2005 Fiscal Year Annual Research Report
新しい糖鎖機能の構造学的解明を目指した糖鎖認識Fbox蛋白質のX線結晶構造解析
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16770072
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| Research Institution | Nagoya University |
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Principal Investigator |
水島 恒裕 名古屋大学, 大学院・工学研究科, 助手 (90362269)
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| Keywords | ユビキチン / 糖鎖 / 蛋白質分解 / SCFユビキチンリガーゼ |
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| Research Abstract |
ユビキチン(Ub)-プロテアソーム蛋白質分解経路は生体内において細胞周期の制御や蛋白質の品質管理の役割を担っており、蛋白質を特異的に分解する非常に高度に制御された反応系である。この反応系においてユビキチンチガーゼSCF^<Fbs1>は小胞体内の異常蛋白質の細胞外分泌や細胞内蓄積を防止するためのシステムである小胞体関連分解において、小胞体から細胞質に逆行輸送された折りたたみ異常糖蛋白質を認識し分解シグナルユビキチンを付加する酵素である。
本研究はこれまでに立体構造を決定した糖鎖認識サブユニットFbs1以外の糖鎖認識サブユニットFbs2、FBG3、Fbx30の構造解析を目指し糖鎖認識とその機能の解明を目指したものであり、これらの蛋白質はそれぞれ糖蛋白質の認識特異性や一次構造が異なっている。そして、これまでの研究よりFbs2、FBG3、Fbx30ではFbs1とは異なり基質認識ドメインでの構造解析は蛋白質が不溶性になるなどの問題でうまく行かなかったため、ドメインの構造解析ではなく複合体として共発現させることで精製蛋白質を得た。そして、Skp1-FBG3複合体では複数のカラムクロマトグラフィーにより精製し、さまざまな条件で結晶化を行うことにより結晶が生成した。この結晶を用いたX線回折実験では結晶が小さく質も十分ではなかったため立体構造決定に必要なデータを収集することができなかった。現在、Skp1-FBG3複合体のX線結晶構造解析を目指し結晶化及び精製条件の検討を行っている。
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[Journal Article] The Crystal structure of human Atg4b, a processing and de-conjugating enzyme for autophagosome-forming modifiers.2006
Author(s)
Kumanomidou T, Mizushima T, Komatsu M, Suzuki A, Tanida I, Sou YS, Ueno T, Kominami E, Tanaka K, Yamane T
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Journal Title
Journal of Molecular Biology 355(4)
Pages: 612-618
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