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2008 Fiscal Year Annual Research Report

生体パターン形成原理の実験的ならびに数理解析的解明

Research Project

Project/Area Number 16GS0307
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

近藤 滋  Osaka University, 大学院・生命機能研究科, 教授 (10252503)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 川上 浩一  国立遺伝学研究所, 個体遺伝研究系・初期発生研究部門, 教授 (70195048)
渡邉 正勝  大阪大学, 大学院・生命機能研究科, 准教授 (90323807)
宮澤 清太  大阪大学, 大学院・生命機能研究科, 助教 (10377905)
Keywordsパターン形成 / 反応拡散 / Turing pattern / ゼブラフィッシュ / 形態形成
Research Abstract

本研究では、Turing波がどのような仕組みで動物の体内に発生するかを解明する目的で、ゼブラフィッシュの縞模様を研究対象選び、縞模様の動態の観察及びモデル化とシミュレーションを行い、細胞レベルでの模様形成原理の解明を目指した。達成できた成果のうち主なものは以下のとおりである。
1)模様を作る色素細胞の皮膚内の存在様態を電顕で解明した。
2)色素細胞のレーザー消去によって起きる模様の動きから、模様はTuring波の性質をもつことを証明した。
3)2種類の色素細胞間の相互作用が、Turing波形成の必要条件を満たすことを示した。
4)皮膚にある色素細胞は互いに排除しあい、近傍の細胞から遠ざかる方向に移動することを発見した。
5)色素細胞のin vitro培養系で、黒-黄色素細胞間の相互作用が、「黒が黄色から逃げ、黄色を黒を追う」という形で観察できる。またその相互作用は、フィロポディア上の突起を介して起きることが観察された。
6)模様の異なる魚類間の雑種において現れる皮膚模様が、反応拡散原理による数式のパラメータを平均したパターンになることを、数理解析と、各地の養殖場で得られたデータを比較することで明らかにした。この事実は、動物の模様の進化に新たな知見を加えた。
7)マウスの皮膚にできる縞模様に関して、反応拡散電離で生ずるBZ波と同様の動態を持つことを証明した。
以上の成果は、模様形成の原理の解明には必須のものである。また、以上の成果により少なくともゼブラフィッシュに関しては、模様がTuring波であることは世界的に認知されるようになった。

  • Research Products

    (37 results)

All 2010 2009 2008 Other

All Journal Article (15 results) (of which Peer Reviewed: 10 results) Presentation (20 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] Efficient transient rescue of hematopoietic mutant phenotypes in zebrafish using Tol2-mediated transgenesis2010

    • Author(s)
      Takeuchi M
    • Journal Title

      Development Growth & Differentiation 52

      Pages: 245-250

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Interactions between zebrafish pigment cells responsible for the generation of Turing patterns2009

    • Author(s)
      Nakamasu A
    • Journal Title

      Proceedings of the National Academy of Sciences 106

      Pages: 8429-8434

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] How animals get their skin patterns : fish pigment pattern as a live Turing wave2009

    • Author(s)
      Kondo S
    • Journal Title

      International Journal of Developmental Biology 53

      Pages: 851-856

  • [Journal Article] Extensive analysis of EST sequences reveals that all cichlid species in Lake Victoria share almost identical transcript sets2009

    • Author(s)
      Kobayashi N
    • Journal Title

      GENE 441

      Pages: 187-191

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The Tol2-mediated Gal4-UAS method for gene and enhancer trapping inzebrafish2009

    • Author(s)
      Asakawa K
    • Journal Title

      Methods 49(3)

      Pages: 275-281

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Analysis of genes and genome by the tol2-mediated gene and enhancer trap methods2009

    • Author(s)
      Urasaki A
    • Journal Title

      Methods in Molecular Biology 546

      Pages: 85-102

  • [Journal Article] Transient and stable transgenesis using tol2 transposon vectors2009

    • Author(s)
      Kikuta H
    • Journal Title

      Methods in Molecular Biology 546

      Pages: 69-84

  • [Journal Article]2009

    • Author(s)
      Kawakami K
    • Journal Title

      Essential zebrafish methods : genetics and genomics(Academic Press)

      Pages: 153-173

  • [Journal Article] Tol2: a versatile gene transfer vector in vertebrates2008

    • Author(s)
      Kawakami K
    • Journal Title

      Genome Biology 8

      Pages: P7

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Melanophores in the stripes of adult zebrafish do not have the nature to gather, but disperse when they have the space to move2008

    • Author(s)
      Takahashi G
    • Journal Title

      Pigment Cell Research 21

      Pages: 677-686

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Theoretical analysis of mechanisms that generate the pigmentation pattern of animals2008

    • Author(s)
      Kondo S
    • Journal Title

      Seminors in Cell and Developmental Biology 20

      Pages: 82-89

  • [Journal Article] Efficient transposition of the Tol2 transposable element from a single-copy donor in zebrafish2008

    • Author(s)
      Urasaki A
    • Journal Title

      Proceedings of the National Academy of Sciences 105

      Pages: 19827-19832

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Transposition of the vertebrate Tol2 transposable element in Drosophila melanogaster2008

    • Author(s)
      Urasaki A
    • Journal Title

      GENE 425

      Pages: 64-68

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Targeted gene expression by the Gal4-UAS system in zebrafish2008

    • Author(s)
      Asakawa K
    • Journal Title

      Development, Growth & Differentiation 59

      Pages: 391-399

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Misty somites, a maternal effect gene identified by transposon-mediated insertional mutagenesis in zebrafish that is essential for the somite boundary maintenance2008

    • Author(s)
      Kotani T
    • Journal Title

      Developmental Biology 316

      Pages: 383-396

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] From gene to function : a quest with a transposon2010

    • Author(s)
      Kawakami K
    • Organizer
      zebrafish 2010 : 11th Australia & New Zealand Workshop
    • Place of Presentation
      シドニー、オーストラリア
    • Year and Date
      20100203-20100205
  • [Presentation] Genetic methods using the Tol2 transposable element in zebrafish2009

    • Author(s)
      Kawakami K
    • Organizer
      International Symposium on Marine Genomics 2009
    • Place of Presentation
      サザンプラザ海邦(沖縄県)
    • Year and Date
      20091215-20091218
  • [Presentation] Botulinum Neurotoxin transgenic zebrafish for dissecting neuronal circuits in vivo and creating novel variants for neurotherapeutics2009

    • Author(s)
      Suster M.L
    • Organizer
      46th Congress of the European Societies of Toxicology
    • Place of Presentation
      ドレズデン、ドイツ
    • Year and Date
      20090913-20090916
  • [Presentation] Transposon-mediated gene trapping, enhancer trapping and insertional mutagenesis2009

    • Author(s)
      Kawakami K
    • Organizer
      The 4th Asia-Oceania Zebrafish Meeting
    • Place of Presentation
      済州島、韓国
    • Year and Date
      20090831-20090902
  • [Presentation] The gene trap approach reveals involvement of mekk3b in the functional blood vessel formation2009

    • Author(s)
      Urasaki A
    • Organizer
      6th European Zebrafish Genetics and Development Meeting
    • Place of Presentation
      ローマ、イタリア
    • Year and Date
      20090715-20090719
  • [Presentation] Functional analysis of zebrafish connexin41.8 for pattern formation2009

    • Author(s)
      渡邉正勝
    • Organizer
      6th European Zebrafish Genetics and Development Meeting
    • Place of Presentation
      ローマ、イタリア
    • Year and Date
      20090715-20090719
  • [Presentation] Tol2-mediated transgenesis in zebrafish and mice2009

    • Author(s)
      Kawakami K
    • Organizer
      Conference on Genome Engineering
    • Place of Presentation
      ミネアポリス、アメリカ
    • Year and Date
      20090625-20090627
  • [Presentation] Turing pattern in the skin of animals2009

    • Author(s)
      近藤滋
    • Organizer
      Gordon Research Conferences
    • Place of Presentation
      ボストン、アメリカ
    • Year and Date
      20090621-20090626
  • [Presentation] Connexin41.8による体表模様の制御2009

    • Author(s)
      渡邉正勝
    • Organizer
      第32回日本分子生物学会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県)
    • Year and Date
      2009-12-10
  • [Presentation] コネキシンはゼブラフィッシュのストライプ幅も規定する2009

    • Author(s)
      渡邉正勝
    • Organizer
      日本動物学会第80回大会2009静岡
    • Place of Presentation
      グランシップ(静岡県)
    • Year and Date
      2009-09-19
  • [Presentation] Connexin41.8 contributes melanophore development in zebrafish2009

    • Author(s)
      渡邉正勝
    • Organizer
      第36回国際生理学会世界大会
    • Place of Presentation
      京都国際会館(京都府)
    • Year and Date
      2009-07-30
  • [Presentation] Recent advances in the Tol2 transposon technology in zebrafish2009

    • Author(s)
      Kawakami K
    • Organizer
      3rd Strategic Conference of Zebrafish Investigators
    • Place of Presentation
      モントレー、アメリカ
    • Year and Date
      2009-01-24
  • [Presentation] Interaction among the zebrafish pigment cells that makes the stripe pattern2008

    • Author(s)
      近藤滋
    • Organizer
      IPCC-IMRC2008
    • Place of Presentation
      ロイトン札幌(北海道)
    • Year and Date
      20080507-20080512
  • [Presentation] Pigment Pattern Formation in Zebrafish2008

    • Author(s)
      近藤滋
    • Organizer
      第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(兵庫県)
    • Year and Date
      2008-12-10
  • [Presentation] Multi-Cell Simulations of Gastrulation and Somitogenesis in Chick2008

    • Author(s)
      近藤滋
    • Organizer
      Mathematical Biosciences Institute Workshop
    • Place of Presentation
      コロンバス、アメリカ
    • Year and Date
      2008-11-18
  • [Presentation] Cell-cell interaction network that generates the skin pattern of zebrafish2008

    • Author(s)
      近藤滋
    • Organizer
      Frontier in Development Biology meeting
    • Place of Presentation
      ジアン、フランス
    • Year and Date
      2008-09-16
  • [Presentation] イオンの波がゼブラフィッシュのストライプ形成に重要である2008

    • Author(s)
      近藤滋
    • Organizer
      日本動物学会第79回大会
    • Place of Presentation
      福岡大学(福岡県)
    • Year and Date
      2008-09-05
  • [Presentation] Zebras did not get the stripes, but lost the uniform color2008

    • Author(s)
      近藤滋
    • Organizer
      Society for Mathematical Biology Conference
    • Place of Presentation
      トロント、カナダ
    • Year and Date
      2008-08-01
  • [Presentation] Transposon-mediated gene trapping and enhancer trapping in zebrafish2008

    • Author(s)
      Kawakami K
    • Organizer
      6th Annual International Conference on Transposition and Animal Biotechnology
    • Place of Presentation
      ベルリン、ドイツ
    • Year and Date
      2008-06-20
  • [Presentation] Interaction Network of Pigment Cells Generates the Stripes in Animal's Skin2008

    • Author(s)
      近藤滋
    • Organizer
      2nd International Systems Radiation Biology Workshop
    • Place of Presentation
      ワシントン、アメリカ
    • Year and Date
      2008-01-25
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.fbs.osaka-u.ac.jp/labs/skondo/

  • [Remarks]

    • URL

      http://kawakami.lab.nig.ac.jp

URL: 

Published: 2011-06-16   Modified: 2016-04-21  

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