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2016 Fiscal Year Annual Research Report

イオンビーム生物影響の原因となる二本鎖切断末端に関する研究

Research Project

Project/Area Number 16H02959
Research InstitutionNational Institutes for Quantum and Radiological Science and Technology

Principal Investigator

鹿園 直哉  国立研究開発法人量子科学技術研究開発機構, 関西光科学研究所 量子生命科学研究部, 部長(定常) (10354961)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 佐藤 達彦  国立研究開発法人日本原子力研究開発機構, 原子力科学研究部門 原子力基礎工学研究センター, 研究主幹 (30354707)
森林 健悟  国立研究開発法人量子科学技術研究開発機構, 関西光科学研究所 量子生命科学研究部, 上席研究員(定常) (70354975)
赤松 憲  国立研究開発法人量子科学技術研究開発機構, 関西光科学研究所 量子生命科学研究部, 上席研究員(定常) (70360401)
甲斐 健師  国立研究開発法人日本原子力研究開発機構, 原子力科学研究部門 原子力基礎工学研究センター, 研究副主幹 (70403037)
Project Period (FY) 2016-04-01 – 2021-03-31
Keywords二本鎖切断 / イオンビーム / エネルギー付与
Outline of Annual Research Achievements

放射線生物影響に関与する最も重要なDNA損傷として二本鎖切断(DSB)が精力的に研究されてきた。しかしながら、放射線による「生物影響に関与するDSB」の分子的実体は分かっておらず、放射線、特にイオンビーム生物影響メカニズムの詳細は不明な点が多い。本研究課題ではイオンビームによるDSB生成機構、DSB末端の化学構造、さらには化学構造に依存する生物作用を明らかにすることを目的に研究を進める。本年度は、DSB生成機構及びDSB末端の化学構造調べる研究を進めた。
DSB生成機構における研究においては、イオンビーム照射後に分子の電離によって生じる分子イオンが作り出す電場が二次電子をどのように束縛するのかを計算し、またその時生じる電場を表す簡易式の導出を行った。また、本研究課題が目指す粒子・重イオン輸送計算コード(PHITS)を利用した放射線DNA損傷評価のために、電子飛跡構造コードを開発し、PHITSに実装した。これにより、これまで困難であった空間ナノスケールにおける低エネルギー電子の微視的挙動がPHITSでも計算可能になった。これらの結果により、イオンビーム照射直後のエネルギー付与の詳細(サブnmレベルでの高精度な線量分布)を明らかにする準備が整った。
DSB末端の化学構造を調べる研究では、イオンビーム、及び、対照となるガンマ線を照射することを可能とする照射ホルダーを作成し、細胞内と同程度のラジカル捕捉能を持つ水溶液中におけるプラスミドDNAに生じるDSBの収率を調べる実験に着手した。一方、DSB末端構造を調べるため、非相同末端結合に関与するKuタンパク質がDSB末端を認識・結合する程度を調べる実験系を立ち上げた。今年度は、Ku-DNA結合実験における実験パラメーターを決定した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

イオンビーム照射後のエネルギー付与に関して、シミュレーションを高精度化することができた。また、線質の異なる放射線を用いてDSB収率を測定する実験、及び、修復酵素によるDSB末端認識を調べる実験系をも確立することができた。研究はおおむね順調に進展していると考えている。

Strategy for Future Research Activity

今後は各種イオンビームの軌道付近のnmオーダーの動径線量分布を表す近似式を作成し、その近似式を粒子・重イオン輸送計算コード であるPHITSに組み込んで、線量分布計算コードを発展させる。また、電子線の計算コードを基盤として、イオンビーム照射後の電離・励起の空間分布、及び、収率の計算を行う。これらの計算を進めることによりDNAへの直接作用を推定する。将来的には間接作用も考慮し、最終的にはDSB末端構造の予測を行うことを目指す。
一方、DSB末端構造の実験による解析においては、様々な線質の放射線を用いて、塩基損傷、脱塩基部位、鎖切断等のDNA損傷収率を調べ、その情報をもとにDSB末端構造を推定する。また放射線誘発DSB末端に対するKuタンパク質の結合の程度を調べることにより、DSB末端構造の修復特性に関する知見を得る。

  • Research Products

    (18 results)

All 2017 2016

All Journal Article (9 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 6 results) Presentation (9 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 1 results)

  • [Journal Article] Radiation-induced clustered DNA lesions: Repair and mutagenesis2017

    • Author(s)
      E. Sage, N. Shikazono
    • Journal Title

      Free Radic. Biol. Med.

      Volume: 107 Pages: 125-135

    • DOI

      10.1016/j.freeradbiomed.2016.12.008

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] 高エネルギー電子衝突により水中で生成された2次電子の動的挙動2017

    • Author(s)
      甲斐健師、横谷明徳、藤井健太郎、渡邊立子
    • Journal Title

      陽電子科学

      Volume: 8 Pages: 11-17

  • [Journal Article] Effect of track potentials on the movement of secondary electrons due to irradiation of heavy ions2017

    • Author(s)
      K. Moribayashi
    • Journal Title

      J. Phys. Soc. Jpn

      Volume: 86 Pages: 024301/1-5

    • DOI

      10.7566/JPSJ.86.024301

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Simple formulas for heavy-ion-irradiation-induced electric field2017

    • Author(s)
      K. Moribayashi
    • Journal Title

      Nucl. Inst. Meth. B

      Volume: 印刷中 Pages: 印刷中

    • DOI

      10.1080/09553002.2016.1195933

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A polymerization-based method to construct a plasmid containing clustered DNA damage and a mismatch2016

    • Author(s)
      M. Takahashi, K. Akamatsu and N. Shikazono
    • Journal Title

      Analytical Biochemistry

      Volume: 93 Pages: 295-302

    • DOI

      10.1080/09553002.2017.1239849

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Dynamic Behavior of Secondary Electrons in Liquid Water at the Earliest Stage upon Irradiation: Implications for DNA Damage Localization Mechanism2016

    • Author(s)
      T. Kai, A. Yokoya, M. Ukai, K. Fujii and R. Watanabe
    • Journal Title

      J. Phys. Chem. A.

      Volume: 120 Pages: 8228-8233

    • DOI

      10.1021/acs.jpca.6b05929

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Deceleration processes of secondary electrons produced by a high-energy Auger electron in a biological context2016

    • Author(s)
      T. Kai, A. Yokoya, M. Ukai, K. Fujii,and R. Watanabe
    • Journal Title

      Int. J. Radiat. Biol.

      Volume: 92 Pages: 654-659

    • DOI

      10.1080/09553002.2016.1195933

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 放射線物理化学過程に関する最近の進展(前編)2016

    • Author(s)
      甲斐健師、横谷明徳、藤井健太郎、渡邊立子
    • Journal Title

      放射線化学

      Volume: 101 Pages: 3-11

  • [Journal Article] 放射線物理化学過程に関する最近の進展(中編)2016

    • Author(s)
      甲斐健師、横谷明徳、藤井健太郎、渡邊立子
    • Journal Title

      放射線化学

      Volume: 102 Pages: 49-56

  • [Presentation] 凝縮相における低エネルギー電子の微視的放射線作用の研究 ― 電子輸送計算法の開発 ―2017

    • Author(s)
      甲斐健師、小川達彦、安部晋一郎、佐藤達彦
    • Organizer
      第64回応用物理学会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜市、神奈川県)
    • Year and Date
      2017-03-14 – 2017-03-17
  • [Presentation] 動的モンテカルロ法を用いた凝縮相における低速電子の微視的挙動2017

    • Author(s)
      甲斐健師
    • Organizer
      第31回固体飛跡検出器研究会
    • Place of Presentation
      量子科学技術研究開発機構(木津川市、京都府)
    • Year and Date
      2017-03-09 – 2017-03-10
    • Invited
  • [Presentation] 高強度場科学の分野からの重イオンビーム科学研究へのアプローチ2017

    • Author(s)
      森林健悟
    • Organizer
      レーザー学会学術講演会第37回年次大会
    • Place of Presentation
      徳島大学(徳島市、徳島県)
    • Year and Date
      2017-01-07 – 2017-01-09
  • [Presentation] 重イオンビームが生成するナノメータサイズプラズマの粒子シミュレーション2016

    • Author(s)
      森林健悟
    • Organizer
      プラズマ科学における分光計測の高度化と原子分子過程研究の新展開研究会
    • Place of Presentation
      核融合研究所(土岐市、岐阜県)
    • Year and Date
      2016-12-20 – 2016-12-22
  • [Presentation] クラスターDNA損傷及びミスマッチを有するプラスミドの作製法の開発2016

    • Author(s)
      高橋桃子、赤松憲、鹿園直哉
    • Organizer
      第59回日本放射線影響学会
    • Place of Presentation
      JMSアステールプラザ(広島市、広島県)
    • Year and Date
      2016-10-26 – 2016-10-28
  • [Presentation] 蛍光異方性を利用した放射線DNA損傷の局在性評価法の開発―細胞核内クラスター損傷の観察に向けた基礎検討―2016

    • Author(s)
      赤松憲、鹿園直哉
    • Organizer
      第59回日本放射線影響学会
    • Place of Presentation
      JMSアステールプラザ(広島市、広島県)
    • Year and Date
      2016-10-26 – 2016-10-28
  • [Presentation] 電子線トラックエンドの放射線最初期過程の研究2016

    • Author(s)
      甲斐健師、横谷明徳、鵜飼正敏、藤井健太郎、渡邊立子、米谷佳晃、樋川智洋、佐藤達彦
    • Organizer
      第59回放射線化学討論会
    • Place of Presentation
      量子科学技術研究開発機構(高崎市、群馬県)
    • Year and Date
      2016-09-20 – 2016-09-22
  • [Presentation] Simulation study for the effect of track potentials on the movement of secondary electrons due to highly charged ion irradiation2016

    • Author(s)
      K. Moribayashi
    • Organizer
      18th international conference; physics of highly charged ions
    • Place of Presentation
      Jan Kochanowski University(Kielce、ポーランド)
    • Year and Date
      2016-09-11 – 2016-09-18
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Aiming to measure cluster DNA damage, proposal for experiment systems using XFEL and laser driven ion beams2016

    • Author(s)
      K. Moribayashi
    • Organizer
      The 15th International Conference on X-Ray Lasers
    • Place of Presentation
      Nara Kasugano International Forum(奈良市、奈良県)
    • Year and Date
      2016-05-22 – 2016-05-27
    • Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2018-01-16  

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