2018 Fiscal Year Annual Research Report
Identification and functional analyses of host factors are associated with bovine leukemia virus proviral load by genome-wide association study and genome-wide transcriptional profiling
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16H02590
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| Research Institution | Institute of Physical and Chemical Research |
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Principal Investigator |
間 陽子 国立研究開発法人理化学研究所, 開拓研究本部, 研究員 (50182994)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
水谷 哲也 東京農工大学, 農学部, 教授 (70281681)
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| Project Period (FY) |
2016-04-01 – 2019-03-31
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| Keywords | 牛白血病ウイルス / プロウイルス量 / 新規宿主因子 / 発症と感染初期 / MMR遺伝子 / RNA-seq / BLV一過性発現細胞 / BLV安定発現細胞 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
ゲノムワイド相関解析により、プロウイルス量の指標となる新規宿主側一塩基多型（SNP）マーカー3種類を同定し、得られた低および高プロウイルス量に関連するSNPマーカー保有牛にBLVを実験感染させ、RNA-seqを用いたトランスクリプトーム解析を実施し、906個の正および1328個の負の制御を受けている遺伝子を同定した。中でも有意差が最も高かったMMR遺伝子に注目し、BLVとの関係性を解明した。非感染牛および感染牛のRNAを抽出し、リアルタイムPCRを用いてMMR遺伝子の発現を解析すると同時にDNAを用いてプロウイルス量を測定した。その結果、7つのMMR遺伝子の内、MSH2、MSH3およびUNG遺伝子の発現量とプロウイルス量との間で相関性が認められた。次に、発症とMMR遺伝子発現の関連性を解析するためEBL発症牛のMMR遺伝子発現を解析したところ、EBL発症牛のMSH2、MSH6およびPMS2遺伝子の発現が低下傾向を示した。さらに、BLV感染性分子クローンをHeLaおよびPK15細胞に導入後、MMR遺伝子の発現を評価したところ、72時間後にHeLa細胞ではMSH2とEXO1遺伝子、PK15細胞では全てのMMR遺伝子発現が有意に増加した。BLV安定発現細胞株でも同様の結果が得られた。今回の結果からin vivoでの感染実験牛、野外牛、BLV一過的発現細胞およびBLV安定発現細胞において、BLVの発現がMMR遺伝子の発現に影響を与えることが立証された。以上から、BLV感染時に、感染細胞のDNAを恒常的に維持するため、MMR遺伝子発現を増加させる可能性が示唆された。一方、EBL発症牛ではMSH2、MSH6およびPMS2遺伝子の発現は低下傾向を示した。このことから、EBLの発症時にはDNAの恒常性を低下させるため、MMR遺伝子発現を低下させる可能性が示唆された。
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| Research Progress Status |
平成30年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
平成30年度が最終年度であるため、記入しない。
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[Journal Article] Variations in the viral genome and biological properties of bovine leukemia virus wild-type strains2018
Author(s)
Hironobu Murakami, Jumpei Uchiyama, Chihiro Suzuki, Sae Nikaido, Kaho Shibuya, Reiichiro Sato, Yosuke Maeda, Michiko Tomioka, Shin-nosuke Takeshima, Hajime Kato, Masahiro Sakaguchi, Hirishi Sentsui, Yoko Aida, Kenji Tsukamoto
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Journal Title
Virus Research
Volume: 253
Pages: 103-111
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Identification of human immunodeficiency virus type-1 Gag-TSG101 interaction inhibitors by high-throughput screening2018
Author(s)
Lowela Siarot, Nopporn Chutiwitoonchai, Hirotaka Sato, Hao Chang, Hironori Sato, Masayuki,Fujino,Tsutomu Murakami,Toshihiro Aono, Eiichi Kodama, Kazumichi Kuroda, Masami Takei, Yoko Aida
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Journal Title
Biochemical and Biophysical Research Communications
Volume: 503
Pages: 2970-2976
DOI
Peer Reviewed
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