• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2006 Fiscal Year Annual Research Report

環境刺激(放射線や活性酸素)による直接および間接的DNA損傷生成のメカニズム

Research Project

Project/Area Number 16205003
Research InstitutionHiroshima University

Principal Investigator

相田 美砂子  広島大学, 大学院理学研究科, 教授 (90175159)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 大野 啓一  広島大学, 大学院理学研究科, 教授 (50033858)
岡田 和正  広島大学, 大学院理学研究科, 助教授 (90294511)
勝本 之晶  広島大学, 大学院理学研究科, 助手 (90351741)
Keywords核酸塩基 / keto-enol互変異性 / amino-imino互変異性 / 軟X線 / 内殻イオン化 / 低温マトリックス単離 / 非経験的分子軌道法 / QM / MM法
Research Abstract

DNA損傷には,外部刺激によるDNA塩基の互変異性化反応が深く関わっている.しかし、互変異性化への外部刺激の効果については、これまで系統的に調べられていなかった。そこで、我々は様々な溶液中におけるモデル塩基の互変異性化を,赤外分光法と量子化学計算によって調べた.その結果,ピリドンおよびその誘導体の互変異性は溶媒の極性に大きく依存することが明らかとなった.これらの傾向は,ピリミジミノンをモデル塩基として行った場合でも同様に得られた.
活性酸素による核酸塩基の修飾塩基が、どのようなメカニズムでDNA損傷につながるのかを明らかにするため、8-オキソグアニンを取り上げた。この修飾塩基の互変異性体の相対的安定性が、グアニンとは大きく異なることを、信頼性のある非経験的分子軌道法計算によって明らかにした。また、QM/MM法を用いることによって、さまざまな核酸塩基の溶媒和構造を得た。
UV照射によって、核酸塩基のモデル化合物において、アミノ-イミノ互変異性化がおこる過程を、赤外分光法と量子化学計算によって明らかにした。この結果は、アミノ-イミノの互変異性もDNAにおいて光によって誘起されうることを示すものである。
放射線による構成塩基の直接的損傷を調べるため、モデル分子として2-アミノ-3-メチルピリジンを対象とし、その窒素および炭素内殻領域での解離を調べた。その結果、特に窒素内殻イオン化が起こる励起エネルギーにおいて、窒素原子周りでの解離が顕著となる特徴的な反応が観察された。この系に対して提唱した解離機構は、2-,3-,4-ピコリンを用いた同様の実験によって支持された。

  • Research Products

    (16 results)

All 2007 2006

All Journal Article (16 results)

  • [Journal Article] BSSE-corrected Three-body Interaction Energy in the Recognition of GC Base Pair by Asparagine2007

    • Author(s)
      T.Yoshida
    • Journal Title

      Chemistry Letters 36・1

      Pages: 124-125

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Journal Article] Photochemistry of 2-(methylamino)pyridine in a low-temperature argon matrix : Amino-imino tautomerism and rotational isomerism2007

    • Author(s)
      N.Akai
    • Journal Title

      Journal of Photochemistry and Photobiology A : Chemistry 187

      Pages: 113-118

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Journal Article] Intramolecular CH...π and CH...O interactions in the conformational stability of benzyl methyl ether studied by matrix-isolation infrared spectroscopy and theoretical calculations2007

    • Author(s)
      K.Shin-ya
    • Journal Title

      J. Mol. Struct 827・1-3

      Pages: 155-164

  • [Journal Article] Infrared intensity study on molecular interactions in quinhydrone2006

    • Author(s)
      I.Kanesaka
    • Journal Title

      Bul. Chem. Soc. Jpn. 79

      Pages: 406-412

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Journal Article] Photoinduced amino-imino tautomerism : An infrared study of 2-amino-5-methylpyridine in a low-temperature argon matrix2006

    • Author(s)
      N.Akai
    • Journal Title

      J. Phys. Chem. A 110

      Pages: 6016-6022

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Journal Article] Origin of the blue shift of the CH stretching band for 2-buthoxyethanol in water2006

    • Author(s)
      Y.Katsumoto
    • Journal Title

      J. Am. Chem. Soc 128

      Pages: 9278-9279

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Journal Article] Polymerization of N-isopropylacrylamide under magnetic levitation2006

    • Author(s)
      Y.Fujiwara
    • Journal Title

      J. Phys. : Conference Series 51

      Pages: 458-461

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Journal Article] Dimerization and Double Proton Transfer-Induced Tautomerism of 4(3H)-Pyrimidinone in Solution Studied by IR Spectroscopy and Quantum Chemical Calculations2006

    • Author(s)
      A.Padermshoke
    • Journal Title

      J. Phys. Chem. B 110

      Pages: 26388-26395

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Journal Article] On the ionization energy of CF_3SF_5 in the valence region measured by angle-resolved photoelectron spectroscopy2006

    • Author(s)
      T.Ibuki
    • Journal Title

      J. Electron Spectrosc. Relat. Phenom 152・1-2

      Pages: 96-99

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Journal Article] Formation of H_3O^+ by the soft X-ray ionization of ethanol clusters2006

    • Author(s)
      Y.Tamenori
    • Journal Title

      Chem. Phys. Lett. 433・1-3

      Pages: 43-47

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Journal Article] A Quantum Chemical Study of the Catalysis for Cytidine Deaminase : Contribution of the Extra Water Molecule2006

    • Author(s)
      T.Matsubara
    • Journal Title

      Journal of Chemical Information and Modeling 46・3

      Pages: 1276-1285

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Journal Article] H-bond patterns and structure distributions of water octamer (H_2O)_8 at finite temperatures2006

    • Author(s)
      T.Miyake
    • Journal Title

      Chemical Physics Letters 427

      Pages: 215-220

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Journal Article] Population of 6-Enol Form is Higher in 8-Oxoguanine than in Guanine2006

    • Author(s)
      T.Yoshida
    • Journal Title

      Chemistry Letters 35・8

      Pages: 924-925

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Journal Article] Conformational behavior of N-methylformamide in the gas, matrix and solution states as revealed by IR and Raman spectroscopic measurements and by theoretical calculations2006

    • Author(s)
      S.Shin
    • Journal Title

      J. Mol. Struct 791

      Pages: 30-40

  • [Journal Article] Raman spectra and conformational analyses for a series of diethyl ether and its organosilicon derivatives, CH_3MH_2OM'H_2CH_3 (M, M'= C and Si), by density functional theory2006

    • Author(s)
      K.Taga
    • Journal Title

      J. Mol. Struct. 788

      Pages: 159-175

  • [Journal Article] Matrix-isolation infrared spectra of 2-,3- and 4-pyridinecarboxaldehyde before and after UV irradiation2006

    • Author(s)
      K.Ohno
    • Journal Title

      J. Mol. Struct. 825

      Pages: 143-150

URL: 

Published: 2008-05-08   Modified: 2016-04-21  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi