2004 Fiscal Year Annual Research Report
TLRシグナル伝達を決定するTIRドメイン間の相互作用の立体構造学的研究
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16770079
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| Research Institution | Yokohama City University |
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Principal Investigator |
杤尾 豪人 横浜市立大学, 大学院・総合理学研究科, 助手 (70336593)
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| Keywords | 自然免疫 / MyD88 / Toll様受容体 / NMR |
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| Research Abstract |
本研究では、自然免疫機構の分子生物学的及び立体構造学的解明を目指し、MyD88の蛋白立体構造及び機能の解析を行なっている。
溶液NMRで立体構造決定を行なうために、^<13>C,^<15>Nで標識したMyD88 TIRドメインを調製した。この試料を用い、各種多核多次元核磁気共鳴(NMR)測定を行なった。現在までに、MyD88 TIRドメイン内の各^1H,^<13>C,^<15>N核の化学シフトの帰属を90%完了した。これらのデータと各種三次元NOESY測定から得られる距離情報から、MyD88 TIRドメインの二次構造要素を決定した。その結果は、既に構造が解かれているTLR1やTLR2のTIRドメインと良く一致しているが、ループ部分の長さなどに差異が見られた。現在、これらのデータを合わせて、立体構造計算を行なっている。
本研究では、MyD88に結合し、自然免疫系のシグナル伝達経路を決定づける各種蛋白質とMyD88 TIRの相互作用解析も行なう。現在、MyD88 TIRドメインと相互作用が指摘されている蛋白質のうち、TLR1、TLR2、IL-18Rβ、TIRAPについて全長またはTIRドメインの大量調製に成功している。現在、in vitro結合実験を行なっている。
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[Journal Article] Structure of the UBA Domain of Dsk2p in Complex with Ubiquitin : Molecular Determinants for Ubiquitin Recognition.2005
Author(s)
Ohno, A., Jee J.G., Fujiwara, K., Tenno, T., Goda, N., Tochio, H., Kobayashi, H., Hiroaki, H., Shirakawa, M.
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Journal Title
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[Journal Article] Structure of the ubiquitin-interacting motif of S5a bound to the ubiquitin-like domain of HR23B.2004
Author(s)
Fujiwara K, Tenno T, Sugasawa K, Jee JG, Ohki I, Kojima C, Tochio H, Hiroaki H, Hanaoka F, Shirakawa M.
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Journal Title
Journal of Biological Chemistry 279,6
Pages: 4760-4767
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[Journal Article] Structural basis for distinct roles of Lys63- and Lys48-linked polyubiquitin chains.2004
Author(s)
Tenno, T., Fujiwara, K., Tochio, H., Iwai, K., Morita, E.H., Hayashi, H., Murata, S., Hiroaki, H., Sato, M., Tanaka, K., Shirakawa, M.
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Journal Title
Genes to Cells 9
Pages: 865-875
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[Journal Article] High-throughput construction method of expression vector of peptides for NMR study suited for isotopic labeling.2004
Author(s)
Tenno, T., Goda, N., Tateishi, Y., Tochio, H., Mishima, M., Hayashi, H., Shirakawa, M., Hiroaki, H.
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Journal Title
Protein Eng Des Sel 17
Pages: 305-314
