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2006 Fiscal Year Annual Research Report

核・オルガネラコンソーシアムによる真核細胞の構築原理の研究

Research Project

Project/Area Number 16GS0304
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

田中 寛  東京大学, 分子細胞生物学研究所, 助教授 (60222113)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 佐藤 直樹  東京大学, 大学院総合文化研究科, 教授 (40154075)
野崎 久義  東京大学, 大学院理学系研究科, 助教授 (40250104)
河村 富士夫  立教大学, 理学部, 教授 (10126039)
KeywordsCyanidioschyzon / organelle / chloroplast / mitochondria / genome analysis / red algae / symbiosis / cell cycle
Research Abstract

1.シゾン細胞周期において、ミトコンドリア・葉緑体ゲノムの複製は核ゲノムに先んじて起こる。本年度の解析で、真核細胞一般にG1/S期の移行に関わるサイクリン依存キナーゼ(CDK)の活性化は、オルガネラゲノム複製の後の起こることが明らかになった。また、CDKを特異的阻害剤で阻害してもオルガネラゲノム複製は阻害されず、核複製のみが阻害された。従って、オルガネラゲノム複製はCDK活性とは無関係であり、むしろCDK活性化の前提となることが示唆された。
2.細胞周期にわたる核・オルガネラ遺伝子の発現について、全ての遺伝子を網羅したマイクロアレイ解析を進め、遺伝子発現間の相関解析を行った。
3.窒素欠乏に応答した転写活性化に関与する転写因子MYB1を同定し、この蛋白質が窒素飢餓条件で核内に蓄積すること。窒素飢餓誘導性遺伝子のプロモーター領域に結合することを示した。
4.シゾン細胞における外来遺伝子の一過的発現について、実験条件を確立した。
5.シゾンの脂質合成系では、緑色植物の葉緑体にある脂肪酸不飽和化酵素群がすべて存在しないことが明らかになった。また葉緑体脂質の合成には、葉緑体で作られる飽和脂肪酸に加え、小胞体による不飽和化を経て葉緑体に戻った不飽和脂肪酸も必要とされるという新しい経路が働いていることがわかった。
6.シゾンの80S、および70Sリボソームの単離法を確立し、得られたサンプルをRHFR二次元電気泳動にて展開することにより、80Sリボソームからは64スポット、70Sリボソームからは51スポットのリボソームタンパク質の検出に成功した。また、80Sに関しては3種のスポット(L4、L8、S3Ae)を同定した。
7.2006年6月ころから大量公開されたESTデータ並びにゲノムデータを用いて真核生物の系統関係を進化速度の遅い19遺伝子を用いて系統解析した。その結果、紅色植物とエクスカバータ類(主に無色の鞭毛性の原生生物)の近縁性が示唆され、従来言われていた緑色植物と紅色植物の近縁性が否定された。また、エクスカバータの核にコードされているシアノバクテリア由来の遺伝子の解析を実施し、紅色植物との類似性が明らかになった。

  • Research Products

    (28 results)

All 2007 2006

All Journal Article (25 results) Book (3 results)

  • [Journal Article] Centrosome dynamics in the primitive redd alga Cyanidioschyzon merolae2007

    • Author(s)
      Shinichiro Maruyama
    • Journal Title

      Plant J. 49

      Pages: 1122-1129

  • [Journal Article] Interference expression at levels of the transcript and protein among group 1, 2, and 3 sigma factor genes in a cyanobacterium2007

    • Author(s)
      Masae Matsui
    • Journal Title

      Microbes Environ. (印刷中)

  • [Journal Article] Cooperation of group 2 sigma factors, SigD and SigE for light-induced transcription in a cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 68032007

    • Author(s)
      Yoshimura, T.
    • Journal Title

      FEBS Lett. 581

      Pages: 1495-1500

  • [Journal Article] Sugar catabolism regulated by light- and nitrogen-status in the cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 68032007

    • Author(s)
      Takashi Osanai
    • Journal Title

      Photochem. Photobiol. Sci. (印刷中)

  • [Journal Article] The chloroplast ribosome releasing factor 1 (RF1) is essential for chloroplast development2007

    • Author(s)
      Reiko Motohashi
    • Journal Title

      Plant Mol. Biol. (印刷中)

  • [Journal Article] Mitochondrial genome of the moss Physcomitrella patens sheds new light on the mitochondrial evolution in land plants2007

    • Author(s)
      K.Terasawa
    • Journal Title

      Mol. Biol. Evol. 24

      Pages: 699-709

  • [Journal Article] DNA-binding and partial nucleoid localization of the chloroplast stromal enzyme ferredoxin : sulfite reductase2007

    • Author(s)
      K.Sekine
    • Journal Title

      FEBS J. 274

      Pages: 2054-2069

  • [Journal Article] Genomic and biochemical analysis of lipid biosynthesis in the unicellular rhodophyte Cyanidioschyzon merolae : lack of plastidic desaturation pathway results in mixed pathway of galactolipid synthesis2007

    • Author(s)
      N.Sato
    • Journal Title

      Eukaryotic Cell (印刷中)

  • [Journal Article] A taxonomic study of Hafniomonas (Chlorophyceae) based on a comparative examination of cultured materiall.2007

    • Author(s)
      Nakada, T.
    • Journal Title

      J. Phycol. 43

      Pages: 397-411

  • [Journal Article] Reevaluation of three Chlorogonium (Volvocales, Chlorophyceae) species based on 18S ribosomal RNA gene phylogeny2007

    • Author(s)
      Nakada, T.
    • Journal Title

      Eur. J. Phycol. 42(印刷中)

  • [Journal Article] Sequence and intranuclear location of the extrachromosomal rDNA plasmid of the amoebo-fiagellate Naegleria gruberi.2007

    • Author(s)
      Maruyama, S.
    • Journal Title

      J. Euk. Mikrobiol. 54(印刷中)

  • [Journal Article] A fail-safe system for the ribosome under zinc-limiting conditions in Bacillus subtilis2007

    • Author(s)
      Natori, Y.
    • Journal Title

      Mol. Microbiol. 63

      Pages: 294-307

  • [Journal Article] Cytoplasmic localization of the single glutamine synthetase in a unicellular red alga, Cyanidioschyzon merolae 10D2006

    • Author(s)
      Masaru Terashita
    • Journal Title

      Biosci. Biotechnol. Biochem. 70

      Pages: 2313-2315

  • [Journal Article] The cyanobacterial principal sigma factor region 1.1 is involved in DNA binding in the free form and in transcription activity as holoenzyme2006

    • Author(s)
      Masahiko Imashimizu
    • Journal Title

      FEBS Lett. 580

      Pages: 3439-3444

  • [Journal Article] Light-responsive transcriptional regulation of the suf promoters involved in Fe-S cluster biogenesis in a cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 68032006

    • Author(s)
      Asako Seki
    • Journal Title

      FEBS Lett. 580

      Pages: 5044-5048

  • [Journal Article] Nitrogen control of sugar catabolic gene expression in Synechocystis sp. PCC 68032006

    • Author(s)
      Takashi Osanai
    • Journal Title

      DNA Res. 13

      Pages: 185-195

  • [Journal Article] Histidine kinases play important roles in the perception and signal transduction of hydrogen peroxide in the cyanobacterium, Synechocystis sp. PCC 68032006

    • Author(s)
      Yu Kanesaki
    • Journal Title

      Plant J. 49

      Pages: 313-324

  • [Journal Article] Signal transduction genes required for heterocyst maturation in Anabaena sp. Strain PCC 71202006

    • Author(s)
      Q.Fan
    • Journal Title

      J. Bacteriol. 188

      Pages: 6688-6693

  • [Journal Article] Mutations in four regulatory genes have interrelated effects on heterocyst maturation in Anabaena sp. Strain PCC 71202006

    • Author(s)
      S.Lechno-Yossef
    • Journal Title

      J. Bacteriol. 188

      Pages: 7387-7395

  • [Journal Article] Males evolved from the dominant isogametic mating type.2006

    • Author(s)
      Nozaki, H.
    • Journal Title

      Curr. Biol. 16

      Pages: R1018-R1020

  • [Journal Article] Morphology and molecular phylogeny of Gonium Multicoccum (Volvocales, Chlorophyceae) newly found in Japan2006

    • Author(s)
      Yamada, T. K.
    • Journal Title

      J. Jpn. Bot. 81

      Pages: 139-147

  • [Journal Article] Morphology, molecular phylogeny and taxonomy of two new species of Pleodorina (Volvoceae, Chlorophyceae).2006

    • Author(s)
      Nozaki, H.
    • Journal Title

      J. Phycol. 42

      Pages: 1082-1080

  • [Journal Article] Species preferentiality of the pollen tube attractant derived from the synergid cell of Torenia fournieri2006

    • Author(s)
      Higashiyama, T.
    • Journal Title

      Plant Physiology 142

      Pages: 481-491

  • [Journal Article] Isolated chloroplast machinery can actively constrict after stretch2006

    • Author(s)
      Yamato Yoshida
    • Journal Title

      Science 313

      Pages: 1435-1438

  • [Journal Article] Proteomics study of the Bacillus subtilis ribosome : Finding of zinc-dependent replacement of ribosomal protein L31 paralogs2006

    • Author(s)
      Nanamiya, H.
    • Journal Title

      J. Gen. Appl. Microbiol. 52

      Pages: 249-258

  • [Book] 植物の比較ゲノム解析、植物の進化(植物細胞工学シリーズ23)2007

    • Author(s)
      佐藤直樹
    • Total Pages
      8
    • Publisher
      秀潤社
  • [Book] Origin and evolution of plastids : Genomic view on the unification and diversity of plastids. In"The Structure and function of plastids"2006

    • Author(s)
      N.Sato
    • Total Pages
      28
    • Publisher
      Springer, Berlin
  • [Book] 新版 植物の細胞を観る実験プロトコール(植物細胞工学シリーズ22)2006

    • Author(s)
      寺澤公宏
    • Total Pages
      7
    • Publisher
      葉緑体核様体と分裂装置の可視化

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Published: 2008-05-08   Modified: 2016-04-21  

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