2018 Fiscal Year Annual Research Report
Intraspecific differentiation reinforced by flowering time differentiation as local adaptation caused by the genotype polymorphisms
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16H04831
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| Research Institution | Kyoto University |
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Principal Investigator |
瀬戸口 浩彰 京都大学, 地球環境学堂, 教授 (70206647)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
川口 正代司 基礎生物学研究所, 共生システム研究部門, 教授 (30260508)
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| Project Period (FY) |
2016-04-01 – 2019-03-31
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| Keywords | 開花 / 繁殖成長 / 栄養成長 / 生殖前隔離 / 環境相互作用 / ミヤコグサ / ハマダイコン |
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| Outline of Annual Research Achievements |
同一植物における開花時期の違いは、種内における生殖前隔離をもたらし、これが世代を重ねることによって種分化をもたらすことが想定される。本年度の研究では、マメ科ミヤコグサを用いて、主に日長を主とする複合要因で開花時期が制御される機構について、アブラナ科ハマダイコンを対象にして、低温要求性（春化）が主な開花制御要因となっている機構について解析を進めた。ミヤコグサの開花時期の種内多型に関わる研究では、沖縄本島において日本列島の分布域を網羅する132系統の共通圃場実験を行った。これまでに得られている愛知県岡崎市と宮崎県におけるデータに加え、より極端な環境での開花時期多型を記録することができた。沖縄での開花所要日数データを加えた全ゲノム関連解析では、複数の形質データを用いる解析モデルにより、既知の開花遺伝子を含む有力な候補遺伝子を検出した。これまでに得られていた開花時期多型データに加えて、沖縄での形質データを用いることで解析力を上げることができ、より明瞭に候補遺伝子を得ることができた。ハマダイコンでの研究では、前年度までに春化による開花制御に関わる遺伝子がFLC-A と COL-5 であることがわかったために、春化を必要とする北方系統と、必要としない南方系統を対象にしてqRT-PCRでそれぞれの発現を解析した。なお、ハマダイコンにおいてFLC-Aは開花促進を、COL-5は開花抑制の機能をもっている。春化を施す処理の解析の結果、 北方系統ではFLC-Aだけが一定量発現する事で開花が促進されているのに対して、南方系統ではFLC-A と COL-5 の両方が発現しつつ、かつFLC-Aの発現量が極めて高いレベルにあることがわかった。このように、拮抗的な二つの遺伝子が、南北系統間では発現様式を変えていることが明らかになった
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| Research Progress Status |
平成30年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
平成30年度が最終年度であるため、記入しない。
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[Journal Article] Exploring genetic Diversity and Signatures of Horizontal Gene Transfer in Lotus japonicus-Associated Nodule Bacteria in Natural Environments2019
Author(s)
Bamba, M., Aoki, S., Kajita, T., Setoguchi, H., Watano, Y., Sato, S., Tsuchimatsu, T.
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Journal Title
Molecular Plant-Microbe Interactions
Volume: -
Pages: -
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Genetic diversity of Saxifraga acerifolia and S. fortune based on nuclear and chloroplast microsatellite markers2018
Author(s)
Magota, K., Sakaguchi, S., Akai, K., Isagi, Y., Setoguchi, H.
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Journal Title
Bulletin of the National Science Museum of Nature and Science, Series B.
Volume: 44
Pages: 85-96
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Approximate Bayesian computation analysis of EST associated microsatellites indicates that the broadleaved evergreen tree Castanopsis sieboldii survived the Last Glacial Maximum in multiple refugia in Japan2018
Author(s)
Aoki, K., Tamaki, I., Nakao, K., Ueno, S.,Kamijo, T., Setoguchi, H., Murakami, N., Kato, M., Tsumura, Y.
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Journal Title
Heredity
Volume: 122
Pages: 326-340
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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