2020 Fiscal Year Annual Research Report
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16H02481
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
石川 俊平 東京大学, 大学院医学系研究科(医学部), 教授 (50418638)
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| Project Period (FY) |
2016-04-01 – 2021-03-31
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| Keywords | ゲノム創薬 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
がん細胞はそれ単独での生存は難しく、生体内では常に周囲の間質細胞からの支持シグナルを受け、また逆にがん細胞自身がシグナルを出して生存に適した間質細胞を誘導している。申請者はこれまでにマウスに移植したヒトがん細胞のトランスクリプトームシーケンスから、マウス・ヒト由来の配列の分離によりがん細胞・間質各細胞由来のシグナルとその相互作用のプロファイルを行う技術を確立してきた。本申請ではシングルセルトランスクリプトーム解析などの技術を加えることにより、多様ながん種についてがん細胞と間質細胞との相互作用の全体像とその多様性をゲノムレベルでの解明を目的とする。
令和２年度はこれまで進めてきたシングルセルのトランスクリプトームプロファイルにより多くの細胞種間における相互作用を体系的に解析する技術を用い、間質の多い腫瘍組織よりシングルセルを安定して分離して調整する技術を用いてデータを取得を行なった。これらのデータからクラスタリング等により細胞腫を特定し、腫瘍内の多細胞間インターラクションを適切に次元を圧縮して解釈を行なった。その結果腫瘍組織のホメオスタシスに強く寄与していると思われる相互作用など介入ターゲットを複数同定することが可能であった。
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| Research Progress Status |
令和2年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
令和2年度が最終年度であるため、記入しない。
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[Journal Article] High levels of human epididymis protein 4 mRNA and protein expression are associated with chemoresistance and a poor prognosis in pancreatic cancer.2021
Author(s)
Ohkuma R, Yada E, Ishikawa S, Komura D, Kubota Y, Hamada K, Horiike A, Ishiguro T, Hirasawa Y, Ariizumi H, Shida M, Watanabe M, Onoue R, Ando K, Tsurutani J, Yoshimura K, Sasada T, Aoki T, Murakami M, Norose T, Ohike N, Takimoto M, Kobayashi S, Tsunoda T, Wada S.
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Journal Title
Int J Oncol.
Volume: 58
Pages: 57-69
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Focal adhesion ribonucleoprotein complex proteins are major humoral cancer antigens and targets in autoimmune diseases.2020
Author(s)
Atsumi S, Katoh H, Komura D, Hashimoto I, Furuya G, Koda H, Konishi H, Suzuki R, Yamamoto A, Yuba S, Abe H, Rino Y, Oshima T, Ushiku T, Fukayama M, Seto Y, Ishikawa S.
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Journal Title
Commun Biol.
Volume: 3
Pages: 588
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] High expression levels of polymeric immunoglobulin receptor are correlated with chemoresistance and poor prognosis in pancreatic cancer.2020
Author(s)
Ohkuma R, Yada E, Ishikawa S, Komura D, Kubota Y, Hamada K, Horiike A, Ishiguro T, Hirasawa Y, Ariizumi H, Shida M, Watanabe M, Onoue R, Ando K, Tsurutani J, Yoshimura K, Sasada T, Aoki T, Murakami M, Norose T, Ohike N, Takimoto M, Kobayashi S, Tsunoda T, Wada S.
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Journal Title
Oncol Rep.
Volume: 80
Pages: 3810-3819
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Defined lifestyle and germline factors predispose Asian populations to gastric cancer.2020
Author(s)
Suzuki A, Katoh H, Komura D, Kakiuchi M, Tagashira A, Yamamoto S, Tatsuno K, Ueda H, Nagae G, Fukuda S, Umeda T, Totoki Y, Abe H, Ushiku T, Matsuura T, Sakai E, Ohshima T, Nomura S, Seto Y, Shibata T, Rino Y, Nakajima A, Fukayama M, Ishikawa S, Aburatani H.
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Journal Title
Sci Adv.
Volume: 6
Pages: eaav9778
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Presentation] 肉腫患者由来ゼノグラフトのRNA発現解析.2020
Author(s)
大津敬, 笠島理加, 鷲見公太, 廣島幸彦, 片山琴絵, 清水英悟, 山口類, 井元清哉, 宮野悟, 河村大輔, 石川俊平, 横瀬智之, 比留間徹, & 宮城洋平.
Organizer
The 79th Annual Meeting of the Japanese Cancer Association
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[Presentation] Human epididymis protein 4の発現が膵臓癌における抗癌剤耐性・予後不良に与える影響.2020
Author(s)
大熊遼太朗, 矢田英理香, 石川俊平, 河村大輔, 久保田祐太郎, 濱田和幸, 堀池篤, 安藤清宏, 鶴谷純司, 吉村清, 笹田哲朗, 村上雅彦, 瀧本雅文, 角田卓也, & 和田聡.
Organizer
The 79th Annual Meeting of the Japanese Cancer Association
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