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2005 Fiscal Year Annual Research Report

核・オルガネラコンソーシアムによる真核細胞の構築原理の研究

Research Project

Project/Area Number 16GS0304
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

田中 寛  東京大学, 分子細胞生物学研究所, 助教授 (60222113)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 佐藤 直樹  東京大学, 大学院総合文化研究科, 教授 (40154075)
野崎 久義  東京大学, 大学院理学系研究科, 助教授 (40250104)
河村 富士夫  立教大学, 理学部, 教授 (10126039)
KeywordsCyanidioschyzon / organelle / chloroplast / mitochondria / genome analysis / red algae / symbiosis / cell cycle
Research Abstract

1.ジャーファーメンターを用いた同調培養系により、細胞周期における葉緑体・ミトコンドリア・核ゲノム複製の時期を検討した。その結果、細胞周期の開始直後に葉緑体ゲノム、ミトコンドリアゲノムがこの順に複製されること。その後で真核細胞の通常のS期が開始されることを明らかにした。従って、核のG1/Sチェックポイントとは別個に、オルガネラが固有の複製チェックポイントを持つことが考えられた。
2.5'MPSS法により、網羅的な転写開始点の同定を行った。また、High throughputな酵母ツーハイブリッドスクリーン系を構築し、蛋白質間相互作用の大規模解析を開始した。
3.シゾンのオルガネラ局在DNAポリメラーゼを2種類同定した。核様体構成タンパク質として,HUと亜硫酸還元酵素の機能分担を示した。また,新しい同調培養系を開発し,DNAポリメラーゼ遺伝子を含む40遺伝子の遺伝子発現プロファイリングを,光制御と細胞周期を区別した形で行うことに成功した。
4.シゾンの80Sリボソームの単離法を確立し、現在プロテオーム解析を行う一方、オルガネラリボソームの単離法についても検討を行っている。また、葉緑体23S rRNAが断片化していることを示唆する結果を得た。シゾンのtRNA^<Pro>の配列を再検討した結果、Dアームにイントロンを持つことを明らかにした。また、tRNA^<Ala>など3種のtRNAに関して、アンチコドン1文字目がイノシンに修飾されていることを示した。
5.Rodriguez-Ezpeleta et al. (2005,Curr.Biol.)は143個の核遺伝子を系統解析し,高い信頼度で一次共生植物3群の単系統性を示したが,使用する遺伝子と生物群に関して問題があると思われたので,進化速度の遅い26遺伝子を選択し,ハプト藻とミドリムシ藻のESTデータを加えて再解析した。その結果,一次共生植物3群の強い単系統性は支持されなかった。一方、核コードのシアノバクテリア由来遺伝子で解析した結果に紅色系統の2次共生藻類クリプト藻類を加えて解析した結果、紅藻の二次共生が二回起きたことが推測された。

  • Research Products

    (21 results)

All 2006 2005

All Journal Article (17 results) Book (4 results)

  • [Journal Article] Growth phase-dependent activation of nitrogen-related genes by a control network of group 2 sigma factors in a cyan bacterium2006

    • Author(s)
      Sousuke Imamura, 3名
    • Journal Title

      J. Biol. Chem. 281

      Pages: 2668-2675

  • [Journal Article] Morphology, molecular phylogeny,and taxonomy of Nitella comptonii(Charales,Characeae).2006

    • Author(s)
      Sakayama, H, 他4名
    • Journal Title

      Phycologia (印刷中)

  • [Journal Article] Morphology, molecular phylogeny and taxonomy of two new species of Pleodorina(Volvoceae,Chlorophyceae).2006

    • Author(s)
      Nozaki, H, 2名
    • Journal Title

      J. Phycol. (印刷中)

  • [Journal Article] Morphology and molecular phylogeny of Gonium multicoccum (Volvocales,Chlorophyceae)newly found in Japan.2006

    • Author(s)
      Yamada, T.K, 他3名
    • Journal Title

      J. Jpn. Bot. 81(印刷中)

  • [Journal Article] Liberation of zinc-containing L31 (RpmE) from ribosomes by its paralogous gene product, YtiA in Bacillus subtilis.2006

    • Author(s)
      Akanuma, G, 他4名
    • Journal Title

      J. Bacteriol. 188

      Pages: 2715-2720

  • [Journal Article] Construction of B. subtilis strains carrying the transcriptional bgaB fusion with promoter region of each rrn operon and their differential transcription during spore development.2006

    • Author(s)
      Koga, K, 7名
    • Journal Title

      J. Gen. Appl. Microbiol. (印刷中)

  • [Journal Article] Construction and characterization of Bacillus subtilis deletion mutants lacking the prophage 2-trnS region.2006

    • Author(s)
      Akanuma, G, 他5名
    • Journal Title

      FEMS Microbiol. Lett. (印刷中)

  • [Journal Article] Microarray profiling of plastid gene expression in a unicellular red alga, Cyanidioschyzon merolae2005

    • Author(s)
      Ayumi Minoda, 他5名
    • Journal Title

      Plant Mol.Biol. 59

      Pages: 375-385

  • [Journal Article] A Switch in RNA Polymerase Usage Mediated by tRNA^<Glu> During Chloroplast Development2005

    • Author(s)
      Mitsumasa Hanaoka, 他4名
    • Journal Title

      EMBO Rep. 6

      Pages: 545-550

  • [Journal Article] Identification of Pam A as a PII-binding membrane protein important in nitrogen-related and sugar-catabolic gene expression in Synechocystis sp.PCC 68032005

    • Author(s)
      Takashi Osanai, 他3名
    • Journal Title

      J. Biol. Chem. 280

      Pages: 34684-34690

  • [Journal Article] Positive regulation of sugar catabolic pathways in the cyanobacterium Synechocystis sp.PCC 6803 by the group 2 sigma factor SigE2005

    • Author(s)
      Takashi Osanai, 他8名
    • Journal Title

      J. Biol. Chem. 280

      Pages: 30653-30659

  • [Journal Article] Specific function of a plastid sigma factor for ndhF gene transcription2005

    • Author(s)
      Jean-Jacques Favory, 他6名
    • Journal Title

      Nucleic Acids Res. 33

      Pages: 5991-5999

  • [Journal Article] Bacterial luciferase activity and the intracellular redox pool in Escherichia coli2005

    • Author(s)
      K.Koga, 他3名
    • Journal Title

      Mol. Genet. Genomics 274

      Pages: 180-188

  • [Journal Article] Mass identification of chloroplast of endosymbiont origin by phylogenetic based on organism-optimized homologous protein groups2005

    • Author(s)
      Sato.N, 他3名
    • Journal Title

      Genome Informatics 16

      Pages: 56-68

  • [Journal Article] Two species of Chlorogonium(Volvocales, Chlorophyceae)from Japan2005

    • Author(s)
      Nakada, T他2名
    • Journal Title

      J. Jpn. Bot. 80

      Pages: 197-207

  • [Journal Article] Morphology and sexual reproduction of Carteria palmata sp.nov.belonging to the Carteria group I sensu Lembi(Chlorophyceae,Volvocales).2005

    • Author(s)
      Suda, S, 2名
    • Journal Title

      Phycologia 44

      Pages: 596-607

  • [Journal Article] A. new scenario of plastid evolution : primary plastid end symbiosis before the divergence of the"Plantae"ememded.2005

    • Author(s)
      Nozaki, H
    • Journal Title

      J.Plant Res. 118

      Pages: 247-255

  • [Book] 微生物の形態・分類、11.藻類、応用微生物学第二版(清水昌, 城之内末冶 編)2006

    • Author(s)
      野崎久義
    • Total Pages
      5
    • Publisher
      文永堂出版
  • [Book] 葉緑体の転写装置.蛋白質核酸酵素増刊号「二層膜オルガネラの遺伝学」(林純一, 杉山康雄, 坂本亘, 田中寛, 正木春彦)2005

    • Author(s)
      田中 寛
    • Total Pages
      5
    • Publisher
      共立出版
  • [Book] 色素体ゲノムの構造・複製と動的な核様体構造の可視化. 蛋白質核酸酵素増刊号「二層膜オルガネラの遺伝学」(林純一, 杉山康雄, 坂本亘, 田中寛, 正木春彦)2005

    • Author(s)
      佐藤直樹
    • Total Pages
      5
    • Publisher
      共立出版
  • [Book] 葉緑体の進化-単純統性と二次共生-. 蛋白質核酸酵素増刊号「二層膜オルガネラの遺伝学」(林純一, 杉山康雄, 坂本亘, 田中寛, 正木春彦)2005

    • Author(s)
      野崎久義
    • Total Pages
      5
    • Publisher
      共立出版

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Published: 2008-05-08   Modified: 2016-04-21  

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