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2007 Fiscal Year Annual Research Report

生体反応場構築による金属蛋白質の創造的構造・機能解明

Research Project

Project/Area Number 16074208
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

渡辺 芳人  Nagoya University, 物質科学国際研究センター, 教授 (10201245)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 中島 洋  名古屋大学, 大学院・理学研究科, 准教授 (00283151)
上野 隆史  名古屋大学, 大学院・理学研究科, 助教 (70332179)
Keywordsフェリチン / 結晶構造 / 還元反応 / 金属クラスター / Pdクラスター / 有機金属酵素
Research Abstract

ミオグロビン(Mb)のヘムキャビティーにヘムとは異なる構造の金属錯体を導入し、Mb内部での配位構造を検討するため、複合体のX線結晶構造解析を行った。4配位構造をとるCu^II(Sal-X)(Sal-X=N-salicylideneaminoacidato錯体と有機金属錯体であるRh・Phebox錯体はそれぞれHis64,His93に配位し、周辺のアミノ酸残基との水素結合やπ-π、CH-π相互作用によってヘムと全く異なる配位構造、配向でMbキャビティーに固定化されることを明らかにした。[Pd(allyl)CI]_2錯体を取り込んだフェリチンの結晶構造解析により、Pd(allyl)錯体はフェリチン内部の2カ所にそれぞれCys残基を架橋配位子、His、Glu残基を配位子として利用し、2核クラスターを形成することがわかった。これらの複合体は、鈴木カップリング反応を触媒し、アミノ酸置換によって人工金属クラスターの配位構造と反応性を制御することに成功した。フェニルアセチレンの重合反応を触媒する「Rh(nbd)Cl]_2錯体をフェリチン内部に固定した(図3)。フェリチン内部でのフェニルアセチレンの重合反応では、Rh(nbd)錯体を触媒とした場合と比較して狭い分子量分布をもつポリマーが得られた。アポフェリチンに対して50、100当量の[Rh(nbd)Cl]_2と反応させた複合体の結晶構造解析を行うことでフェリチン内部表面へのRh錯体の結合過程の観察を行った。その結果、3回軸チャネルから取り込まれたRh錯体は内部表面のHis49、Cys48に結合した後、大きくゆらいでいる周辺のアミノ酸残基His173やGlu45が構造変化を起こし、Rh錯体に結合することで安定な複合体を形成していることがわかった。

  • Research Products

    (19 results)

All 2008 2007 Other

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 7 results) Presentation (11 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Molecular Design of Heteroprotein Assemblies Providing a Bionanocup as a Chemical Reactor2008

    • Author(s)
      T. Koshiyama, N. Yokoi, T. Ueno, S. Kanamaru, S. Nagano, Y. Shiro, F. Arisaka, and Y. Watanabe
    • Journal Title

      Small 4

      Pages: 50-54

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Ligand Design for the Improvement of Stability of Metal Complex・Protein Hybrid2008

    • Author(s)
      N. Yokoi, T. Ueno, T. Matsui, M.Ikeda-Saito, and Y. Watanabe
    • Journal Title

      Chem. Commun.

      Pages: 229-231

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Hydrogen Peroxide Dependent Monooxygenations by Tricking te substrate Recognition of Cytochrome P450_<BSβ>2007

    • Author(s)
      O. Shoji, T. Fujishiro, H. Nakajima, M.Kim, S. Nagano, Y: Shiro, and Y. Wata-nabe,
    • Journal Title

      Angew. Chem. Int. Ed. 46

      Pages: 3656-3659

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Design and Structure Analysis of Artificial Metalloproteins: Selective Coordinati-on of His64 to Copper Complexes with Square-Planar Structure in the apo-Myo-globin Scaffold2007

    • Author(s)
      S. Abe, T. Ueno, P.A.N. Reddy, S. Okazaki, T. Hikage, A. Suzuki, T. Yamane, H. Nakajima, and Y. Wat-anabe
    • Journal Title

      Inorg. Chem. 46

      Pages: 5137-5139

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Incorporation of a Phebox Rhodium Complex into apo-Myoglobin Affords a Stab-le Organometallic Protein Showing Unprecedented Arrangement of the Complex in the Cavity2007

    • Author(s)
      Y. Satake, S. Abe, S. Okazaki, N. Ban, T. Hikage, T. Ueno, H. Nakajima, A. Suzuki, T. Yamane, H. Nis-hiyama, and Y. Watanabe
    • Journal Title

      Organometallics 26

      Pages: 4904-4908

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Reactivities of Oxo and peroxo Intermediates Studied by Hemoprotein Mutants2007

    • Author(s)
      Y. Watanabe, H. Nakajima, and T. Ueno
    • Journal Title

      Acc. Chem. Res. 40

      Pages: 554-562

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Coordination Design of Artificial Metalloproteins Utilizing Protein Vacant Space2007

    • Author(s)
      T. Ueno, S. Abe, N. Yokoi, and Y. Watanabe
    • Journal Title

      Coord. Chem. Rev. 251

      Pages: 2717-2731

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 生体反応場錯体化学2008

    • Author(s)
      渡辺芳人
    • Organizer
      日本化学会第88春季年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      20080326-30
  • [Presentation] ナノサイズ空間を有する蛋白質を利用した金属微粒子作成2008

    • Author(s)
      渡辺芳人
    • Organizer
      日本化学会第88春季年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      20080326-30
  • [Presentation] Coordination Chemistry in Protein Cages2008

    • Author(s)
      Y. Watanabe, T. Ueno, T. Koshiya-ma, M. Suzuki, S. Abe, and M Abe
    • Organizer
      The 10th Eurasia Conference on Chemical Sciences (EuAs C_2S-10)
    • Place of Presentation
      Manila, Phillipines
    • Year and Date
      20080107-11
  • [Presentation] 有機金属酵素の分子設計:蛋白質内部空間への金属錯体、金属イオンの導入2008

    • Author(s)
      渡辺芳人
    • Organizer
      第2期菅野シンポジウム(第4回講演会)
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2008-03-08
  • [Presentation] Coordination Chemistry in Protein Cages2008

    • Author(s)
      Y. Watanabe
    • Organizer
      Inorganic Chemistry Colloquium at Yale University
    • Place of Presentation
      New Haven, USA
    • Year and Date
      2008-02-26
  • [Presentation] Molecular Design of Organometalloenzymes2007

    • Author(s)
      Y. Watanabe
    • Organizer
      The 11th International Chemical Conference, Taipei (ICCT)
    • Place of Presentation
      Hsinchu, Taiwan
    • Year and Date
      20071213-16
  • [Presentation] Introduction of Metal Cofactors in Protein cages: Construction of Organometallo protein2007

    • Author(s)
      Y. Watanabe
    • Organizer
      The 67th Okazaki Conference
    • Place of Presentation
      Okazaki, Japan
    • Year and Date
      20071110-12
  • [Presentation] Transformation of Cytochrome P450d_<BSβ> into a Versatile Peroxygenase2007

    • Author(s)
      Y. Watanabe
    • Organizer
      The 4th joint IRTG SYMPOSIUM between Nagoya University and University of Munster
    • Place of Presentation
      Munster, Germany
    • Year and Date
      20070906-07
  • [Presentation] Construction of Organometalloproteins: A New Approach for Bioinorganic Chemistry2007

    • Author(s)
      Y. Watanabe
    • Organizer
      The First Asian Conference on Coordination Chemistry
    • Place of Presentation
      Okazaki, Japan
    • Year and Date
      20070729-0802
  • [Presentation] Construction of Organometalloproteins: A New Approach for Bioinorganic Chemistry2007

    • Author(s)
      Y. Watanabe
    • Organizer
      Japan-USA Joint Symposium of Chemistry of Coordinati on Space
    • Place of Presentation
      Evanston, USA
    • Year and Date
      20070624-26
  • [Presentation] Construction of Organometalloproteins2007

    • Author(s)
      Y. Watanabe
    • Organizer
      The Second International Conference on Joint Project of Chemical Synthesis Core Research Institutions
    • Place of Presentation
      Kyoto, Japan.
    • Year and Date
      2007-08-07
  • [Remarks]

    • URL

      http://bioinorg.chem.nagoya-u.ac.jp/

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Published: 2010-02-04   Modified: 2016-04-21  

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