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2018 Fiscal Year Annual Research Report

Molecular mechanism of ribosome hijack by the HCV IRES

Research Project

Project/Area Number 16H04756
Research InstitutionInstitute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

伊藤 拓宏  国立研究開発法人理化学研究所, 生命機能科学研究センター, ユニットリーダー (70401164)

Project Period (FY) 2016-04-01 – 2019-03-31
Keywordsウイルス / 生体分子 / 電子顕微鏡 / 翻訳 / 翻訳開始
Outline of Annual Research Achievements

ヒト由来因子によって再構成した試験管内翻訳システムの大量反応系を用いて、クライオ電子顕微鏡を用いた立体構造解析のための試料を調製した。ヒトリボソームとHCV IRESのハイジャック後複合体について、3.9Åの分解能で構造決定した。また、ヒトリボソームとHCV IRESのハイジャック前複合体についても、3.9Åの分解能で立体構造を決定した。蛍光顕微鏡による一分子観察によって、確かにHCV IRESが翻訳中の80Sリボソームに結合していることを確認した。さらに生化学的な実験により、HCV IRESは空のリボソームよりも、翻訳中のリボソームの方がより効率よく下流の翻訳を誘導できることを明らかにした。これらの結果によりHCV IRESの宿主翻訳系のハイジャックシステムが明らかになり、Molecular Cell誌に報告した。
HCV IRESによる翻訳開始と競合して翻訳開始に機能する翻訳開始因子eIF4Aについて、翻訳阻害剤RocAと連続プリン配列、ATPアナログの4者複合体の結晶構造解析に成功し、生化学的・計算科学的な結果と合わせてMolecular Cell誌に報告した。
HCV IRESによる翻訳開始と競合して翻訳開始に機能する翻訳開始因子eIF2とeIF2Bについて、これらの複合体の立体構造をeIF2のリン酸化のある場合とない場合の両方について決定した。eIF2はリン酸化の有無に応じてeIF2Bとの結合様式を生産的あるいは非生産的結合という大きく異なる2つの形に変化させることが明らかになった。リン酸化eIF2のリン酸化セリンはeIF2内部のアルギニン、リジン、アスパラギン酸と静電的相互作用をすることで、C末端側のアルギニンに富む正に帯電したループを突き出す構造を取り、非生産的結合が可能になることを明らかにした。この結果をScience誌に報告した。

Research Progress Status

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (9 results)

All 2019 2018

All Journal Article (4 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 1 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results)

  • [Journal Article] The Translation Inhibitor Rocaglamide Targets a Bimolecular Cavity between eIF4A and Polypurine RNA2019

    • Author(s)
      Iwasaki Shintaro、Iwasaki Wakana、Takahashi Mari、Sakamoto Ayako、Watanabe Chiduru、Shichino Yuichi、Floor Stephen N.、Fujiwara Koichi、Mito Mari、Dodo Kosuke、Sodeoka Mikiko、Imataka Hiroaki、Honma Teruki、Fukuzawa Kaori、Ito Takuhiro、Ingolia Nicholas T.
    • Journal Title

      Molecular Cell

      Volume: 73 Pages: 738~748.e9

    • DOI

      10.1016/j.molcel.2018.11.026

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Structural basis for eIF2B inhibition in integrated stress response2019

    • Author(s)
      Kashiwagi Kazuhiro、Yokoyama Takeshi、Nishimoto Madoka、Takahashi Mari、Sakamoto Ayako、Yonemochi Mayumi、Shirouzu Mikako、Ito Takuhiro
    • Journal Title

      Science

      Volume: 364 Pages: 495~499

    • DOI

      10.1126/science.aaw4104

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] HCV IRES captures an actively translating 80S ribosome2019

    • Author(s)
      Yokoyama Takeshi、Machida Kodai、Iwasaki Wakana、Shigeta Tomoaki、Nishimoto Madoka、Takahashi Mari、Sakamoto Ayako、Yonemochi Mayumi、Harada Yoshie、Shigematsu Hideki、Shirouzu Mikako、 Tadakuma Hisashi、Imataka Hiroaki、Ito Takuhiro
    • Journal Title

      Molecular Cell

      Volume: 印刷中 Pages: 印刷中

    • DOI

      10.1016/j.molcel.2019.04.022

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Dynamic interaction of poly(A)-binding protein with the ribosome2018

    • Author(s)
      Machida Kodai、Shigeta Tomoaki、Yamamoto Yuki、Ito Takuhiro、Svitkin Yuri、Sonenberg Nahum、Imataka Hiroaki
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 8 Pages: -

    • DOI

      10.1038/s41598-018-35753-1

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] Rocaglamide Aによる配列特異的な翻訳阻害の構造基盤2018

    • Author(s)
      伊藤拓宏
    • Organizer
      第20回日本RNA学会年会
  • [Presentation] C型肝炎IRESは翻訳中80Sリボソームに結合し、宿主の翻訳系をハイジャックする2018

    • Author(s)
      横山武司
    • Organizer
      第20回日本RNA学会年会
  • [Presentation] HCV IRES captures a translating 80S ribosome to hijack host translational machinery2018

    • Author(s)
      Ito Takuhiro
    • Organizer
      Proteins; from the Cradle to the Grave
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Structural basis for sequence-specific translation inhibition by Rocaglamide A2018

    • Author(s)
      Ito Takuhiro
    • Organizer
      Translational Control
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] HCV IRES captures a translating 80S ribosome to hijack host translational machinery2018

    • Author(s)
      Yokoyama Takeshi
    • Organizer
      Translational Control
    • Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2019-12-27  

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