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2018 Fiscal Year Annual Research Report

Genomic basis of evolution of the complex central nervous system and its associated sensory organs of vertebrates

Research Project

Project/Area Number 16H04724
Research InstitutionKonan University

Principal Investigator

日下部 岳広  甲南大学, 理工学部, 教授 (40280862)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 鈴木 穣  東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 教授 (40323646)
中井 謙太  東京大学, 医科学研究所, 教授 (60217643)
Project Period (FY) 2016-04-01 – 2019-03-31
Keywordsホヤ / メダカ / 脳 / 感覚器 / プラコード / 神経堤 / 進化
Outline of Annual Research Achievements

ホヤ幼生の脳内光受容器である眼点は脊椎動物の眼と同じタイプの視細胞と光受容体タンパク質(オプシン)をもち、脊椎動物の眼と相同な器官と考えられる。ホヤの単純な眼点に対し、脊椎動物の眼は多様で特殊化した細胞から構成される精緻で複雑な器官である。光受容器の複雑さの獲得過程とその制御機構の解明を目指し、ホヤと脊椎動物のそれぞれについて、光受容器の発生の制御機構に関する解析を行った。前年度までに明らかにしたホヤ眼点の細胞系譜、細胞分裂パターンの制御による眼盃の形態形成機構、転写因子群のダイナミックな発現による眼点視細胞の発生機構について、論文を公表した。さらに、ホヤ眼点を構成する細胞のうち、唯一、特異的分子マーカーがなく細胞系譜や発生機構が不明であったレンズ細胞について、特異的に発現する遺伝子を同定し、特異的抗体を作製した。これは、ホヤの脳および感覚器の発生機構を完全に解明し、脊椎動物脳の進化の理解を深める上で、重要な進展と考えられる。また、前年に引き続き、脊椎動物モデルとしてメダカを用いて、視細胞の多様性を制御する因子の機能解析を行った。これらの因子はホヤゲノムには見出されず、脊椎動物の眼の複雑化に寄与した可能性が示唆された。
脊椎動物視床下部ニューロンとの相同性が指摘されているホヤ幼生の脳内細胞群について、単離した細胞を用いた遺伝子発現の網羅的な解析(シングルセル・トランスクリプトーム解析)を行った。得られたデータにより細胞分化を制御する転写調節因子を予測し、胚の遺伝子機能操作による実験検証を行い、遺伝子調節ネットワークを明らかし、論文を公表した。また、シングルセル・トランスクリプトーム解析を、脊索動物の中軸構造の遺伝子調節機構に適用し、その進化に関する新しい知見を得た。

Research Progress Status

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (28 results)

All 2019 2018 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 1 results) Presentation (23 results) (of which Int'l Joint Research: 7 results) Remarks (2 results)

  • [Int'l Joint Research] プリンストン大学(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      プリンストン大学
  • [Journal Article] Spatio-temporal regulation of Rx and mitotic patterns shape the eye-cup of the photoreceptor cells in Ciona2019

    • Author(s)
      Kouhei Oonuma, Takehiro G. Kusakabe
    • Journal Title

      Developmental Biology

      Volume: 445 Pages: 245-255

    • DOI

      10.1016/j.ydbio.2018.11.011

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Regulatory cocktail for dopaminergic neurons in a protovertebrate identified by whole-embryo single-cell transcriptomics2018

    • Author(s)
      Takeo Horie, Ryoko Horie, Kai Chen, Chen Cao, Masashi Nakagawa, Takehiro G. Kusakabe, Nori Satoh, Yasunori Sasakura, Michael Levine
    • Journal Title

      Genes & Development

      Volume: 32 Pages: 1297-1302

    • DOI

      10.1101/gad.317669.118

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] Development and neuronal identity of the neural circuit controlling larval swimming2019

    • Author(s)
      Take Kusakabe
    • Organizer
      The Ciona Connectome: creating a research network, University of California, Santa Barbara, CA, U.S.A.
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Visualization of activity of gnrh2-expressing cells using a calcium sensor protein2019

    • Author(s)
      Nanako Okawa
    • Organizer
      The Ciona Connectome: creating a research network, University of California, Santa Barbara, CA, U.S.A.
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Mitotic patterns of photoreceptor lineage cells and the cell lineage of the coronet cells2019

    • Author(s)
      Kouhei Oonuma
    • Organizer
      The Ciona Connectome: creating a research network, University of California, Santa Barbara, CA, U.S.A.
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] ホヤ胚のフロアプレートと内胚葉索に共通な遺伝子発現調節機構の解析2019

    • Author(s)
      山本真帆,森継奈穂,常深秀人,堀江健生,大沼耕平,日下部岳広
    • Organizer
      2019年日本動物学会近畿支部春季研究発表会
  • [Presentation] ホヤ胚のフロアプレートと内胚葉索にみられる遺伝子発現調節機構の共通性2019

    • Author(s)
      山本真帆,森継奈穂,常深秀人,大川奈菜子,堀江健生,大沼耕平,日下部岳広
    • Organizer
      日本動物学会第90回大会
  • [Presentation] UV 錐体特異的miRNA(miR-729)欠損メダカの網膜トランスクリプトームと視細胞モザイクパターンの解析2019

    • Author(s)
      川上泰治,緒方翼,横森類,坂本倫紀,野口大樹,原田瑞輝,行者蕗,鈴木穣,中井謙太,大道裕,日下部岳広
    • Organizer
      日本動物学会第90回大会
  • [Presentation] 脊索動物胚の中軸構造の発生を制御する遺伝子プログラムの進化:フロアプレートとハイポコードの遺伝子発現調節機構の共通性2019

    • Author(s)
      山本真帆, 森継奈穂, 常深秀人, 大川奈菜子, 堀江健生, 大沼耕平, 日下部岳広
    • Organizer
      第42回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] ホヤ幼生の遊泳運動におけるGnRH神経系と上衣細胞の役割2019

    • Author(s)
      大川奈菜子,泉有紗,曽谷実玖,大倉正道,中井淳一,堀江健生,久原篤,日下部岳広
    • Organizer
      第42回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] ホヤ幼生眼点のレンズ特異的分子マーカーの同定とレンズ細胞の発生機構の解析2019

    • Author(s)
      緒方翼,佐藤南美,大沼耕平,日下部岳広
    • Organizer
      第42回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] 錐体視細胞特異的miRNA欠損メダカの網膜トランスクリプトームと視細胞モザイクパターンの解析2019

    • Author(s)
      川上泰治,緒方翼,横森類,坂本倫紀,野口大樹,原田瑞輝,行者蕗,鈴木穣,中井謙太,大道裕,日下部岳広
    • Organizer
      第42回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] A single pair of A10.64 motor neuron showing Ca2+ oscillation is an essential component of central pattern generator for ascidian swimming locomotion2019

    • Author(s)
      Taichi Akahoshi, Kouhei Oonuma, Makoto Murakami, Takeo Horie, Takehiro G. Kusakabe, Kohji Hotta, Kotaro Oka
    • Organizer
      第42回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] In vivo calcium-imaging reveals a possible role of the GnRH system in larval swimming of Ciona2019

    • Author(s)
      Nanako Okawa, Kotaro Shimai, Masamichi Ohkura, Junichi Nakai, Takeo Horie, Atsushi Kuhara, Takehiro G. Kusakabe
    • Organizer
      10th International Tunicate Meeting, Villefranche-sur-Mer, France
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Evolution of developmental programs for the midline structures in chordates: insights from gene regulation in the floor plate and hypochord homologues of Ciona embryos2019

    • Author(s)
      Shuto Tsunemi, Naho Moritsugu, Kouhei Oonuma, Mike Levine, and Takeo Horie, and Takehiro G. Kusakabe
    • Organizer
      10th International Tunicate Meeting, Villefranche-sur-Mer, France
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] A genome-wide survey of muscle structural genes in Molgula tectiformis suggests an ancient origin of its anural mode of development2019

    • Author(s)
      Fuki Gyoja, Miyuki Kanda, Takehiro G. Kusakabe, Nori Satoh
    • Organizer
      10th International Tunicate Meeting, Villefranche-sur-Mer, France
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Left-right asymmetric development of cells in the larval brain of Ciona2019

    • Author(s)
      Kouhei Oonuma, Takehiro G. Kusakabe
    • Organizer
      10th International Tunicate Meeting, Villefranche-sur-Mer, France
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 錐体視細胞特異的miRNA の機能と脊椎動物の色覚の進化2018

    • Author(s)
      日下部岳広,行者蕗,横森類,鈴木穣,中井謙太,大道裕
    • Organizer
      2018年日本動物学会近畿支部春季研究発表会
  • [Presentation] カルシウムイメージング法によるホヤ幼生gnrh発現細胞の活動記録2018

    • Author(s)
      大川奈菜子,島井光太郎,大倉正道,中井淳一,堀江健生,久原篤,日下部岳広
    • Organizer
      2018年日本動物学会近畿支部春季研究発表会
  • [Presentation] カルシウムイメージング法を用いたgnrh神経系とコロネット細胞の機能解析2018

    • Author(s)
      大川奈菜子,穴迫真澄,日下部岳広
    • Organizer
      第4回ホヤ研究会
  • [Presentation] 胚の中軸組織に共通の遺伝子発現とヘッジホッグシグナルの役割2018

    • Author(s)
      常深秀人,森継奈穂,玉井雅大,大沼耕平,日下部岳広
    • Organizer
      第4回ホヤ研究会
  • [Presentation] 神経回路の形成とニューロンの細胞系譜2018

    • Author(s)
      大沼耕平,和田聖矢,中込絵梨,原田瑞輝,日下部岳広
    • Organizer
      第4回ホヤ研究会
  • [Presentation] ホヤ胚の胚葉間で共通の中軸組織特異的遺伝子発現とヘッジホッグシグナルの役割2018

    • Author(s)
      常深秀人,森継奈穂,玉井雅大,大沼耕平,島井光太郎,堀江健生,Michael Levine,日下部岳広
    • Organizer
      第41回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] カタユウレイボヤ幼生gnrh発現細胞の細胞サブタイプの同定と機能解析2018

    • Author(s)
      大川奈菜子,島井光太郎,大西康平,大倉正道,中井淳一,堀江健生,久原篤,日下部岳広
    • Organizer
      第41回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] ホヤ幼生の遊泳運動制御に関わる神経細胞分化におけるSox1/2/3の役割2018

    • Author(s)
      和田聖矢,大沼耕平,舟越正憲,堀江健生,島井光太郎,日下部岳広
    • Organizer
      第41回日本分子生物学会年会
  • [Remarks] DBTGR: DataBase of Tunicate Gene Regulation

    • URL

      http://dbtgr.hgc.jp/

  • [Remarks] 甲南大学発生学研究室 研究成果

    • URL

      https://www.konan-u.ac.jp/hp/devbiol/9seika.html

URL: 

Published: 2021-01-27  

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