2018 Fiscal Year Annual Research Report
Plant species and genetic diversity assessment of tropical forests in Southeast Asia
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16H02553
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| Research Institution | Tohoku University |
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Principal Investigator |
陶山 佳久 東北大学, 農学研究科, 准教授 (60282315)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
舘田 英典 九州大学, 理学研究院, 教授 (70216985)
矢原 徹一 九州大学, 理学研究院, 教授 (90158048)
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| Project Period (FY) |
2016-04-01 – 2019-03-31
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| Keywords | 熱帯林 / 生物多様性 / 次世代シーケンシング / ゲノムワイドDNA分析 / MIG-seq法 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
生物多様性ホットスポットである東南アジアの森林を対象として、網羅的（全植物種）かつ包括的（種および遺伝子）生物多様性解析を行う研究を行った。材料として、すでに分担者らが東南アジア各地の森林において収集したDNA分析用試料を利用し、代表者らが開発したゲノムワイドなDNA塩基配列分析法であるMultiplexed ISSR Genotyping by sequencing（MIG-seq）法を用いた分子系統関係の解析を行った。本年度は、昨年度までに実施したクスノキ科、ブナ科に関するMIG-seq解析をさらに進めると同時に、マメ科に関する解析を進めた。その結果、マメ科では「属」がおそらく多系統である場合が多く、「属」内で共有座が十分に確保できない場合が多いことがわかった。そこでITS、rbcL等の葉緑体遺伝子間領域などの複数のDNAバーコード領域を次世代シークエンサーによって同時決定する技術を開発して解析を進めた。具体的には、バーコード配列による系統解析によって近縁なサンプルをグルーピングしたうえでMIG-seq解析を行うという手順を確立した。この方法により、マメ科シタン属では34種中5種が、ハカマカズラ属では43種中10種が、Spatholobus属では29種中10種が新種であることを明らかにした。さらに、東南アジアで特に種数が多いアカネ科ルリミノキ属にこの方法を適用した結果、146種中77種（53%）が新種であることがわかった。これらの結果から、本研究で開発した方法は、種分化が著しいグループの多様性解析に幅広く適用できることが確認された。クスノキ科ではITSにもとづく解析結果を論文として発表し、MIG-seqにもとづく論文を投稿中である。またブナ科では、マテバシイ属の新種を発表した。
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| Research Progress Status |
平成30年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
平成30年度が最終年度であるため、記入しない。
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[Journal Article] Inferring the demographic history of Japanese cedar, Cryptomeria japonica, using amplicon sequencing2019
Author(s)
Natsuki Moriguchi, Kentaro Uchiyama, Ryutaro Miyagi, Etsuko Moritsuka, Aya Takahashi, Koichiro Tamura, Yoshihiko Tsumura, Kosuke M. Teshima, Hidenori Tachida, Junko Kusumi
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Journal Title
Heredity
Volume: 印刷中
Pages: 印刷中
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Two new species of Neolitsea (Lauraceae), N. kraduengensis from Thailand and N. vuquangensis from Vietnam and an analysis of their phylogenetic positions using ITS sequences2018
Author(s)
Chika Mitsuyuki, Shuichiro Tagane, Nguyen Van Ngoc, Hoang Thi Binh, Somran Suddee, Sukid Rueangruea, Hironori Toyama, Keiko Mase, Chen-Jui Yang, Akiyo Naiki, Tetsukazu Yahara
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Journal Title
Acta Phytotaxonomica et Geobotanica
Volume: 69
Pages: 161-173
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
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[Book] A Picture Guide for the Flora of Bidoup Nui Ba National Park I: Mt. Langbian2019
Author(s)
Ai Nagahama, Shuichiro Tagane, Nguyen Van Ngoc, Binh Hoang Thi, Truong Quang Cuong, Hironori Toyama, Hidetoshi Nagamasu, Kojin Tsuchiya, Zhang Meng, Thu Nguyen Thi Anh, Nguyen Cuong Thinh, Yoshihisa Suyama, Ayumi Matsuo, Shun Hirota, Etsuko Moritsuka, Akiyo Naiki, Le Van Son, Pham Huu Nhan, Tetsukazu Yahara
Total Pages
134
Publisher
Center for Asian Conservation Ecology, Kyushu University
