• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2018 Fiscal Year Annual Research Report

Simultaneous quantification of major pathogenic bacteria and diarrhea risk analysis in slum contexts

Research Project

Project/Area Number 16H04436
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

原田 英典  京都大学, 地球環境学堂, 助教 (40512835)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 藤井 滋穂  京都大学, 地球環境学堂, 教授 (10135535)
酒井 彰  流通科学大学, 経済学部, 教授 (20299126)
Project Period (FY) 2016-04-01 – 2020-03-31
Keywordsスラム / 衛生 / 病原性細菌 / 曝露解析 / 下痢症
Outline of Annual Research Achievements

当該研究では,国際的な課題であるスラムにおける子供の下痢問題解決に向け,スラムの子供の下痢症リスクのより正確な推計・解析の実現を目指した。その目標として,1)主要な病原性細菌を網羅的な一斉同時定量と,2)曝露のビデオグラフィー解析,を活用してスラムの特殊性を考慮した子供の下痢症リスク解析フレームを構築することを挙げていた。1)については,次世代シーケンサーを使った8種類の病原性大腸菌の網羅的な一斉同時測定方法を開発し,バングラデシュのスラムに適用し,有効性を示した。さらにこれに,腸チフスおよびパラチフスを引き起こす病原性のSalmonella entericaおよびSalmonella Paratyphi A,コレラを引き起こす病原性のVibrio choleraeの測定を組み合わせ,途上国での主要な水系感染症細菌の効果的な測定を実現した。また,ビデオグラフィー解析であるMLATS(Microlevel Activity Time Series)法による手を介した微生物伝搬の詳細なモデル化に成功し,スラムでの子供の指舐め,遊泳時の水の誤飲による曝露の詳細モデル化を含む,スラムの子供の特殊性を考慮した曝露・下痢症リスクのモンテカルロ法による確率論的解析モデルを構築した。これより,飲料水や食品由来のみならず,遊泳時の環境水の誤飲,および食器の汚染が主要なリスク要因であることを示すことができた。以上,特殊な条件下にある途上国都市スラムを対象に,下痢症リスク構造の理解に大きく貢献した。

Research Progress Status

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (15 results)

All 2018 Other

All Int'l Joint Research (4 results) Journal Article (6 results) (of which Int'l Joint Research: 6 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 1 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 1 results)

  • [Int'l Joint Research] ハノイ理工科大学/ハノイ公衆衛生大学(ベトナム)

    • Country Name
      VIET NAM
    • Counterpart Institution
      ハノイ理工科大学/ハノイ公衆衛生大学
  • [Int'l Joint Research] スイス連邦水質研究所(スイス)

    • Country Name
      SWITZERLAND
    • Counterpart Institution
      スイス連邦水質研究所
  • [Int'l Joint Research] アリゾナ大学(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      アリゾナ大学
  • [Int'l Joint Research] クルナ大学(バングラデシュ)

    • Country Name
      BANGLADESH
    • Counterpart Institution
      クルナ大学
  • [Journal Article] Fecal contamination and the proportion of human-associated E.coli along Nhue river, Viet Nam2018

    • Author(s)
      Mai Tanaka, Hidenori Harada, Shigeo Fujii, Min Li Chua, Nguyen Duy, Hung, Nguyen Pham Hong Lien, Nghiem Trung Dung, Ryota Gomi
    • Journal Title

      Vietnam Journal of Science and Technology

      Volume: 56(2C) Pages: 23-29

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] High time-resolution simulation of E. coli on hands reveals large variation in microbial exposures amongst Vietnamese farmers using human excreta for agriculture2018

    • Author(s)
      Timothy R. Julian, Hasitha S.K. Vithanage, Min Li Chua, Matasaka Kuroda, Ana K. Pitol, Pham Hong Lien Nguyen, Robert A. Canales, Shigeo Fujii, Hidenori Harada
    • Journal Title

      Science of The Total Environment

      Volume: 635 Pages: 120-131

    • DOI

      10.1016/j.scitotenv.2018.04.100

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Pathotyping of Escherichia coli isolated from community toilet wastewater and stored drinking water in a slum in Bangladesh2018

    • Author(s)
      Hidenori Harada, Yuji Fujimori, Ryota Gomi, Md. Nazmul Ahsan, Shigeo Fujii, Akira Sakai, Tomonari Matsuda
    • Journal Title

      Letters in Applied Microbiology

      Volume: 66(6) Pages: 542-548

    • DOI

      10.1111/lam.12878

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Videography to Understand Risks to Farmers Using Human Excreta2018

    • Author(s)
      Julian, T. R., Vithanage, H. S. K., Pitol, A. K., Ronteltap, M., & Harada, H.
    • Journal Title

      Sandec News

      Volume: 19 Pages: 28-28

    • Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Multi-pathway fecal exposure assessment on total and humanspecific E. coli in a Bangladeshi slum2018

    • Author(s)
      Min Li Chua, Hidenori Harada, Shigeo Fujii, Md. Nazmul Ahsan, Akira Sakai, Michiya Kodera, Shotaro Goto, Shohagi Rani Saha
    • Journal Title

      Proceedings of the 27th Joint KAIST-KU-NTU-NUS Symposium on Environmental Engineering

      Volume: 27 Pages: 110-117

    • Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Source identification of Escherichia coli by using a Human-associated genetic marker: A case study in Nhue River, Vietnam2018

    • Author(s)
      M. Tanaka, H. Harada, S. Fujii, M. Chua, H. Nguyen, L. Nguyen, D. Nghiem, R. Gomi
    • Journal Title

      Proceedings of the 27th Joint KAIST-KU-NTU-NUS Symposium on Environmental Engineering

      Volume: 27 Pages: 118-124

    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Proportions of human-associated Escherichia coli isolates along a heavily contaminated river in Vietnam2018

    • Author(s)
      Harada, H., Tanaka, M., Fujii, S., Chua, M.L., Nguyen, D.H., Nguyen, P.H.L., Nghiem T.D., Gomi, R.
    • Organizer
      Water Microbiology 2018
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Bacteria and Parasite Eggs Exposure: a Case Study in a Vietnamese Community with Excreta Use for Agriculture2018

    • Author(s)
      H. Harada, S. Fujii, M. Kuroda, P.H.L. Nguyen, T.H. Huynh, D.P. Pham
    • Organizer
      IWA World Water Congress & Exhibition 2018
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Comparison of fecal exposure assessment in living environment between boy, girl and male adult in a slum in Khulna city, Bangladesh2018

    • Author(s)
      Min Li Chua, Hidenori Harada, Shigeo Fujii, Md. Nazmul Ahsan, Akira Sakai, Michiya Kodera, Shotaro Goto, Shohagi Rani Saha
    • Organizer
      IWA World Water Congress & Exhibition 2018
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] High time-resolution simulation of E. coli on Vietnamese farmers' hands based on videography and environmental microbial sampling2018

    • Author(s)
      Tim Julian, Hasitha, S.K. Vithanage, Min Li Chua, Masataka Kuroda, Ana K. Pitol, Pham Hong Lien Nugyen, Robert Canales, Shigeo Fujii, Hidenori Harad
    • Organizer
      Swiss Society for Microbiology Annual Congress 2018
  • [Presentation] 暮らしに伴う多様な糞便との関わりから考えるサニテーションの役割2018

    • Author(s)
      原田英典
    • Organizer
      第6 回北大・地球研合同セミナー「グローバルとローカルの視座から地域の人々の生活と健康を考える
    • Invited

URL: 

Published: 2019-12-27  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi