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2007 Fiscal Year Annual Research Report

葉緑体の環境適応戦略

Research Project

Project/Area Number 16085206
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

鹿内 利治  Kyoto University, 大学院・理学研究科, 教授 (70273852)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 小林 善親  九州大学, 農学研究院, 教授 (90087594)
津山 孝人  九州大学, 農学研究院, 助教 (10380552)
Keywords葉緑体 / 環境適応 / 遺伝子発現 / RNA編集 / 光合成 / サイクリック電子伝達 / NDH / シロイヌナズナ
Research Abstract

RNA編集は、遺伝情報をRNA上で書き換えるものであり、植物では、プラスチドとミトコンドリアで頻繁に見られる。植物のRNA編集では、特定のC残基がUに変換されるが、そのサイト認識には、編集部位周辺の20-30塩基(シス因子)が必要であること、またそのシス因子に結合するトランス因子の存在が示唆されていた。我々は、本特定領域研究で、トランス因子がPPRタンパク質と呼ばれるRNA結合タンパク質であることを明らかにしてきた。
昨年度は、RNA編集に関わるPPRタンパク質CRR4とCRR21の比較から、両タンパク質のN末のPPRドメインが特定のRNA配列の認識に、またC末の保存性の高いE/E+ドメインはRNA編集に一般的な機能(編集酵素との結合?)に関わることを示した。本年度は、このC末ドメインの機能を明らかにするために、このドメインを高発現させた植物を解析した。植物は、RNA編集に一部異常を示し、多くのラインが芽生えの状態で枯死した。焦点は、このドメインとの結合タンパク質単離の生化学であり、植物が致死になる問題を解決するため、一過性発現の系を模索中である。
今年度、プラスチドのRNA編集の異常な変異株を新たに二つ単離した。今後、RNA編集装置のモデルは、このPPRタンパク質の構造も考慮に入れる必要があり、ドメインの機能解析を開始した。
タバコ属植物で、ndhD-1サイト編集効率の違いが報告されている。これらの植物からCRR4をそれぞれ単離し、シロイヌナズナのcrr4変異株に導入することで、この効率の違いがCRR4の配列の違いに起因することを明らかにした。RNA編集効率の低下にも関わらず、ndhDの発現はこのタバコ植物で充分であり、進化の過程でPPRタンパク質であるCRR4の機能低下が許容されてきたことが明らかになった。

  • Research Products

    (25 results)

All 2008 2007

All Journal Article (9 results) (of which Peer Reviewed: 8 results) Presentation (16 results)

  • [Journal Article] How do plants respond to copper deficiency?2008

    • Author(s)
      Yamasaki H, Pilon M, Shikanai T
    • Journal Title

      Plant Signaling & Behavior (印刷中)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Characterization of factors affecting the activity of photosystem I cyclic electron transport in chloroplasts.2008

    • Author(s)
      Okegawa Y, Kagawa Y. Kobayashi Y. Shikanai T
    • Journal Title

      Plant Cell Physiol. 48(印刷中)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] CRR23/NdhL is a subunit of the chloroplast NAD(P)H dehydrogenase complex in Arabidopsis.2008

    • Author(s)
      Shimizu H, Peng L, Myouga F, Motohashi R, Shinozaki K, Shikanai T
    • Journal Title

      Plant Cell Physiol. 48(印刷中)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Machinery of RNA editing2008

    • Author(s)
      Shikanai T, Obokata J
    • Journal Title

      Machinery of RNA editing in plant organelles. In "RNA and DNA editing:Molecular mechanisms and their integration into biological system., WILEY INTERSCIENCE

      Pages: 99-119

  • [Journal Article] Dihydrodipicolinate reductase-like protein, CRR1, is essential for chloroplast NAD(P)H dehydrogenase in Arabidopsis.2007

    • Author(s)
      Shimizu H, Shikanai T
    • Journal Title

      Plant J. 52

      Pages: 539-47

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Regulation of copper homeostasis by microRNA in Arabidopsis.2007

    • Author(s)
      Yamasaki H, Abdel-Ghany SE, Cohu CM, Kobayashi Y, Shikanai T, Pilon M.
    • Journal Title

      J. Biol. Chem. 104

      Pages: 16369-16378

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Conserved domain structure of pentatricopeptide repeat proteins involved in chloroplast RNA editing.2007

    • Author(s)
      Okuda K, Myouga F, Motohashi R, Shinozaki K, Shikanai T
    • Journal Title

      Proc. Natl. Acad. Sci. USA 282

      Pages: 8178-8183

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Balanced PGR5 level is required for chloroplast development and optimum operation of cyclic electron transport around photosystem I.2007

    • Author(s)
      Okegawa Y. Long TA, Iwano M, Takayama S, Kobayashi Y, Covert SF, Shikanai T
    • Journal Title

      Plant Cell Physiol. 48

      Pages: 1462-1471

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The NAD(P)H dehydrogenase complex in photosynthetic organisms: Subunit composition and physiological function.2007

    • Author(s)
      Shikanai T
    • Journal Title

      Func. Plant Sci. Biotech. 1

      Pages: 129-137

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 葉緑体RNA編集を行なう装置2008

    • Author(s)
      鹿内利治
    • Organizer
      日本植物生理学会第49回年会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター
    • Year and Date
      2008-03-21
  • [Presentation] シロイヌナズナにおける銅欠乏環境への適応機構を制御するマスター遺伝子、SPL7の解析2008

    • Author(s)
      山崎広顕、小林善親、鹿内利治
    • Organizer
      日本植物生理学会第49回年会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター
    • Year and Date
      2008-03-21
  • [Presentation] タバコ祖先種における葉緑体RNA編集システムの比較解析2008

    • Author(s)
      奥田賢治、羽畑優哉、小林等親、鹿内利治
    • Organizer
      日本植物生理学会第49回年会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター
    • Year and Date
      2008-03-21
  • [Presentation] 光化学系Iサイクリック電子伝達は葉緑体分化初期にすでに活性を示す。2008

    • Author(s)
      桶川友季、小林善親、鹿内利治
    • Organizer
      日本植物生理学会第49回年会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター
    • Year and Date
      2008-03-20
  • [Presentation] Characterization of the stromal protein required for stabilizing the chloroplast NDH complex.2008

    • Author(s)
      Peng Y., Shikanai T.
    • Organizer
      日本植物生理学会第49回年会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター
    • Year and Date
      2008-03-20
  • [Presentation] Mechanism of RNA editing in plastids.2008

    • Author(s)
      Shikanai T
    • Organizer
      The Plant and Animal Genome XVI Conference
    • Place of Presentation
      サンディエゴ
    • Year and Date
      2008-01-14
  • [Presentation] Machinery of RNA editing contains PPR proteins in plastids.2008

    • Author(s)
      Shikanai T
    • Organizer
      Plant Winter Conference, POSTEC
    • Place of Presentation
      POTECH Korea
    • Year and Date
      2008-01-07
  • [Presentation] Characterization of regulatory factors of PGR5-dependent PSI cyclic electron transport.2007

    • Author(s)
      Okegawa Y, Kobayashi Y, Shikanai T
    • Organizer
      International Congress of Photosynthesis
    • Place of Presentation
      グラスゴー
    • Year and Date
      20070723-27
  • [Presentation] PPR proteins function as a trans-factor in chloroplast RNA editing.2007

    • Author(s)
      Okuda K, Shikanai T
    • Organizer
      International Congress of Photosynthesis
    • Place of Presentation
      グラスゴー
    • Year and Date
      20070723-27
  • [Presentation] The adaptation Mechanism to copper deficiency via microRNA in Arabidopsis.2007

    • Author(s)
      Yamasaki H, Abdel-Ghany SE, Cohu CM, Kobayashi Y, Pilon M, Shikanai T
    • Organizer
      International Congress of Photosynthesis
    • Place of Presentation
      グラスゴー
    • Year and Date
      20070723-27
  • [Presentation] CRR1 is specifically involved in accumulation of the chloroplast NDH co mplex despite its homology TO DHPR in Arabidopsis.2007

    • Author(s)
      Shimizu H, Shikanai T
    • Organizer
      International Congress of Photosynthesis
    • Place of Presentation
      グラスゴー
    • Year and Date
      20070723-27
  • [Presentation] Function of PPR proteins as a trans-factor in chloroplast RNA editing2007

    • Author(s)
      Okuda K, Shikanai T
    • Organizer
      ICPMB2007
    • Place of Presentation
      奈良
    • Year and Date
      20070625-29
  • [Presentation] 光化学系1サイクリック電子伝達の生理機能2007

    • Author(s)
      鹿内利治
    • Organizer
      BMB2007
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2007-12-13
  • [Presentation] SPL7 is a master regulatory factor involved in copper homeostasis in Arabidopsis cells.2007

    • Author(s)
      山崎広顕、小林善親、鹿内利治
    • Organizer
      BMB2007
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2007-12-11
  • [Presentation] Regulation of photosynthesis via PSI cyclic electron transport.2007

    • Author(s)
      Okegawa Y, Shikanai T
    • Organizer
      International Congress of Photosynthesis
    • Place of Presentation
      グラスゴー
    • Year and Date
      2007-07-25
  • [Presentation] シロイヌナズナを用いた光合成研究2007

    • Author(s)
      鹿内利治
    • Organizer
      光合成研究会07年度シンポジウム
    • Place of Presentation
      岡山
    • Year and Date
      2007-05-26

URL: 

Published: 2010-02-04   Modified: 2014-10-28  

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