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2017 Fiscal Year Annual Research Report

自然免疫に関わる分子群の構造基盤の構築

Research Project

Project/Area Number 16H02494
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

清水 敏之  東京大学, 大学院薬学系研究科(薬学部), 教授 (30273858)

Project Period (FY) 2016-04-01 – 2019-03-31
Keywords自然免疫 / TLR / X線結晶解析
Outline of Annual Research Achievements

自然免疫は病原体の感染をいち早く察知し炎症反応を引き起こす一方、後に続く獲得免疫を誘導するという極めて重要な役割を果たす。自然免疫における病原体センサーとしては、細胞質局在型のNod様受容体 (NLR;Nod-like receptor)と膜結合型のToll様受容体 (TLR;Toll-like receptor)に大別される。Toll様受容体TLR7およびTLR8はウイルスや死細胞に由来するRNAを認識して自然免疫反応をひき起こすが,過剰応答の場合は、全身性エリテマトーデスなどの自己免疫疾患に関係することが指摘されている。このためTLR7/8を活性化する化合物(アゴニスト)と同様に阻害する化合物の開発も望まれている。今回我々は,ヒトのTLR8の細胞外ドメインの全長につきC末端にプロテインAタグを付加したコンストラクトを用い,糖鎖の生合成の阻害剤であるキフネンシンの存在のもとショウジョウバエS2細胞において発現させ,高純度の精製試料を得た。TLR8と,それぞれのアンタゴニストとを蒸気拡散平衡法により共結晶化し,X線結晶構造解析により分解能2.4, 2.3Åで構造を決定した。これにより,阻害剤によるTLR8の阻害機構を原子レベルで明らかにした.これまでの研究によりTLR8はリガンドが結合していない状態でも非活性型の二量体構造をとり、アゴニストが結合するとTLR8二量体が再構成され活性型となることが知られている。今回解析した阻害剤はリガンド非結合型の二量体構造で形成されているポケットに結合し構造を安定化することによって活性型二量体への再構成を防ぐことで阻害効果を発揮することが判明した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

阻害剤との複合体構造解析により、リガンド非結合型二量体にのみ存在するポケットに阻害剤が結合し安定化するというまったくあらたな阻害機構を明らかにしたため。

Strategy for Future Research Activity

TLRに加え、NLRの構造解析に注力する。

  • Research Products

    (8 results)

All 2018 2017 Other

All Journal Article (5 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 5 results) Presentation (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Small-molecule inhibition of TLR8 through stabilization of its resting state2018

    • Author(s)
      Zhang S, Hu Z, Hiromi Tanji H, Jiang S, Das N, Jing Li, Sakaniwa K, Jin J, Bian Y, Ohto U, Shimizu T & Yin H
    • Journal Title

      Nature Chem. Biol.

      Volume: 14 Pages: 58, 64

    • DOI

      10.1038/nchembio.2518.

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] The crystal structure of the AhRR/ARNT heterodimer reveals the structural basis of the repression of AhR-mediated transcription2017

    • Author(s)
      Sakurai S., Shimizu T., Ohto U
    • Journal Title

      J. Biol. Chem.

      Volume: 292 Pages: 17609, 17616

    • DOI

      10.1074/jbc.M117.812974

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Towards a structural understanding of nucleic acid-sensing Toll-like receptors in the innate immune system2017

    • Author(s)
      Zhang Z, Ohto U, Shimizu T
    • Journal Title

      FEBS letters

      Volume: 591 Pages: 3167, 3181

    • DOI

      10.1002/1873-3468.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structural insights into ligand recognition and regulation of nucleic acid-sensing Toll-like receptors2017

    • Author(s)
      Shimizu T
    • Journal Title

      Curr. Opi. Struc. Biol.

      Volume: 47 Pages: 52, 59

    • DOI

      10.1016/j.sbi.2017.05.010.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Emerging roles of the processing of nucleic acids and Toll-like receptors in innate immune responses to nucleic acids2017

    • Author(s)
      Miyake K, Shibata T, Ohto U, Shimizu T
    • Journal Title

      J. Leukocyte Biol

      Volume: 101 Pages: 135, 142

    • DOI

      10.1189/jlb.4MR0316-108R.

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 病原体感染を感知するToll様受容体の構造基盤2018

    • Author(s)
      清水敏之
    • Organizer
      日本薬学会 第138年会
  • [Presentation] Structural study of ssRNA sensing TLRs in innate immune system2017

    • Author(s)
      Toshiyuki Shimizu
    • Organizer
      24th Congress and General Assembly of the International Union of Crystallography
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.f.u-tokyo.ac.jp/~kouzou/index.html

URL: 

Published: 2018-12-17  

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