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2004 Fiscal Year Annual Research Report

膜蛋白から膜蛋白へどのようにして情報が伝達されるのか?

Research Project

Project/Area Number 16659010
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

加茂 直樹  北海道大学, 大学院・薬学研究科, 教授 (10001976)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 宮内 正二  北海道大学, 大学院・薬学研究科, 助教授 (30202352)
Keywordsphoborhodopsin / レチナールタンパク / 走光性 / 蛋白間相互作用 / 等温滴定型熱量計 / 水素結合 / Natromonus pharaonis
Research Abstract

pharaonis phoborhodopsin(ppRと略す.Natromonus pharaonis sensory rhodopsin II, NpSRIIとも称せられる)は,N.pharaonisの細胞膜に存在するレチナールを発色団とする7回膜貫通型タンパクである.この色素タンパクは,約500nmに吸収極大を持ち,光で励起されるとこの菌体はこの光から逃げると言う負の走光性を示す.ppRは膜中でpharaonis halobacterial transducer II (pHtrII)という2本の膜貫通ヘリックスをもつタンパクと相互作用をしている.我々は以前に,この両者の結合の解離定数は約0.1μMの強い結合であることを明らかにした.この解離定数は等温滴定型カロリメトリー(isothermal titration calorimetry, ITC)を用いて求められたものである.また,我々はppRとpHtrIIがが結合すると,ppR単体よりも熱安定性が増すことを発見した.この方法はっ結合の解離定数を算出するというような定量的な議論は出来ないが,結合するか否かを簡単に判定出来る.今年度はITCの使用や熱安定性を指標に,2つのタンパクでの相互作用部位を検討した.その結果,ppRのY199とpHtrIIのN74との水素結合,ppRのY199とpHtrIIのF28とのベンゼン環の相互作用,ppRのT189とpHtrIIのS62およびE43との2本の水素結合が重要であることを,ITCや熱安定性測定の方法で明らかにした.また,ppRとpHtrIIとの細胞内ドメインの相互作用の存在を示した.来年度は,これらの結合部位を介しての情報伝達機構の解明を行う.

  • Research Products

    (6 results)

All 2005 2004 Other

All Journal Article (6 results)

  • [Journal Article] Linker region of a halobacterial transducer protein interacts directly with its sensor retinal protein2005

    • Author(s)
      Y.Sudo et al.
    • Journal Title

      Biochemistry (in press)

  • [Journal Article] Correlation of the 0-intermediate rate with the pKa of Asp75 in the dark, the counterion of the Schiff base of pharaonis phoborhodopsin2004

    • Author(s)
      M.Iwamoto et al.
    • Journal Title

      Biophys.J. 88

      Pages: 1215-1223

  • [Journal Article] The elution profile of immobilized liposome chromatography2004

    • Author(s)
      M.Ohno et al.
    • Journal Title

      Biochim.Biophys.Acta 1665

      Pages: 167-176

  • [Journal Article] The role of charged residues of pharaonis phoborhodopsin in its interaction with the transducer protein2004

    • Author(s)
      Y.Sudo et al.
    • Journal Title

      Biochemistry 43

      Pages: 13748-13754

  • [Journal Article] Proton release and uptake of pharaonis phoborhodopsin (sensory rhodopsin II) reconstituted into phospholipids2004

    • Author(s)
      M.Iwamoto et al.
    • Journal Title

      Biochemistry 43

      Pages: 3195-3203

  • [Journal Article] Role of putative anion-binding sites in cytoplasmic and extracellular channels of Natronomonas pharaonis halorhodopsin

    • Author(s)
      M.Sato et al.
    • Journal Title

      Biochemistry (in press)

URL: 

Published: 2006-07-12   Modified: 2016-04-21  

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