2018 Fiscal Year Annual Research Report
Study for practical use of the technique of salvaging the genetic information existing in the rice phytolith
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16H03104
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| Research Institution | University of Miyazaki |
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Principal Investigator |
宇田津 徹朗 宮崎大学, 農学部, 教授 (00253807)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
田中 克典 弘前大学, 農学生命科学部, 助教 (00450213)
田崎 博之 愛媛大学, 埋蔵文化財調査室, 教授 (30155064)
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| Project Period (FY) |
2016-04-01 – 2019-03-31
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| Keywords | イネの多様性評価 / プラント・オパール / 遺伝情報の抽出 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究は、残留性に優れた植物遺存体の１つであるプラント・オパールに内在する遺伝情報を取り出し活用する技術を実用ステージまで引き上げ、稲作分野の研究における一般的手法として確立することを目指している。最終年度にあたる平成30年度の取り組みと成果をまとめると以下のとおりである。
【取組1：土壌からのプラント・オパール抽出についての実用手法の構築と検証】これまでに構築した抽出手法は、一定の純度のプラント・オパールを抽出することにおいては問題ないものであったが、実験者の負担という点では、抽出工程に手作業の部分がかなり存在していた。そのため、比較試料を準備する際に、複数の実験者によって抽出を実施すると、熟練度の違いから試料の内容（純度）に差異が生じることが懸念された。そこで、最終年度では、手作業の工程を汎用機器による処理工程に置換することで、抽出プラント・オパールの純度を維持し、実験者の負担を軽減した抽出工程を構築することができた。
【比較試料として堆積環境・土性などが異なる生産遺構土壌の確保】愛媛県東予市に所在する古墳時代後期の扇状地扇央に位置する黒ボク土を作土とする水田跡において、堆積相分析で明らかとなった水田構造に基づき分析試料の採取を行い、比較分析試料の充実をはかることができた。
【取組3：プラント・オパールに由来するDNA 分析技術の普及性の向上の検討】国内遺跡の水田土壌から抽出したプラント・オパールについて、DNAの抽出とその分析を実施した。その結果、イネのプラント・オパールにおけるDNAの遺存状況を明らかにすることができた。現在のプラント・オパールからの遺伝情報の抽出方法については、葉緑体ゲノム領域 (rps16 intron1)と核ゲノムの第6染色体領域 (IDJ6)についてPCR増幅したところ、5回の反復によってDNAが復元可能であるという結果となり、抽出方法の普及性に見通しを得ることができた。
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| Research Progress Status |
平成30年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
平成30年度が最終年度であるため、記入しない。
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Research Products
(6 results)
