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2004 Fiscal Year Annual Research Report

深海熱水環境からの超好熱古細菌ゲノム資源の大規模収集とその産業技術への応用

Research Project

Project/Area Number 16208020
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (A)

Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

左子 芳彦  京都大学, 農学研究科, 教授 (60153970)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 石野 良純  九州大学, 農学研究院, 教授 (30346837)
高井 研  海洋研究開発機構, 極限環境フロンティア, グループリーダー (80359166)
野村 紀通  京都大学, 農学研究科, 助手 (10314246)
Keywords古細菌 / 超好熱菌 / 耐熱性酵素 / 海底熱水口 / 有用ゲノム資源 / メタゲノム解析 / 環境バイオテクノロジー / 知的財産権
Research Abstract

1.中部沖縄トラフ伊平屋北の海底熱水口(水深約1000m)から「しんかい2000」により採取された試料に対して、希釈培養法による各微生物種の生息量および生理機能解析,分子生物学的手法による微生物群集構造解析を行った.その結果,熱水口を極大としてε-prpteobacteriaによる活発な一次生産の場が広がっていること等を明らかにした.また,ε-prpteobacteriaのほとんどが熱水中の水素ガスを主要なエネルギー源とし多様な代謝系を有する細菌であることをつきとめた.同時にこれらの試料から多数の新規超好熱菌を分離し,新種登録をした.
2.深海熱水口から分離された好気性超好熱古細菌Aeropyrum caminiから酸素耐性が著しく高い超好熱性ヒドロゲナーゼ活性を発見し,精製し性質を調べた.このヒドロゲナーゼ(H_2ase)は分子量97kDaであり,85℃,pH8.5の条件下で最大の水素酸化活性14.8U/mg(ただし,1U=1分間に1μmolの酸化型メチルビオロゲンを還元する活性)を示した.また,この酵素は酸素への曝露168時間後も75%の残存活性を有しており,水素エネルギー触媒に応用可能な特性を示した.
3.超好熱古細菌ゲノムから新規な認識配列をもつLAGLIDADG型ホーミングエンドヌクレアーゼを19種同定し,I-ApeI, I-ApeII, I-PogI, I-Tsp061I等と名づけた.いずれも14〜22bpの長さの偽回文配列または非回文配列を認識するレアカッター酵素であり,それらの基質特異性を詳細に検討した.I-Tsp061Iの結晶については分解能2.7Åの精密立体構造を解明することに成功し,その原子座標をPDBに登録した(PDB番号:1VAW). I-ApeII遺伝子にランダム変異を導入することにより,その基質特異性が野生型とは異なる人工レアカッター酵素の創製に成功した.これらの酵素はゲノム地図作製,メガbp規模のDNA断片のクローニング(メガクローニング)等,ゲノム工学やバイオ産業への応用が期待される.

  • Research Products

    (7 results)

All 2005 2004

All Journal Article (6 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Thioreductor micantisoli gen. nov., sp. nov., a novel mesophilic, sulfur-reducing chemolithoautotroph within the epsilon-Proteobacteria isolated from hydrothermal sediments in the Mid-Okinawa Trough.2005

    • Author(s)
      Nakagawa, S. et al.
    • Journal Title

      Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 55

      Pages: 599-605

  • [Journal Article] Nitratiruptor tergarcus gen. nov., sp. nov. and Nitratifractor salsuginis gen. nov., sp. nov., two nitrate-reducing chemolithoautotrophs within the epsilon-Proteobacteria isolated from a deep-sea hydrothermal system in the Mid-Okinawa.2005

    • Author(s)
      Nakagawa, S. et al.
    • Journal Title

      Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 55

      Pages: 925-933

  • [Journal Article] Crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of homing endonuclease I-Tsp061I2004

    • Author(s)
      Imagawa, T. et al.
    • Journal Title

      Acta. Crystallogr. D Biol. Crystallogr. 60・11

      Pages: 2006-2008

  • [Journal Article] Aeropyrum camini sp. nov., a strictly aerobic, hyperthermophilic archaeon from a deep-sea hydrothermal vent chimney2004

    • Author(s)
      Nakagawa, S. et al.
    • Journal Title

      Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 54・2

      Pages: 329-335

  • [Journal Article] Methanotorris formicicus sp. nov., a novel extremely thermophilic, methane-producing archaeon isolated a black smoker chimney in the Central Indian Ridge2004

    • Author(s)
      Takai, K. et al.
    • Journal Title

      Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 54

      Pages: 1095-1100

  • [Journal Article] Hydrogenimonas thermophila gen. nov., sp. nov., a novel thermophilic, hydrogen-oxidizing chemolithoautotroph within the epsilon-Proteobacteria, isolated from a black smoker in a Central Indian Ridge2004

    • Author(s)
      Takai, K. et al.
    • Journal Title

      Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 54

      Pages: 25-32

  • [Book] 深海熱水孔と好熱バイオテクノロジー,京大人気講義シリーズパイオサイエンスの新戦略(京都大学農学部編)2004

    • Author(s)
      左子芳彦
    • Total Pages
      184
    • Publisher
      丸善

URL: 

Published: 2006-07-12   Modified: 2016-04-21  

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