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2004 Fiscal Year Annual Research Report

DNA合成酵素新規分子種選択的阻害物質の探索・分子設計とケミカルノックアウト解析

Research Project

Project/Area Number 16710161
Research InstitutionKobe Gakuin University

Principal Investigator

水品 善之  神戸学院大学, 栄養学部, 助教授 (20307705)

KeywordsDNAポリメラーゼ / 酵素特異的阻害剤 / ジペプチドアルコール / L-homoserylaminoethanol / L-aspartatylaminoethanol / クルクミン / ケミカルノックアウト / 分子設計
Research Abstract

タバコ培養細胞のメタノール抽出液にDNA合成酵素ε(DNAポリメラーゼε、polε)選択的阻害活性があったので、4本のイオン交換カラムクロマトグラフィーを用いて、阻害物質を完全精製した。
1.polε選択的阻害物質、L-homoserylaminoethanol
完全精製された物質の構造解析(NMR,MS)を行った結果、本物質は新規のジペプチドアルコール、L-homoserylaminoethanol (L-Hse-Gly-ol)であった。哺乳動物由来のpolのうち、特にpolεを選択的に阻害した(IC_<50>=43.6μg/ml)。本物質の天然型であるL-体と非天然型のD-体を化学合成して、天然物と阻害の強さ及び酵素選択性を調査した結果、合成品は天然物と同様にpolεを選択的に阻害した(IC_<50>:L-体42.0μg/ml、D-体41.5μg/ml)。本物質は、ヒト由来だけでなく、ショウジョウバエ由来ならびに出芽酵母由来のpolεを阻害した。また、kinetics解析から本物質の阻害様式は鋳型DNA及びヌクレオチドに対して非拮抗阻害であった。
2.polα選択的阻害物質、L-aspartatylaminoehanol
ジペプチドアルコールのアミノ酸部分を変換した各種化合物30種類以上を化学合成して、pol分子種に対する選択性を調査した。その結果、L-aspartatylaminoethanol (L-Asp-Gly-ol)がpolαを最も強く阻害することを見出した(IC_<50>11.5μg/ml)。polα阻害に必須なジペプチドアルコールの構造は次の(1)〜(4)のとおりであると考察できた。今後の分子設計に役立つ情報を提供することができた。(1).N端は遊離のアミノ基である (2).C端はカルボキシル基が望ましい (3).炭素数は5〜6で直鎖である (4).L-体・D-体はどちらでもよい
その他、近年発見された新規なpolであるpolλは、核のDNA修復と組換えを担っていると考えられている。カレー粉やたくあんの黄色色素であるフェノール化合物「クルクミン」がpolλだけを特異的に阻害することを見出した。クルクミンには抗酸化活性の他にも血管新生抑制活性や抗炎症活性などが知られている。polλがこれらの活性に関与していることが示唆されて興味深い。

  • Research Products

    (28 results)

All 2005 2004

All Journal Article (24 results) Patent(Industrial Property Rights) (4 results)

  • [Journal Article] Dipeptide alcohol-based inhibitors of eukaryotic DNA polymerase α2005

    • Author(s)
      Isoko Kuriyama et al.
    • Journal Title

      Bioorg.Med.Chem. 13

      Pages: 2187-2196

  • [Journal Article] Three-dimensional structural analysis of the binding site of two inhibitors, nervonic acid and lithocholic acid, of DNA polymerase beta and DNA topoisomerase2005

    • Author(s)
      Yoshiyuki Mizushina et al.
    • Journal Title

      Cur.Comp.-Aided Drug Design 1

      Pages: 79-91

  • [Journal Article] Inhibition of DNA polymerase λ suppresses 12-O-tetradecanoylphorbol-13-acetate-induced inflammation2005

    • Author(s)
      Yoshiyuki Mizushina et al.
    • Journal Title

      Cur.Med.Chem. (印刷中)

  • [Journal Article] Systematic synthesis of procyanidin B1/B2 3-O-gallate series, and their abilitv of DPPH radical scavenging activity and inhibitory activity of DNA poly2005

    • Author(s)
      Akiko Saito et al.
    • Journal Title

      Bioorg.Med.Chem. (印刷中)

  • [Journal Article] Microwave roasting effects on the oxidative stability of oils and molecular species of triacyl glycerols in the kernels of pumpkin (Cucurbita spp.) seeds2005

    • Author(s)
      Yoshiyuki Mizushina et al.
    • Journal Title

      J.Food Comp.Anal. (印刷中)

  • [Journal Article] Structural analysis of epolactaene derivatives as DNA polymerase inhibitors and anti-inflammatory compounds2005

    • Author(s)
      Yoshiyuki Mizushina et al.
    • Journal Title

      Int.J.Mol.Med. (印刷中)

  • [Journal Article] Inhibitory effects of glycolipids fraction from spinach on mammalian DNA polymerase activity and human cancer cell proliferation.2005

    • Author(s)
      Isoko Kuriyama et al.
    • Journal Title

      Nutr.Biochem. (印刷中)

  • [Journal Article] L-homoserylaminoethanol, a novel dipeptide alcohol inhibitor of eukayotic DNA polymerase from a plant cultured cells, Nicotina tabacum L.2004

    • Author(s)
      Isoko Kuriyama et al.
    • Journal Title

      Bioorg.Med.Chem. 12・5

      Pages: 957-962

  • [Journal Article] Mechanism of cell cycle arrest by sulfoquinovosyl monoacylglycerol with a C18-saturated fatty acid (C18-SQMG).2004

    • Author(s)
      Chikako Murakami et al.
    • Journal Title

      Biochem.Pharmacol. 67・7

      Pages: 1373-1380

  • [Journal Article] A novel DNA topoisomerase inhibitor : dehydroebriconic acid, one of the lanostane-type triterpene acids from Poria cocos.2004

    • Author(s)
      Yoshiyuki Mizushina et al.
    • Journal Title

      Cancer Sci. 95・4

      Pages: 354-360

  • [Journal Article] Structure-activity relationships of epolactaene analogs as DNA polymerase inhibitors2004

    • Author(s)
      Kouji Kuramochi et al.
    • Journal Title

      Bioorg.Med.Chem. 12・9

      Pages: 1983-1989

  • [Journal Article] Pseudodeflectusin, a novel isochroman derivative from Aspergillus pseudodefectus a parasite of the sea weed, Sargassum fusiform, as a selective human2004

    • Author(s)
      Akitsu Ogawa et al.
    • Journal Title

      Bioorg.Med.Chem.Lett. 14・13

      Pages: 3539-3543

  • [Journal Article] Total synthesis of dehydroaltenusin2004

    • Author(s)
      Shinji Kamisuki et al.
    • Journal Title

      Tetrahedron 60

      Pages: 5695-5700

  • [Journal Article] Anti-angiogenic activity of quercetin and its derivatives2004

    • Author(s)
      Kiminori Matsubara et al.
    • Journal Title

      Lett.Drug Design Discov. 1・3

      Pages: 329-333

  • [Journal Article] Structural relationship of lithocholic acid derivatives binding to the N-terminal 8 kDa domain of DNA polymerase β.2004

    • Author(s)
      Yoshiyuki Mizushina et al.
    • Journal Title

      Biochemistry 43・33

      Pages: 10669-10677

  • [Journal Article] The effects of dehydroaltenusin, a novel mammalian DNA polymerase a inhibitor on cell proliferation and cell cycle progression2004

    • Author(s)
      Chikako Murakami-Nakai et al.
    • Journal Title

      Biochim.Biophys.Acta 1674・2

      Pages: 193-199

  • [Journal Article] Precise structural elucidation of dehydroaltenusin, a specific inhibitor of DNA polymerase α2004

    • Author(s)
      Shinji Kamisuki et al.
    • Journal Title

      Bioorg.Med.Chem. 12・20

      Pages: 5355-5359

  • [Journal Article] Inhibitory action of conjugated C18-fatty acids on DNA polymerases and DNA topoisomerases2004

    • Author(s)
      Yoshiyuki Mizushina et al.
    • Journal Title

      Lipids 39・10

      Pages: 977-983

  • [Journal Article] Synthetic sulfonolipids deduced from sulfonoquinovosyl diacylglycerols of sea urchin reduces hepatic ischemia-reperfusion injury in rats2004

    • Author(s)
      Tetsuhiro Tsumura et al.
    • Journal Title

      Transplant.Proc. 36・7

      Pages: 1965-1969

  • [Journal Article] Stereoselective synthesis of procyanidin B3-3-O-gallate and 3,3"-di-O-gallate, and their abilities as antioxidant and DNA polymerase inhibitor2004

    • Author(s)
      Akiko Saito et al.
    • Journal Title

      Tetrahedron 60

      Pages: 12043-12049

  • [Journal Article] Novel topoisomerase I and II inhibitors, parameritannins A-2 and A-3, are selective human cancer cytotoxins2004

    • Author(s)
      Chikako Murakami-Nakai et al.
    • Journal Title

      Int.J.Pharmacol. 1・3

      Pages: 138-151

  • [Journal Article] Effect of DNA polymerase inhibitory and antitumor activities of lipase-hydrolyzed glycolipids fractionsfrom spinach2004

    • Author(s)
      Naoki Maeda et al.
    • Journal Title

      J.Nutr.Biochem. 16・2

      Pages: 121-128

  • [Journal Article] Inhibitory effect of conjugated eicosapentaenoic acid on human DNA topoisonerase I and II2004

    • Author(s)
      Yuko Yonezawa et al.
    • Journal Title

      Arch.Biochem.Biophys. 435・1

      Pages: 197-206

  • [Journal Article] Fatty acid distributions of triacyl glycerols and phospholipids in peanuts seeds (Arachis hypogaea L.) following microwave treatment2004

    • Author(s)
      Hiromi Yoshida et al.
    • Journal Title

      J.Food Comp.Anal. 18

      Pages: 3-14

  • [Patent(Industrial Property Rights)] DNA合成酵素阻害剤、DNAトポイソメラーゼ阻害剤 ヒト血管新生抑制剤2004

    • Inventor(s)
      松原 主典, 水品 善之, 棚橋 孝雄
    • Industrial Property Rights Holder
      白鶴酒造株式会社
    • Industrial Property Number
      特願2004-116994
    • Filing Date
      2004-04-12
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 新規イソクロマン化合物とその抗がん剤等への利用2004

    • Inventor(s)
      水品 善之, 小川 あきつ, 菅原二
    • Industrial Property Rights Holder
      日本化薬株式会社
    • Industrial Property Number
      特願2004-117323 特願2004-123491
    • Filing Date
      2004-04-12
  • [Patent(Industrial Property Rights)] DNA合成酵素阻害組成物、DNAトポイソメラーゼ阻害組成物 テロメラ2004

    • Inventor(s)
      水品 善之, 吉田 弘美, 長谷川 義和
    • Industrial Property Rights Holder
      株式会社帝和エンジニアリ
    • Industrial Property Number
      特願2004-243618
    • Filing Date
      2004-08-24
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 糖脂質含有組成物、その用途およびその製造方法2004

    • Inventor(s)
      水品 善之, 羽田 尚彦, 吉田弘美
    • Industrial Property Rights Holder
      水品 善之
    • Industrial Property Number
      PCT/JP2004/13432
    • Filing Date
      2004-09-14

URL: 

Published: 2006-07-12   Modified: 2016-04-21  

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