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2017 Fiscal Year Annual Research Report

生細胞内での部位特異的なエピゲノム操作法の確立

Research Project

Project/Area Number 16H03281
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

今西 未来  京都大学, 化学研究所, 講師 (80362391)

Project Period (FY) 2016-04-01 – 2019-03-31
Keywords核酸修飾 / TALEタンパク質
Outline of Annual Research Achievements

メチル化シトシン(5mC)は転写の調節に重要で、発生や分化、発癌などにも関わっていることが知られている。また、RNAのアデニン塩基のメチル化も、発生や分化、発癌などにおける重要性が明らかになりつつある。したがって、エピゲノム状態、エピトランスクリプトーム状態を検出し、人為的に制御することは、生命現象の理解にとって重要である。近年、ゲノム編集技術の飛躍的発展により、DNA配列特異的な遺伝情報の書き換え、遺伝子発現制御など、ゲノムそのものを標的とした生細胞内での機能制御が可能になった。しかし、現状では、DNAの修飾状態依存的に細胞内で機能を発揮させることは困難で、メチル化状態に応じてDNAに結合できるDNA認識分子が求められている。H29年度は、スクリーニングから得られたメチル化シトシン認識能を持Transcription Activator-like Effector (TALE)ユニット、および天然に存在する種々のTALEユニットに関して、複数のメチル化配列の同時検出能を評価した。スクリーニングで得られたユニットは、メチル化シトシンの同時認識を達成するには結合力が不十分であったため、塩基認識ループのアミノ酸数を変えて、更なるスクリーニングを行なったが、現状ではより識別能、結合力の高いユニットは得られていない。一方、天然に存在する非メチル化シトシン結合TALEユニットはメチル化状態識別能が高く、細胞内での制御にも利用可能であることが示唆された。また、RNAの修飾制御に関しては、RNAアデニンのメチル化状態を簡便に判別できるin vitroでのメチル化検出法を考案し、RNA修飾制御系構築のための評価系を構築することができた。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

DNAメチル化状態の識別に利用できるTALEタンパク質の基本性質に関して情報を得ることができ、また、RNAメチル化の評価系も作製することができ、次年度に繋がる結果を得たため。

Strategy for Future Research Activity

これまでに得られた知見に基づき、細胞内で核酸のメチル化状態を検出、操作できるシステムの構築を行う予定である。

  • Research Products

    (11 results)

All 2018 2017 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (8 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results,  Invited: 2 results)

  • [Int'l Joint Research] Shandong Agricultural University(China)

    • Country Name
      China
    • Counterpart Institution
      Shandong Agricultural University
  • [Journal Article] Nested PUF Proteins: Extending Target RNA Elements for Gene Regulation2018

    • Author(s)
      Kouki Shinoda, Shogo Tsuji, Shiroh Futaki, Miki Imanishi
    • Journal Title

      Chembiochem

      Volume: 19 Pages: 171-176

    • DOI

      10.1002/cbic.201700458

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Detection of N6-Methyladenosine Based on the Methyl-Sensitivity of MazF RNA endonuclease2017

    • Author(s)
      Miki Imanishi, Shogo Tsuji, Akiyo Suda, Shiroh Futaki
    • Journal Title

      Chem Commun

      Volume: 53 Pages: 12930-12933

    • DOI

      10.1039/c7cc07699a

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 遺伝子発現を制御する人工タンパク質の創製2018

    • Author(s)
      今西未来
    • Organizer
      日本化学会第98春季年会
    • Invited
  • [Presentation] Extending RNA sequence recognition of PUF proteins toward RNA sequence-specific regulation2017

    • Author(s)
      Kouki Shinoda, Miki Imanishi, Shiroh Futaki
    • Organizer
      RNA2017 The 22nd Annual Meeting of the RNA Society
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Enzymatic detection of activities of m6A RNA methyltransferases and demetylases2017

    • Author(s)
      Miki Imanishi, Akiyo Suda, Shiroh Futaki
    • Organizer
      RNA2017 The 22nd Annual Meeting of the RNA Society
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Development of a simple strategy to detect activities of N6-methyladenosine regulatory enzymes2017

    • Author(s)
      Miki Imanishi, Akiyo Suda, Shiroh Futaki
    • Organizer
      ISBC2017 The International Symposium on Biofunctional Chemistry
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Engineering of nested PUF proteins with 16 RNA-binding repeats for regulation of endogenous RNA2017

    • Author(s)
      Kouki Shinoda, Miki Imanishi, Shiroh Futaki
    • Organizer
      ISBC2017 The International Symposium on Biofunctional Chemistry
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] RNA結合タンパク質PUFの認識塩基数拡張と内在RNAの制御2017

    • Author(s)
      篠田 昂樹、今西 未来、二木 史朗
    • Organizer
      ConBio2017生命科学系合同年次大会
  • [Presentation] 配列選択的RNA結合蛋白質PUFの結合領域の拡張と遺伝子発現制御2017

    • Author(s)
      今西 未来、篠田 昂樹、辻 将吾、二木 史朗
    • Organizer
      第11回バイオ関連化学シンポジウム
  • [Presentation] Engineering of nucleic acid binding proteins toward manipulation of gene expression2017

    • Author(s)
      Miki Imanishi
    • Organizer
      日中若手女性研究者会議
    • Int'l Joint Research / Invited

URL: 

Published: 2018-12-17  

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