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2007 Fiscal Year Annual Research Report

ダイニン・ナノシステムの運動と制御の分子メカニズム

Research Project

Project/Area Number 16083207
Research InstitutionNational Institute of Information and Communications Technology

Principal Investigator

大岩 和弘  National Institute of Information and Communications Technology, 第一研究部門・未来ICT研究センター・バイオICTグループ, グループリーダー (10211096)

Keywords一分子計測(SMD) / 生物物理 / ナノマシン / ナノバイオ / 分子モーター
Research Abstract

1.クライオ電子顕微鏡によるダイニンとダイニン腕の3次元構造の解明:クライオ電子線トモグラフィーを用いてクラミドモナスの鞭毛軸糸の3次元再構成を行なった。従来の電子顕微鏡像では重なり合って識別不可能だったダブレット微小管とダイニン外腕の構造をトモグラムで抽出することができた。さらにダイニン外腕-微小管複合体の三次元像の位置あわせを行い平均像を計算,像のS/N比を向上させ,45Åの分解能でダイニン外腕と微小管の複合体の三次元構造を再構成した。3つのダイニン重鎖は,それぞれのリング状頭部を微小管長軸に沿って平行に積みあげたように観察された。2層目では,隣接するダイニン外腕との連絡が確認され,協同的作動機構の構造的基盤を見出した。この成果J.Mol.Biol.に掲載され,その表紙を飾った。
2.クラミドモナス鞭毛軸糸のX線回折による構造解析:生理的条件における鞭毛内部の構成要素の空間的配置をX線繊維回折を用いて解析した。流動配向によって鞭毛軸糸試料を配向させることに成功,放射光X線を用いて,これから明瞭な子午線反射を観測した。クラミドモナスの変異株を用いて子午線反射を構造要素へ帰属できた。
3.鞭毛軸糸ダイニンの滑り運動の単一分子計測:ヘテロ2量体で存在するダイニンfに関して,in vitro運動アッセイと蛍光単一分子を用いた運動解析を進めた。ダイニンfが負荷依存的に微小管からの解離速度を上昇させることを示唆するデータを得て,鞭毛軸試内での集団特性を考える上で重要な知見を得た。この成果はBiophys.J.に掲載された。
4.新規蛍光性ATPアナログの開発:リボースの水酸基を修飾して蛍光団を縮合させた蛍光ATPアナログ,Cy3-AMP-PNPを合成し,これをF1-ATPaseの単一分子運動解析に用いた。関連成果は学術誌Cellに掲載された。

  • Research Products

    (15 results)

All 2007 Other

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 6 results) Presentation (7 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Coupling of rotation and catalysis in F1-ATPase revealed by single-molecule imaging and manipulation.2007

    • Author(s)
      Adachi, K.
    • Journal Title

      Cell 130

      Pages: 309-321

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Mechanical properties of inner-arm dynein-f(dyneinI1)studied with in vitromotility assays.2007

    • Author(s)
      Kotani, N.
    • Journal Title

      Biophysica Journal 93

      Pages: 886-894

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The coordination of protein motors and the kinetic behavio of microtubule-acomputational study.2007

    • Author(s)
      Chen, Q.
    • Journal Title

      Biophysical Chemistry 129

      Pages: 60-69

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Diversity of structural behavior in vertebrate conventional myosins complexed with actin.2007

    • Author(s)
      Iwamoto, H.
    • Journal Title

      Journal of Molecular Biology 369

      Pages: 249-264

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The architecture of outer dynein arms in situ.2007

    • Author(s)
      Ishikawa, T.
    • Journal Title

      Journal of Molecular Biology 368

      Pages: 1249-1258

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Molecular and nanometer-scale self-organized system generated by protein motor functions.2007

    • Author(s)
      Oiwa, K.
    • Journal Title

      Material Science Forum 539-543

      Pages: 3290-3296

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Controlled Nanoscale Motion, Lecture Notes 41-63

    • Author(s)
      Oiwa, K.
    • Journal Title

      Controlled Nanoscale Motion, Lecture Notes in Physics, Springer(Berlin,Heidelberg) 007

  • [Presentation] X線繊維回折により捉えた鞭毛軸糸の構造変化2007

    • Author(s)
      鳥羽 栞
    • Organizer
      第45回目本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      横浜、神奈川
    • Year and Date
      2007-12-23
  • [Presentation] The heterodimeric axonemal dynein-f Its mechanical and enzymatic properties and possible roles in beating of flagellar axonemes2007

    • Author(s)
      Kotani, N.
    • Organizer
      Internationa lConference on Molecular Mechanism of Intracellular Transport
    • Place of Presentation
      苫小牧、北海道
    • Year and Date
      2007-08-24
  • [Presentation] Force generating mechanism of axonemal dyneins inspired by cryoelectron tomography and X-ray fiber diffraction analysis2007

    • Author(s)
      Oiwa, K.
    • Organizer
      International Conference on Molecular Mechanism of Intracellular Transport
    • Place of Presentation
      苫小牧、北海道
    • Year and Date
      2007-08-24
  • [Presentation] ヘテロ二量体である鞭毛内腕ダイニン亜種の運動特性2007

    • Author(s)
      鳥羽 栞
    • Organizer
      2008年生体運動研究合同班会議
    • Place of Presentation
      苫小牧、北海道
    • Year and Date
      2007-08-24
  • [Presentation] Conformational changes of dynein-arms in situ studied using X-rayd diffraction of flagellar axonemes2007

    • Author(s)
      Oiwa, K.
    • Organizer
      6th EBSA European Biophysics Congress
    • Place of Presentation
      London UK
    • Year and Date
      2007-07-17
  • [Presentation] Forcegenerating mechanism of axonemal dyneins studied by cryoelectron tomography and X-ray fiber diffraction analysis2007

    • Author(s)
      Oiwa, K.
    • Organizer
      Japan Partnership Awards Dynein Workshop
    • Place of Presentation
      Bristol,UK
    • Year and Date
      2007-07-10
  • [Presentation] 軸糸ダイニンの構造と運動機能:トモグラムとin vitro assaysからの知見2007

    • Author(s)
      Oiwa, K.
    • Organizer
      特定領域研究 ダイニン分子研究会
    • Place of Presentation
      東京大学 東京
    • Year and Date
      2007-06-07
  • [Remarks]

    • URL

      http://www-karc.nict.go.jp/w131102/index.html

URL: 

Published: 2010-02-04   Modified: 2016-04-21  

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