2018 Fiscal Year Annual Research Report
Comparative analysis of cytoskeletal function in plant cell division and morphogenesis using new standard cell lines and image processing
Project/Area Number |
16H04802
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Research Institution | The University of Tokyo |
Principal Investigator |
馳澤 盛一郎 東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 教授 (40172902)
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Project Period (FY) |
2016-04-01 – 2019-03-31
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Keywords | 植物細胞分裂・形態形成 / 細胞骨格 / 画像定量解析 |
Outline of Annual Research Achievements |
本申請研究では、シダ植物およびコケ植物において細胞研究の多様な解析ニーズに適した実験細胞株(standard cell line:SCL)を新規に確立し、それらを用いた細胞分裂・形態形成様式の比較解析を行うことで、植物が進化の過程で獲得してきた増殖システムに迫ろうと試みた。具体的には、シダ植物のリチャー ドミズワラビとコケ植物のゼニゴケに着目し、各植物種において新規の懸濁培養細胞を作成し、分裂増殖の解析に適したSCLの確立を目指した。一方、これらの細胞を用いて細胞骨格などの比較解析を行い得るイメージング画像定量解析のツールを目指し、独自のシングルセル解析システムの開発を行った。最終的には、タバコBY-2細胞などのデータと照合することで、被子植物、シダ植物、コケ植物 の比較解析を目指している。最終年度である平成30年度は、28~29年度に引き続き以下の検討を行った。 1)これまでに得られたfine cell culture であるSCL候補の cell lineをさらに改良し、より増殖速度や分裂頻度を高めるべく再検討した。特にシダの培養細胞は、SCLとして配布できるように培養条件についても再検討し、理研バイオリソースに委託した。また、それを用いた実用的なプロトプラストの作成と培養の実験系を確立し、短報として公表した。 2)細胞核(染色体)、微小管などに着目して、シダ、コケ、タバコ細胞の細胞分裂様式の分裂期を通した経時観察を行い、3者の比較解析を試行した。 3)シングルセル解析システムを独自に開発し、自動判定ツールの応用を試みた。具体的には、細胞の蛍光および明視野像などをもとにして、画像解析ソフトウェアImageJ 上の独自に開発したplug-inにより画像特徴を抽出して、細胞形態等の自動分類器を作成し、論文として発表するとともに関連製品の開発も行った。
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Research Progress Status |
平成30年度が最終年度であるため、記入しない。
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Strategy for Future Research Activity |
平成30年度が最終年度であるため、記入しない。
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[Journal Article] Polar vacuolar distribution is essential for accurate asymmetric division of Arabidopsis zygotes.2019
Author(s)
Kimata Y, Kato T, Higaki T, Kurihara D, Yamada T, Segami S, Terao-Morita M, Maeshima M, Hasezawa S, Higashiyama T, Tasaka M, Ueda M
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Journal Title
Proc. Natl. Acad. Sci. USA
Volume: 116
Pages: 2338-2343
DOI
Peer Reviewed
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