2004 Fiscal Year Annual Research Report
肉腫診断のためのcDNAアレイ開発とその臨床応用に関する研究
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16590269
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Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
高澤 豊 東京大学, 医学部附属病院, 助手 (50313151)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
大橋 健一 東京大学, 医学部附属病院, 助教授 (40231203)
西村 訓弘 株式会社ジェネティックラボ, 創薬研究部長(研究職)
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| Keywords | 肉腫 / キメラ遺伝子 / 病理診断 / cDNAアレイ |
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| Research Abstract |
【はじめに】軟部腫瘍はその種類の多さ,希少性,組織像の多彩さから病理組織学的診断に難渋することが多い.近年,多くの肉腫に特異的キメラ遺伝子が同定され,その検出が有力な病理補助診断になりつつあり.一方,cDNAアレイは同時に多数の遺伝子の発現解析が可能な技術であるが,中でもcDNAマクロアレイ法は,限定的な数の遺伝子の詳細な解析に適している.
【目的】肉腫特異的なキメラ遺伝子のcDNAマクロアレイ法による検出法を確立し,新たな肉腫診断法として位置付ける.
【方法】特異的キメラ遺伝子を有する肉腫(EWS-Fli13例,EWS-ATF14例,EWS-WT12例,EWS-CHN2例,TAF2N-CHN1例)に関して,病理組織標本(ホルマリン固定パラフィン包埋材料)より抽出したRNAよりcDNAを作成後,キメラ遺伝子の様々なエクソン特異的プライマーによるビオチン付加PCR法を施行し,各キメラ遺伝子のプローブを搭載したメンブレンとハイブリダイゼーションを行い,化学発光法により検出した.
【結果】個々の肉腫に特異的なプライマーのみの検出系ではEWS-CHN, TAF2N-CHNを除き,シグナルの検出が良好であり,キメラ遺伝子の融合エクソンの同定が可能であった.一方,すべてのプライマーを混合した場合には非特異的シグナルの増強が認められ,本来のシグナルの同定が困難になる傾向があった.
【結論】cDNAマクロアレイ法によるキメラ遺伝子同定法は構築可能であるが,特異性に関して改善を要すると考えられた.特に,1)PCR反応時の非特異的増幅,2)PCR法によるラベリング,3)ハイブリダイゼーションの効率に関してさらなる検討が必要である.EWS-CHN, TAF2N-CHNでは検出感度に問題があると考えられた.
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Research Products
(1 results)
