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2018 Fiscal Year Annual Research Report

Studies of bio-regulation with D-amino acids and its application

Research Project

Project/Area Number 16H04908
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

吉村 徹  名古屋大学, 生命農学研究科, 教授 (70182821)

Project Period (FY) 2016-04-01 – 2019-03-31
KeywordsD-アミノ酸 / D-セリン / D-アスパラギン酸 / セリンラセマーゼ / D-アミノ酸トランスアミナーゼ
Outline of Annual Research Achievements

本年度はまず新規D-アミノ酸生合成酵素遺伝子の検出を目的としたファンクショナルスクリーニング系の構築を行った。そのため、まずE. coliの生育に必須なD-Glu、D-Alaの合成をそれぞれ担うグルタミン酸ラセマーゼ、アラニンラセマーゼ遺伝子を欠損した D-Glu, D-Ala要求性の大腸菌、MB3000株を作製した。同株に様々なD-アミノ酸とα-ケト酸の間のアミノ基転移反応を触媒するD-アミノ酸アミノトランスフェラーゼ(DAAT)遺伝子を導入することによって、菌体内で何らかの D-アミノ酸生合成酵素が発現した場合にD-グルタミン酸、D-アラニン要求性が相補される菌株を構築した。得られたこのD-アミノ酸要求株に既知のアミノ酸ラセマーゼ遺伝子を導入、発現させたところ、D-アミノ酸非添加培地における菌体の生育が確認され、同株がD-アミノ酸生合成酵素遺伝子のスクリーニングに使用できる可能性が示された。なおこの研究の過程で、DAATが遊離のリン酸イオンの存在下でセリンのラセミ化も触媒すること、その際リン酸がセリンの2位水素の引き抜きと付加を触媒する一般酸塩基触媒として機能することを見出した。今年度はさらに、D-Ser生合成を担うセリンラセマーゼが基質であるセリンと反応し、酵素自殺基質反応様の修飾を受けることを、放射標識したセリンの酵素タンパク質への取り込みにより確認した。このほか、ヒト尿中のD-Asp濃度とクレアチニンの比が、各個人や性別、あるいは採尿の時期にかかわらずほぼ一定になることを見出すとともに、腎疾患のリスクを有する患者の尿における同比の解析を開始した。

Research Progress Status

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (9 results)

All 2019 2018

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (6 results) (of which Invited: 1 results)

  • [Journal Article] Conserved Pyridoxal 5'-Phosphate Binding Protein YggS Impacts Amino Acid Metabolism through Pyridoxine 5'-Phosphate in Escherichia coli2019

    • Author(s)
      Ito T, Yamamoto K, Hori R, Yamauchi A, Downs DM, Hemmi H, Yoshimura T.
    • Journal Title

      Appl Environ Microbiol.

      Volume: Mar22 Pages: 印刷中

    • DOI

      10.1128/AEM.00430-19.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] D-Serine Metabolism and Its Importance in Development of Dictyostelium discoideum2018

    • Author(s)
      Ito T, Hamauchi N, Hagi T, Morohashi N, Hemmi H, Sato YG, Saito T, Yoshimura T.
    • Journal Title

      Front Microbiol

      Volume: 9 Pages: 784

    • DOI

      10.3389/fmicb.2018.00784.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Urinary D-serine level as a predictive biomarker for deterioration of renal function in patients with atherosclerotic risk factors2018

    • Author(s)
      Iwakawa H, Makabe S, Ito T, Yoshimura T, Watanabe H.
    • Journal Title

      Biomarkers

      Volume: Oct 23 Pages: 1-7

    • DOI

      10.1080/1354750X.2018.1528632.

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] D-アミノ酸アミノトランスフェラーゼを用いたD-アミノ酸生合成酵素遺伝子のスクリーニング2019

    • Author(s)
      那須 涼麻、伊藤 智和、武藤 菜摘、坂神 晴菜、邊見 久、森 寿、吉村 徹
    • Organizer
      2019年度日本農芸化学会大会
  • [Presentation] Eukaryotic D-Serine Dehydratase and its Application to D-Serine Assay2018

    • Author(s)
      Tohru Yoshimura, Tomokazu Ito, Hisashi Hemmi
    • Organizer
      AC21 Joint mini‐symposium “Agro‐Industry Research for well‐being”
    • Invited
  • [Presentation] D-アミノ酸合成酵素の同定を目的としたファンクショナルクローニング系の開発2018

    • Author(s)
      伊藤智和,武藤菜摘,邊見久,吉村徹
    • Organizer
      日本ビタミン学会第 70 回大会
  • [Presentation] 新規D-アミノ酸生合成酵素のスクリーニング系の確立2018

    • Author(s)
      那須 涼麻、伊藤 智和、邊見 久、森 寿、吉村 徹
    • Organizer
      第14回D-アミノ酸研究会学術講演会
  • [Presentation] E.coli由来PLP結合タンパク質YggSの生理機能解明2018

    • Author(s)
      堀 蘭、伊藤 智和、邊見 久、吉村 徹
    • Organizer
      酵素補酵素研究会2018
  • [Presentation] YggS/PROSCファミリータンパク質のアミノ酸代謝制御機構の解析2018

    • Author(s)
      山本 佳奈, 伊藤 智和, 邊見 久, 吉村 徹
    • Organizer
      第91回日本生化学会大会

URL: 

Published: 2019-12-27  

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