2006 Fiscal Year Annual Research Report
全ゲノムを対象とした遺伝性眼疾患のマイクロサテライトマッピング
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16209052
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| Research Institution | Yokohama City Univercity |
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Principal Investigator |
水木 信久 横浜市立大学, 医学研究科, 教授 (90336579)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
大野 重昭 北海道大学, 大学院医学研究科, 教授 (50002382)
猪子 英俊 東海大学, 医学部, 教授 (10101932)
伊藤 典彦 横浜市立大学, 医学部, 助手 (80264654)
西出 忠之 横浜市立大学, 医学部, 助手 (90347344)
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| Keywords | マイクロサテライト / 遺伝子マッピング / 強度近視 / ベーチェット病 / 網膜格子状変性 / 高血圧 / SNP / ゲノム医科学 |
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| Research Abstract |
本研究では、遺伝性眼疾患を対象とし、マイクロサテライト(MS)マーカー約2万5000個を用いて、ゲノムワイドな疾患感受性遺伝子のマッピングおよび同定を行っている。各疾患の研究の進捗について以下に報告する。
強度近視:534検体を収集した。pooled DNAを用いた3段階のMSスクリーニングが終了し、156個の陽性マーカーが得られた。得られた陽性マーカーについて、individual DNAタイピングを行った結果、26個まで候補領域が絞り込まれた。現在、絞り込まれた領域に関して、SNP解析を行っている。
ベーチェット病:427検体を収集した。三段階のMSスクリーニング、individual DNAタイピングが終了し、11個の候補領域が得られた。現在、これらの候補領域においてSNP解析を行っている。また、引き続き検体の収集を行っている。
網膜格子状変性:397検体を収集した。100検体で一次スクリーニングを行い、約12.1%の陽性マーカーが得られた。引き続き検体の収集を行っている。また連鎖解析を行うための家系サンプルの収集も行っており現在まで1家系、4検体を収集した。
高血圧:508検体を収集した。MSスクリーニングが終了し、135個の陽性マーカーが得られた。得られた陽性マーカーについて、individualタイピングを行った結果、55個まで候補領域が絞り込まれた。現在、絞り込まれた領域に関して、SNP解析を行っている。
緑内障:192検体を収集した。138検体で一次スクリーニングを行い、13.8%の陽性マーカーが得られた。現在、得られた陽性マーカーについて二次スクリーニングを行っている。またGeneChipによるSNPタイピングも併せて行っている。
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Research Products
(16 results)
