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2017 Fiscal Year Annual Research Report

Transition to multicellularity and evolution of female-male genders based on whole genome data

Research Project

Project/Area Number 16H02518
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

野崎 久義  東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 准教授 (40250104)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 宮城島 進也  国立遺伝学研究所, 遺伝形質研究系, 教授 (00443036)
関本 弘之  日本女子大学, 理学部, 教授 (20281652)
西山 智明  金沢大学, 学際科学実験センター, 助教 (50390688)
Project Period (FY) 2016-04-01 – 2020-03-31
Keywords多細胞化 / 雌雄性の進化 / 性染色体領域 / 群体性ボルボックス目 / 性決定遺伝子 / 全ゲノム解析
Outline of Annual Research Achievements

これまでに我々は多細胞化と性進化のモデル生物群「群体性ボルボックス目」からオス特異的遺伝子“OTOKOGI”(PlestMID)を単離することに成功し(Nozaki et al. 2006, Curr. Biol.16: R1018)、“OTOKOGI”を端としたゲノム解読から卵生殖のボルボックス(Volvox)の雌雄の性染色体(性決定)領域(MT)をゲノム解読し、近縁な同型配偶のクラミドモナス(Chlamydomonas)と比較した (Ferris et al. 2010, Science 328: 351)。その結果、ボルボックスのMTはクラミドモナスの5倍の大きさの1Mbを超える巨大なものであり、その中に13個の雌雄に特異的な新規遺伝子が明らかになり、MTにおけるこれらの進化が同型配偶から雌雄性を獲得する原因となったことが推測された。今回我々は両者の中間的進化段階で同型配偶から異型配偶の進化を橋渡しするヤマギシエラ(Yamagishiella:同型配偶)とユードリナ(Eudorina:異型配偶)の両性の全ゲノム配列を得て、MTの全貌を明らかにした。その結果、ヤマギシエラとユードリナのMT は7-268 kbの小さい領域であり、オス(交配型マイナス)特異的遺伝子はOTOKOGI/MIDだけであった。このことはオス側では1個の性特異的遺伝子だけで異型配偶化が可能であり、卵生殖のボルボックスの段階で新たなる性特異的遺伝子の獲得とMTの拡大が起きたことが推測された(Hamaji et al. 2018, Communications Biology 1: 17)。また、群体性ボルボックス目の祖先形質再構成の解析を実施した結果、多細胞化が有性生殖の進化を促進する傾向にあると示唆された(Hanschen et al. 2018, Am. Nat. 192: E93-E105.)。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

群体性ボルボックス目の全ゲノム比較解析の結果、オス側では1個の性特異的遺伝子だけで異型配偶化が可能であり、卵生殖のボルボックスの段階で新たなる性特異的遺伝子の獲得とMTの拡大が起きたことが推測された(Hamaji et al. 2018, Communications Biology 1: 17)。また、祖先形質再構成の解析を実施した結果、多細胞化が有性生殖の進化を促進する傾向にあると示唆された(Hanschen et al. 2018, Am. Nat. 192: E93-E105.)。

Strategy for Future Research Activity

オス/交配型マイナスの遺伝子MID/OTOKOGIが群体性ボルボックス目の雌雄性獲得前後で機能が変化したことが推測され、本遺伝子の下流遺伝子を探る解析を実施する。

  • Research Products

    (34 results)

All 2018 2017 Other

All Int'l Joint Research (4 results) Journal Article (11 results) (of which Int'l Joint Research: 8 results,  Peer Reviewed: 11 results,  Open Access: 6 results) Presentation (17 results) (of which Int'l Joint Research: 8 results,  Invited: 3 results) Remarks (2 results)

  • [Int'l Joint Research] コンケン大学(タイ)

    • Country Name
      THAILAND
    • Counterpart Institution
      コンケン大学
  • [Int'l Joint Research] 中央研究院(その他の国・地域 台湾)

    • Country Name
      その他の国・地域
    • Counterpart Institution
      中央研究院
  • [Int'l Joint Research] アリゾナ大学/Donald Danforth Plant Science Center/カンサス州立大学(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      アリゾナ大学/Donald Danforth Plant Science Center/カンサス州立大学
  • [Int'l Joint Research] ウィットウォーターズランド大学(南アフリカ)

    • Country Name
      SOUTH AFRICA
    • Counterpart Institution
      ウィットウォーターズランド大学
  • [Journal Article] Ultrastructure of the marine benthic dinoflagellate Plagiodinium belizeanum (Dinophyceae) from the southeast Pacific island of Okinawa, Japan2018

    • Author(s)
      Wakeman Kevin C.、Hoppenrath Mona、Yamaguchi Aika、Gavelis Greg S.、Leander Brian S.、Nozaki Hisayoshi
    • Journal Title

      Phycologia

      Volume: 57 Pages: 209~222

    • DOI

      10.2216/17-43.1

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Anisogamy evolved with a reduced sex-determining region in volvocine green algae2018

    • Author(s)
      Hamaji Takashi、Kawai-Toyooka Hiroko、Uchimura Haruka、Suzuki Masahiro、Noguchi Hideki、Minakuchi Yohei、Toyoda Atsushi、Fujiyama Asao、Miyagishima Shin-ya、Umen James G.、Nozaki Hisayoshi
    • Journal Title

      Communications Biology

      Volume: 1 Pages: 17

    • DOI

      10.1038/s42003-018-0019-5

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Taxonomic revision of Chloromonas nivalis (Volvocales, Chlorophyceae) strains, with the new description of two snow-inhabiting Chloromonas species2018

    • Author(s)
      Matsuzaki Ryo、Nozaki Hisayoshi、Kawachi Masanobu
    • Journal Title

      PLOS ONE

      Volume: 13 Pages: e0193603

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0193603

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Multicellularity Drives the Evolution of Sexual Traits2018

    • Author(s)
      Hanschen Erik R.、Herron Matthew D.、Wiens John J.、Nozaki Hisayoshi、Michod Richard E.
    • Journal Title

      The American Naturalist

      Volume: 192 Pages: E93~E105

    • DOI

      10.1086/698301

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Genetic basis for soma is present in undifferentiated volvocine green algae2017

    • Author(s)
      Grochau-Wright Z. I.、Hanschen E. R.、Ferris P. J.、Hamaji T.、Nozaki H.、Olson B. J. S. C.、Michod R. E.
    • Journal Title

      Journal of Evolutionary Biology

      Volume: 30 Pages: 1205~1218

    • DOI

      10.1111/jeb.13100

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Molecular evolutionary analysis of a gender-limited MID ortholog from the homothallic species Volvox africanus with male and monoecious spheroids2017

    • Author(s)
      Yamamoto Kayoko、Kawai-Toyooka Hiroko、Hamaji Takashi、Tsuchikane Yuki、Mori Toshiyuki、Takahashi Fumio、Sekimoto Hiroyuki、Ferris Patrick J.、Nozaki Hisayoshi
    • Journal Title

      PLOS ONE

      Volume: 12 Pages: e0180313

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0180313

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Acidophilic green algal genome provides insights into adaptation to an acidic environment2017

    • Author(s)
      Hirooka Shunsuke、Hirose Yuu、Kanesaki Yu、Higuchi Sumio、Fujiwara Takayuki、Onuma Ryo、Era Atsuko、Ohbayashi Ryudo、Uzuka Akihiro、Nozaki Hisayoshi、Yoshikawa Hirofumi、Miyagishima Shin-ya
    • Journal Title

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      Volume: 114 Pages: E8304~E8313

    • DOI

      10.1073/pnas.1707072114

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Cell size for commitment to cell division and number of successive cell divisions in multicellular volvocine green algae <i>Tetrabaena socialis</i> and <i>Gonium pectorale</i>2017

    • Author(s)
      JONG Lin Wei、FUJIWARA Takayuki、NOZAKI Hisayoshi、MIYAGISHIMA Shin-ya
    • Journal Title

      Proceedings of the Japan Academy, Series B

      Volume: 93 Pages: 832~840

    • DOI

      10.2183/pjab.93.052

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Evolution of cytokinesis-related protein localization during the emergence of multicellularity in volvocine green algae2017

    • Author(s)
      Arakaki Yoko、Fujiwara Takayuki、Kawai-Toyooka Hiroko、Kawafune Kaoru、Featherston Jonathan、Durand Pierre M.、Miyagishima Shin-ya、Nozaki Hisayoshi
    • Journal Title

      BMC Evolutionary Biology

      Volume: 17 Pages: 243

    • DOI

      10.1186/s12862-017-1091-z

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] The 4-Celled Tetrabaena socialis Nuclear Genome Reveals the Essential Components for Genetic Control of Cell Number at the Origin of Multicellularity in the Volvocine Lineage2017

    • Author(s)
      Featherston Jonathan、Arakaki Yoko、Hanschen Erik R、Ferris Patrick J、Michod Richard E、Olson Bradley J S C、Nozaki Hisayoshi、Durand Pierre M
    • Journal Title

      Molecular Biology and Evolution

      Volume: 35 Pages: 855~870

    • DOI

      10.1093/molbev/msx332

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Repeated evolution and reversibility of self-fertilization in the volvocine green algae*2017

    • Author(s)
      Hanschen Erik R.、Herron Matthew D.、Wiens John J.、Nozaki Hisayoshi、Michod Richard E.
    • Journal Title

      Evolution

      Volume: 72 Pages: 386~398

    • DOI

      10.1111/evo.13394

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Presentation] 「リング」を去り「性」の研究に賭ける2018

    • Author(s)
      野崎久義
    • Organizer
      第6回生殖若手の会
    • Invited
  • [Presentation] Systematics and evolution of freshwater algae2018

    • Author(s)
      Nozaki, H.
    • Organizer
      Special Seminar, Department of Biology, Faculty of Science, Khon Kaen University
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Volvocine green algae inviting you to 200 MYA time travel for evolution of female-male and muticellularity2018

    • Author(s)
      Nozaki, H.
    • Organizer
      Biology Colloquium hosted by Graduate Students’ Society, Department of Biological Sciences, Faulty of Science, National University of Singapore
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 面状群体を形成するゴニウム(緑藻綱、ボルボックス目)の胚発生の解析2017

    • Author(s)
      山下翔大、野崎久義
    • Organizer
      日本植物形態学会第29回大会
  • [Presentation] ボルボックス系列緑藻の多細胞化とダイナミン様タンパク質DRP1の局在変化2017

    • Author(s)
      新垣陽子、藤原崇之、豊岡博子、川舩かおる、宮城島進也、野崎久義
    • Organizer
      日本植物形態学会第29回大会
  • [Presentation] De novoゲノム配列決定で明らかになったボルボックス科緑藻におけるミトコンドリアDNA形状の進化過程2017

    • Author(s)
      浜地貴志、豊岡博子、豊田敦、水口洋平、鈴木雅大、藤山秋佐夫、野崎久義、 Smith, David Roy
    • Organizer
      日本植物学会第81回大会
  • [Presentation] ボルボックス系列緑藻を用いた異型配偶化の解析:縮小した性決定領域を持つ異型配偶ユードリナ2017

    • Author(s)
      豊岡博子、浜地貴志、内村悠、鈴木雅大、豊田敦、野口英樹、水口洋平、藤山秋佐夫、宮城島進也、野崎久義
    • Organizer
      日本植物学会第81回大会
  • [Presentation] ボルボックス目緑藻テトラバエナの光行動能の検定2017

    • Author(s)
      丹野明日翔、中島昌子、植木紀子、新垣陽子、吉村建二郎、野崎久義、久堀徹、若林憲一
    • Organizer
      日本植物学会第81回大会
  • [Presentation] 比較ゲノム解析による好酸性緑藻の酸性環境への適応機構の解明2017

    • Author(s)
      廣岡俊亮、広瀬侑、兼崎友、樋口澄男、 藤原崇之、大沼亮、恵良厚子、大林龍胆、宇塚明洋、野崎久義、吉川博文、宮城島進也
    • Organizer
      日本植物学会第81回大会
  • [Presentation] 台湾産の Volvox carteri2017

    • Author(s)
      野崎久義、植木紀子、田草川真里、三角修己、Chiang Yin-Ru、Wu Jiunn-Tzong
    • Organizer
      日本植物学会第81回大会
  • [Presentation] ボルボックスの仲間から性と多細胞の進化を探る ~リングを退きフィールドとゲノム解析に賭ける~2017

    • Author(s)
      野崎久義
    • Organizer
      東大理学部 高校生のための冬休み講座 2017
    • Invited
  • [Presentation] Volvox carteri from Taiwan2017

    • Author(s)
      Nozaki, H. Ueki, N., Takusagawa, M., Yamashita, S., Misumi, O., Yin-Ru Chiang, Y.-R. and Wu, J.-T.
    • Organizer
      The Fourth International Volvox Conference
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Multicellularity drives the evolution of sexual traits2017

    • Author(s)
      Hanschen, E., Herron, M. D., Wiens, J. J., Ferris, P. J., Nozaki, H. and Michod, R. E.
    • Organizer
      The Fourth International Volvox Conference
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Cell biological analysis of the embryogenesis in Gonium (Volvocales, Chlorophyta)2017

    • Author(s)
      Yamashita, S., Noga, A., Hirono, M. and Nozaki, H.
    • Organizer
      The Fourth International Volvox Conference
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Anisogamy evolved with the reduced sex-determining region2017

    • Author(s)
      Hamaji, T., Kawai-Toyooka, H., Uchimura, H., Suzuki, M., Noguchi, H., Minakuchi, Y., Toyoda, A., Fujiyama, A., Miyagishima, S., Umen, J. and Nozaki, H.
    • Organizer
      The Fourth International Volvox Conference
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Mating type locus-like regions in the homothallic species Volvox africanus2017

    • Author(s)
      Yamamoto, K., Hamaji, T., Kawai-Toyooka, H., Noguchi, H., Minakuchi, Y., Toyoda, A. and Nozaki, H.
    • Organizer
      The Fourth International Volvox Conference
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Identification and characterization of gamete adhesion factor FUS1 orthologs in isogamous Yamagishiella and anisogamous Eudorina2017

    • Author(s)
      Kawai-Toyooka, H., Hamaji, T., Uchimura, H., Suzuki, M., Noguchi, H., Minakuchi, Y., Toyoda, A., Fujiyama, A., Miyagishima, S. and Nozaki, H.
    • Organizer
      The Fourth International Volvox Conference
    • Int'l Joint Research
  • [Remarks] 最初のオスとメスを生み出した性染色体領域を全ゲノム解読から解明

    • URL

      http://www.s.u-tokyo.ac.jp/ja/info/5786/

  • [Remarks] 多様性起源学研究室ホームページ:ニュース News

    • URL

      http://www.bs.s.u-tokyo.ac.jp/~tayousei/news.html

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Published: 2019-12-27   Modified: 2022-08-26  

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