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2016 Fiscal Year Annual Research Report

RNA結合蛋白質が細胞シグナルに応答して制御する翻訳とmRNA分解との連携機構

Research Project

Project/Area Number 16H04745
Research InstitutionKindai University

Principal Investigator

藤原 俊伸  近畿大学, 薬学部, 教授 (80362804)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 三嶋 雄一郎  東京大学, 分子細胞生物学研究所, 助教 (00557069)
Project Period (FY) 2016-04-01 – 2019-03-31
Keywords翻訳制御 / mRNA分解
Outline of Annual Research Achievements

H28年度はAU-Rich Element (ARE)結合タンパク質の1つBRF1によるmRNA分解と翻訳制御との関係を中心に解析を進めた。代表者は、これまでにluciferase mRNAの3’非翻訳領域にAREを含む標的配列を付加したレポーターRNAを用いて、ARE結合因子BRF1の存在下および非存在下でのレポーターの発現および mRNAの安定性をin vitro翻訳系で検証することに成功している。そしてこれまでに、エフェクターに応答したmRNA分解マシナリーの存在を提唱してきた。そこで、このin vitro解析系を利用し、RNA結合タンパク質HuD&による翻訳活性化とmRNA分解機構に対する拮抗あるいは協調関係を詳細に解析した。まず、BRF1がどのようなマシナリーでmRNA分解を誘起するのかを、poly(A)分解複合体であるCCR4-NOT複合体の構成因子のKOマウスから得られたMEFを用いて解析し、どの因子がBRF1を介したmRNA分解に必須な因子であるかを特定した。さらに、脱アデニル化を受けないレポーターmRNAを用いて翻訳への影響を解析した結果、BRF1に翻訳抑制能があることを明らかにした。また、BRF1による翻訳抑制機構が開始複合体から翻訳開始因子eIF4Aを離脱させるというmicroRNAによる翻訳抑制の分子機構と異なることもmRNP pull-down実験系で明らかにしている。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

翻訳制御とmRNA分解との2つの機能を有するRNA結合タンパク質の分子機構が明らかになってきたため。

Strategy for Future Research Activity

さらに、活性型 Akt1-HuD からのシグナルが BRF1 へと伝達され、mRNAの安定化に寄与するかどうかを HuD の Akt1結合変異体および BRF1 の非リン酸化変異体を用いて mRNA の安定性・deadenylation そして翻訳活 性を指標に検証する。さらに分担者は、人工合成した ARE を有するレポーターmRNA をゼブラフィッ シュ受精卵中で可視化し、翻訳が活性化時および抑制時にどのような局在の変化を呈するかを、HuD および BRF1 の局在と共に詳細に観察する。

  • Research Products

    (31 results)

All 2017 2016 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Acknowledgement Compliant: 4 results) Presentation (25 results) (of which Int'l Joint Research: 14 results,  Invited: 4 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] McGill University(カナダ)

    • Country Name
      CANADA
    • Counterpart Institution
      McGill University
  • [Journal Article] Spatial regulation of the KH domain RNA-binding protein Rnc1 mediated by a Crm1-independent nuclear export system in Schizosaccharomyces pombe.2017

    • Author(s)
      Satoh R, Matsumura Y, Tanaka A, Takada M, Ito Y, Hagihara K, Inari M, Kita A, Fukao A, Fujiwara T, Hirai S, Tani T, Sugiura R.
    • Journal Title

      Mol Microbiol.

      Volume: 104 Pages: 428-448

    • DOI

      10.1111/mmi.13636.

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] The coupled- and uncoupled mechanisms by which trans-acting factors regulate mRNA stability and translation2017

    • Author(s)
      Fukao, A., and Fujiwara, T.
    • Journal Title

      The Journal of Biochemistry

      Volume: 161 Pages: 309-314

    • DOI

      10.1093/jb/mvw086.

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Translational regulation is mediated by the cross-talk between the miRNA pathway and RNA binding proteins].2016

    • Author(s)
      Aoyama T, Fukao A, Fujiwara T.
    • Journal Title

      Nihon Yakurigaku Zasshi

      Volume: 147 Pages: 346-350

    • DOI

      10.1254/fpj.147.346.

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] 翻訳開始過程を標的とした蛋白質合成のファインチューニング2016

    • Author(s)
      藤原俊伸
    • Journal Title

      生化学 みにれびゅう

      Volume: 88 Pages: 135-138

    • DOI

      10.14952/SEIKAGAKU.2016.880135

    • Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] in vitro翻訳実験系で見えてきた哺乳類における翻訳制御の「妙」2017

    • Author(s)
      藤原俊伸
    • Organizer
      第2回デザイン生命工学研究会大会
    • Place of Presentation
      神戸大学統合研究拠点コンベンションホール(神戸市)
    • Year and Date
      2017-03-21 – 2017-03-21
    • Invited
  • [Presentation] ARE結合タンパク質によるCCR4-NOT複合体を介した翻訳制御機構2017

    • Author(s)
      藤原俊伸
    • Organizer
      第5回CCR4-NOT 研究会
    • Place of Presentation
      沖縄科学技術大学院大学(沖縄県恩納村)
    • Year and Date
      2017-02-04 – 2017-02-06
  • [Presentation] AU-Rich Element(ARE)結合タンパク質BRF1によって誘起されるmRNA分解非依存的な翻訳抑制2016

    • Author(s)
      藤原俊伸
    • Organizer
      第39回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • Year and Date
      2016-11-30 – 2016-12-02
  • [Presentation] RNA結合タンパク質が仲介するmRNA分解と翻訳との共役2016

    • Author(s)
      武知美和、深尾亜喜良、船上仁範、藤原俊伸
    • Organizer
      第39回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • Year and Date
      2016-11-30 – 2016-12-02
  • [Presentation] ポリオウイルスの細胞種特異的なIRES依存的翻訳の解析2016

    • Author(s)
      貞廣暁利、足達俊吾、深尾亜喜良、船上仁範、夏目徹、竹内理、藤原俊伸
    • Organizer
      第39回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • Year and Date
      2016-11-30 – 2016-12-02
  • [Presentation] PABP interacting protein 1(Paip1)による翻訳制御機構の解析2016

    • Author(s)
      青山智彦、大塚衆志、船上仁範、深尾亜喜良、藤原俊伸
    • Organizer
      第39回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • Year and Date
      2016-11-30 – 2016-12-02
  • [Presentation] cap依存的翻訳におけるeIF4Hの機能解析2016

    • Author(s)
      友廣拓生、深尾亜喜良、船上仁範、藤原俊伸
    • Organizer
      第39回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • Year and Date
      2016-11-30 – 2016-12-02
  • [Presentation] RNA結合タンパク質HuDによる翻訳促進機構の素過程の解析2016

    • Author(s)
      大塚衆志、深尾亜喜良、船上仁範、藤原俊伸
    • Organizer
      第39回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • Year and Date
      2016-11-30 – 2016-12-02
  • [Presentation] The novel function of PABP interacting protein 1 (Paip1) in translation initiation2016

    • Author(s)
      Aoyama T, Fukao A, Sonenberg N, Fujiwara T
    • Organizer
      The Cold Spring Harbor Asia conference on RNA Biology
    • Place of Presentation
      Suzhou, China
    • Year and Date
      2016-11-14 – 2016-11-18
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Neural specific RNA-binding protein grasp the translation2016

    • Author(s)
      Fukao A, Fujiwara T
    • Organizer
      The Cold Spring Harbor Asia conference on RNA Biology
    • Place of Presentation
      Suzhou, China
    • Year and Date
      2016-11-14 – 2016-11-18
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] The coupling mechanism between translation and mRNA degradation mediated by RNA-binding protein HuD2016

    • Author(s)
      Akira Fukao , Toshinobu Fujiwara
    • Organizer
      12th International Congress on Protein Phosphatase (ICPP12)
    • Place of Presentation
      近畿大学11月ホール(東大阪市)
    • Year and Date
      2016-10-27 – 2016-10-30
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Analyses of cell type specific translation from IRES mRNA derived from two different poliovirus strains.2016

    • Author(s)
      Akitoshi Sadahiro, Akira Fukao, Naoki Takizawa, Osamu Takeuchi, Toshinobu Fujiwara
    • Organizer
      12th International Congress on Protein Phosphatase (ICPP12)
    • Place of Presentation
      近畿大学11月ホール(東大阪市)
    • Year and Date
      2016-10-27 – 2016-10-30
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Analyses of the molecular function of PABP interacting protein 1 (PAIP1) in translational regulation2016

    • Author(s)
      Tomohiko Aoyama, Akira Fukao, Nahum Sonenberg, Akiko Yanagiya, Toshinobu Fujiwara
    • Organizer
      12th International Congress on Protein Phosphatase (ICPP12)
    • Place of Presentation
      近畿大学11月ホール(東大阪市)
    • Year and Date
      2016-10-27 – 2016-10-30
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Mysterious eukaryotic translation initiation factor eIF4H2016

    • Author(s)
      Takumi Tomohiro, Akira Fukao , Toshinobu Fujiwara
    • Organizer
      12th International Congress on Protein Phosphatase (ICPP12)
    • Place of Presentation
      近畿大学11月ホール(東大阪市)
    • Year and Date
      2016-10-27 – 2016-10-30
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Elucidation of elementary processes in which RNA-binding protein HuD stimulates the cap- poly(A) dependent translation2016

    • Author(s)
      Hiroshi Ohtsuka, Akira Fukao , Toshinobu Fujiwara
    • Organizer
      12th International Congress on Protein Phosphatase (ICPP12)
    • Place of Presentation
      近畿大学11月ホール(東大阪市)
    • Year and Date
      2016-10-27 – 2016-10-30
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Butyrate response factor1 induces translation repression independently of ARE-mediated mRNA decay2016

    • Author(s)
      Miwa Takechi, Akira Fukao, Keizo Tomonaga, Toshinou Fujiwara
    • Organizer
      12th International Congress on Protein Phosphatase (ICPP12)
    • Place of Presentation
      近畿大学11月ホール(東大阪市)
    • Year and Date
      2016-10-27 – 2016-10-30
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Effect of interaction between RNA binding protein HuD and SMN protein on protein synthesis2016

    • Author(s)
      Daisuke Ikeda, Akira Fukao, Toshinou Fujiwara
    • Organizer
      12th International Congress on Protein Phosphatase (ICPP12)
    • Place of Presentation
      近畿大学11月ホール(東大阪市)
    • Year and Date
      2016-10-27 – 2016-10-30
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Neural specific RNA-binding proteins grasp the translation regulatory networks2016

    • Author(s)
      Fujiwara T
    • Organizer
      12th International Congress on Protein Phosphatase (ICPP12)
    • Place of Presentation
      近畿大学11月ホール(東大阪市)
    • Year and Date
      2016-10-27 – 2016-10-27
    • Invited
  • [Presentation] Butyrate response factor1 induces translation repression independently of ARE-mediated mRNA decay2016

    • Author(s)
      Miwa Takechi, Hiroshi Otsuka, Akira Fukao , Toshinobu Fujiwara
    • Organizer
      EMBO|EMBL Symposium:The Complex Life of mRNA
    • Place of Presentation
      ハイデルベルグ、ドイツ
    • Year and Date
      2016-10-05 – 2016-10-08
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] The coupling mechanism between translation and mRNA degradation mediated by RNA-binding protein HuD2016

    • Author(s)
      Fujiwara T
    • Organizer
      第89回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      東北大学川内北キャンパス(仙台市)
    • Year and Date
      2016-09-25 – 2016-09-27
    • Invited
  • [Presentation] The coupling mechanism between translation and mRNA degradation mediated by RNA-binding protein HuD2016

    • Author(s)
      Miwa Takechi, Akira Fukao , Toshinobu Fujiwara
    • Organizer
      Translational Control 2016
    • Place of Presentation
      ニューヨーク、アメリカ
    • Year and Date
      2016-09-06 – 2016-09-10
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] ポリオウイルスの細胞種特異的なIRES依存的翻訳の解析2016

    • Author(s)
      貞廣暁利、足達俊吾、深尾亜喜良、夏目徹、竹内理、藤原俊伸
    • Organizer
      RNAフロンティアミーティング2016
    • Place of Presentation
      北海道、ニセコ
    • Year and Date
      2016-08-31 – 2016-09-02
  • [Presentation] The coupling mechanism between translation and mRNA degradation mediated by RNA-binding protein HuD2016

    • Author(s)
      Miwa Takechi, Akira Fukao , Toshinobu Fujiwara
    • Organizer
      RNA2016
    • Place of Presentation
      京都国際会議場(京都)
    • Year and Date
      2016-06-28 – 2016-07-02
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Analyses of cell type specific translation from IRES mRNA derived from two different poliovirus strains.2016

    • Author(s)
      Akitoshi Sadahiro, Akira Fukao, Naoki Takizawa, Osamu Takeuchi, Toshinobu Fujiwara
    • Organizer
      RNA2016
    • Place of Presentation
      京都国際会議場(京都)
    • Year and Date
      2016-06-28 – 2016-07-02
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Analyses of the molecular function of PABP interacting protein 1 (PAIP1) in translational regulation.2016

    • Author(s)
      Tomohiko Aoyama, Akiko Yanagiya, Nahum Sonenberg, Akira Fukao, Toshinobu Fujiwara
    • Organizer
      RNA2016
    • Place of Presentation
      京都国際会議場(京都)
    • Year and Date
      2016-06-28 – 2016-07-02
    • Int'l Joint Research
  • [Remarks] 近畿大学薬学部生化学研究室HP

    • URL

      http://www.phar.kindai.ac.jp/biochemistry/

URL: 

Published: 2018-01-16  

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