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2004 Fiscal Year Annual Research Report

Gel‐phaseNMR法の開発と膜蛋白質への応用

Research Project

Project/Area Number 16770116
Research InstitutionNara Institute of Science and Technology

Principal Investigator

児嶋 長次郎  奈良先端科学技術大学院大学, バイオサイエンス研究科, 助教授 (50333563)

KeywordsNMR / 樹脂固定化 / 相互作用 / 立体構造 / 膜タンパク質
Research Abstract

本研究では溶液NMRを用いたGel-phaseにおける蛋白質の立体構造解析法を確立し、膜蛋白質へ応用することを目指している。具体的には、溶液NMRによるGel-phase蛋白質の構造解析法の開発、可溶性向上を目指した融合蛋白質(可溶化タグ)の選択と溶液条件下における構造解析可能性の検討、無細胞蛋白質合成系を用いた可溶化タグ付加膜蛋白質の大量調製法の検討、界面活性剤共存下でのGel-phase NMRの膜蛋白質への応用を行う。本年度の実施実績は以下の通りである。
可溶性向上を目指した融合蛋白質(可溶化タグ)の選択と溶液条件下における構造解析可能性の検討、および、無細胞蛋白質合成系を用いた可溶化タグ付加膜蛋白質の大量調製法の検討については、光回避シグナルを伝える古細菌由来2回膜貫通型蛋白質pHtrIIについて、加茂直樹教授(北大薬)の協力を得て大腸菌を用いた大量発現系によるNMR試料の調製を行った。また、河野俊之チームリーダー(三菱化学生命研)の協力を得て、4種(TRX、GST、GFP、MBP)の可溶化タグ融合蛋白質として小麦胚芽無細胞蛋白質合成系によるpHtrIIの大量調製を行った。またこれらの中で溶液中やGel-phaseでの解析に最適なサンプル調製法を検討した。
界面活性剤共存下でのGel-phase NMRの膜蛋白質への応用については、OGがGSTを変性させてしまうことを見いだした。またDMについても高濃度条件下ではGSTを変性させてしまうことがわかった。

  • Research Products

    (5 results)

All 2004

All Journal Article (5 results)

  • [Journal Article] Functional roles of the metal ion at the A9/G10.1 site in hammerhead ribozymes2004

    • Author(s)
      Y.Tanaka
    • Journal Title

      J.Am.Chem.Soc. 126

      Pages: 744-752

  • [Journal Article] Structure of the ubiquitin-interacting motif of S5a bound to the ubiquitin-like domain of HR23B2004

    • Author(s)
      K.Fujiwara
    • Journal Title

      J.Biol.Chem. 279

      Pages: 4760-4767

  • [Journal Article] New sequential-assignment routes of nucleic acid NMR signals using a [5'-13C]-labeled DNA dodecamer2004

    • Author(s)
      E.Kawashima
    • Journal Title

      Nucleosides Nucleotides Nucleic Acids 23

      Pages: 255-262

  • [Journal Article] Paramagnetic NMR study of Cu2+-IDA complex localization on a protein surface and its application to elucidate long distance information2004

    • Author(s)
      M.Nomura
    • Journal Title

      FEBS Lett. 566

      Pages: 157-161

  • [Journal Article] Solution NMR study of DNA recognition mechanism of IRF4 protein2004

    • Author(s)
      I.Ishizaki
    • Journal Title

      Nucleic Acids Res.Suppl. 4

      Pages: 105-106

URL: 

Published: 2006-07-12   Modified: 2016-04-21  

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