    • Author(s)
      K., Sumiyama
    • Organizer
      Annual Meeting of the Society for Molecular Biology and Evolution
    • Place of Presentation
      Halifax, Nova Scotia, Canada
    • Year and Date
      2007-06-27

URL: 

Published: 2010-02-04   Modified: 2016-04-21  

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