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2017 Fiscal Year Annual Research Report

人為的ユビキチン化修飾による細胞機能の制御

Research Project

Project/Area Number 16H05090
Research InstitutionNational Institute of Health Sciences

Principal Investigator

内藤 幹彦  国立医薬品食品衛生研究所, 遺伝子医薬部, 部長 (00198011)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 服部 隆行  国立医薬品食品衛生研究所, 遺伝子医薬部, 主任研究官 (50377751)
Project Period (FY) 2016-04-01 – 2019-03-31
Keywordsユビキチン / プロテアソーム / タンパク質分解 / プロテインノックダウン / Hisタグ
Outline of Annual Research Achievements

我々は標的タンパク質を人為的にユビキチン化してプロテアソーム分解を誘導する各種のSNIPER化合物を開発してきたが、新規標的タンパク質を分解するSNIPER化合物を開発するためにはその標的タンパク質に結合するリガンドが必要である。しかし適当な結合リガンドが無いためにSNIPERを開発できない標的タンパク質も多い。そこでHisタグを付加した標的タンパク質を細胞に発現させ、Hisタグを認識するSNIPERで標的タンパク質をユビキチン化する実験系の開発を行った。まずHisタグと結合するNi-NTAをIAP antagonist(MV1)と繋いだSNIPER(His)を合成したが、分子全体の親水性が高くほとんど細胞内に取り込まれない事が明らかになった。そこでSNIPER(His)の細胞への透過性を高くするために、細胞膜透過性ペプチド(CPP)をSNIPER(His)に付加した化合物を各種合成し、そのHisタグ標的タンパク質分解誘導活性を調べた。その結果、R9及びTatペプチドを付加したSNIPER(His)はいずれも細胞内透過性が高まり、Hisタグ標的タンパク質を分解する活性を示した。また別の方法として、His-CPPペプチドを利用してSNIPER(His)を細胞内に取り込ませる方法を検討した。細胞の外でSNIPER(His)とHis-CPPの複合体を形成させて細胞内に取り込ませた後、細胞内でHis-CPPと乖離したSNIPER(His)に改変型HisタグであるCH6タグ標識タンパク質が結合してユビキチン化と分解を誘導するメカニズムである。CH6タグ標的タンパク質への結合を強固にするために、SNIPER(His)にマレイミド基を導入して共有結合する様に改変した。その結果、His-CPPペプチドを利用した実験系でもSNIPER(His)によってCH6タグ標的タンパク質の分解を誘導できることが明らかになった。これらの結果から、SNIPER(His)で細胞内のHisタグ(又はCH6タグ)標的タンパク質を分解する実験系を樹立する事ができた。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

標的タンパク質を包括的にユビキチン化する実験系として、Hisタグ標識タンパク質を細胞内に発現させ、SNIPER(His)を利用してユビキチン化を誘導する実験系を樹立する事ができた。この実験系を利用して各種標的タンパク質をユビキチン化することによって、標的タンパク質と細胞応答にどのような変化が見られるかを網羅的に解析する事ができるようになった。

Strategy for Future Research Activity

標的タンパク質にHisタグ等を付加して細胞に発現させ、タグを認識するSNIPERでユビキチン化を誘導することにより、標的タンパク質を細胞応答にどのような変化が現れるかを解析する。Hisタグの他にCRABPタグ等も検討する。標的タンパク質として、細胞質タンパク質だけでなく、細胞膜受容体タンパク質やミトコンドリアタンパク質等も順次検討する。

  • Research Products

    (20 results)

All 2018 2017 Other

All Journal Article (8 results) (of which Peer Reviewed: 8 results,  Open Access: 2 results) Presentation (11 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 4 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Simple and efficient knockdown of His-tagged proteins by ternary molecules consisting of a His-tag ligand, a ubiquitin ligase ligand, and a cell-penetrating peptide2017

    • Author(s)
      Hattori Takayuki、Okitsu Koyo、Yamazaki Norikazu、Ohoka Nobumichi、Shibata Norihito、Misawa Takashi、Kurihara Masaaki、Demizu Yosuke、Naito Mikihiko
    • Journal Title

      Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters

      Volume: 27 Pages: 4478~4481

    • DOI

      10.1016/j.bmcl.2017.08.001

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Development of a Small Hybrid Molecule That Mediates Degradation of His-Tag Fused Proteins2017

    • Author(s)
      Okitsu Koyo、Hattori Takayuki、Misawa Takashi、Shoda Takuji、Kurihara Masaaki、Naito Mikihiko、Demizu Yosuke
    • Journal Title

      Journal of Medicinal Chemistry

      Volume: 61 Pages: 576~582

    • DOI

      10.1021/acs.jmedchem.7b00413

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] SNIPER(TACC3) induces cytoplasmic vacuolization and sensitizes cancer cells to Bortezomib2017

    • Author(s)
      Ohoka Nobumichi、Nagai Katsunori、Shibata Norihito、Hattori Takayuki、Nara Hiroshi、Cho Nobuo、Naito Mikihiko
    • Journal Title

      Cancer Science

      Volume: 108 Pages: 1032~1041

    • DOI

      10.1111/cas.13198

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Development of a peptide-based inducer of protein degradation targeting NOTCH12017

    • Author(s)
      Ohoka Nobumichi、Misawa Takashi、Kurihara Masaaki、Demizu Yosuke、Naito Mikihiko
    • Journal Title

      Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters

      Volume: 27 Pages: 4985~4988

    • DOI

      10.1016/j.bmcl.2017.10.011

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Development of protein degradation inducers of oncogenic BCR-ABL protein by conjugation of ABL kinase inhibitors and IAP ligands2017

    • Author(s)
      Shibata Norihito、Miyamoto Naoki、Nagai Katsunori、Shimokawa Kenichiro、Sameshima Tomoya、Ohoka Nobumichi、Hattori Takayuki、Imaeda Yasuhiro、Nara Hiroshi、Cho Nobuo、Naito Mikihiko
    • Journal Title

      Cancer Science

      Volume: 108 Pages: 1657~1666

    • DOI

      10.1111/cas.13284

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Development of Protein Degradation Inducers of Androgen Receptor by Conjugation of Androgen Receptor Ligands and Inhibitor of Apoptosis Protein Ligands2017

    • Author(s)
      Shibata Norihito、Nagai Katsunori、Morita Yoko、Ujikawa Osamu、Ohoka Nobumichi、Hattori Takayuki、Koyama Ryokichi、Sano Osamu、Imaeda Yasuhiro、Nara Hiroshi、Cho Nobuo、Naito Mikihiko
    • Journal Title

      Journal of Medicinal Chemistry

      Volume: 61 Pages: 543~575

    • DOI

      10.1021/acs.jmedchem.7b00168

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Targeting the Allosteric Site of Oncoprotein BCR-ABL as an Alternative Strategy for Effective Target Protein Degradation2017

    • Author(s)
      Shimokawa Kenichiro、Shibata Norihito、Sameshima Tomoya、Miyamoto Naoki、Ujikawa Osamu、Nara Hiroshi、Ohoka Nobumichi、Hattori Takayuki、Cho Nobuo、Naito Mikihiko
    • Journal Title

      ACS Medicinal Chemistry Letters

      Volume: 8 Pages: 1042~1047

    • DOI

      10.1021/acsmedchemlett.7b00247

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Development of helix-stabilized cell-penetrating peptides containing cationic α,α-disubstituted amino acids as helical promoters2017

    • Author(s)
      Yamashita Hiroko、Misawa Takashi、Oba Makoto、Tanaka Masakazu、Naito Mikihiko、Kurihara Masaaki、Demizu Yosuke
    • Journal Title

      Bioorganic & Medicinal Chemistry

      Volume: 25 Pages: 1846~1851

    • DOI

      10.1016/j.bmc.2017.01.044

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] IAPを利用したプロテインノックダウン法の開発とがん原性タンパク質の分解2018

    • Author(s)
      内藤幹彦、大岡伸通、柴田識人、服部隆行
    • Organizer
      日本薬学会第138年会
    • Invited
  • [Presentation] Development of protein degradation inducers of oncogenic BCR-ABL protein by conjugation of ABL kinase inhibitors and IAP ligands2018

    • Author(s)
      Norihito Shibata, Naoki Miyamoto, Katsunori Nagai, Kenichiro Shimokawa, Tomoya Sameshima, Nobumichi Ohoka, Takayuki Hattori, Yasuhiro Imaeda, Hiroshi Nara, Nobuo Cho, Mikihiko Naito
    • Organizer
      日本薬学会第138年会
    • Invited
  • [Presentation] In vivo protein knockdown by chimeric small-compound SNIPERs.2018

    • Author(s)
      Nobumichi Ohoka, Yoko Morita, Katsunori Nagai, Kenichiro Shimokawa, Osamu Ujikawa, Ikuo Fujimori, Masahiro Ito, Youji Hayase, Keiichiro Okuhira, Norihito Shibata, Takayuki Hattori, Tomoya Samejima, Osamu Sano, Ryokichi Koyama, Yasuhiro Imaeda, Hiroshi Nara, Nobuo Cho, Mikihiko Naito
    • Organizer
      日本薬学会第138年会
    • Invited
  • [Presentation] Degradation of target proteins by SNIPER compounds recruiting IAP ubiquitin ligases2017

    • Author(s)
      Mikihiko Naito, Nobumichi Ohoka, Norihito Shibata, Takayuki Hattori
    • Organizer
      EMBO conference Ubiquitin and SUMO
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Protein knockdown by SNIPER compounds recruiting IAP ubiquitin ligases2017

    • Author(s)
      Mikihiko Naito
    • Organizer
      2017 Chinese Medicinal Chemistry Symposium, CPA-EFMC International Symposium on Medicinal Chemistry
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Degradation of oncogenic proteins by SNIPER compounds.2017

    • Author(s)
      Mikihiko Naito, Nobumichi Ohoka, Norihito Shibata, Takayuki Hattori
    • Organizer
      第76回日本癌学会学術総会
  • [Presentation] 芳香族炭化水素受容体ユビキチンリガーゼをリクルートする新しいプロテインノックダウン化合物の開発2017

    • Author(s)
      大岡伸通、柴田識人、服部隆行、内藤幹彦
    • Organizer
      第76回日本癌学会学術総会
  • [Presentation] Targeting the allosteric site of oncogenic BCR-ABL protein as an alternative strategy for effective protein degradation2017

    • Author(s)
      Norihito Shibata, Kenichiro Shimokawa, Tomoya Sameshima, Naoki Miyamoto, Osamu Ujikawa, Hiroshi Nara, Nobumichi Ohoka, Takayuki Hattori, Nobuo Cho, Mikihiko Naito
    • Organizer
      第76回日本癌学会学術総会
  • [Presentation] 低コピーEGFR L858R変異アレルを有する細胞の作製とEGFR阻害剤感受性の解析2017

    • Author(s)
      築茂由則、鈴木孝昌、内藤幹彦
    • Organizer
      第76回日本癌学会学術総会
  • [Presentation] NCCオンコパネルの90遺伝子を網羅する変異細胞株パネルの作製2017

    • Author(s)
      鈴木孝昌、築茂由則、内藤幹彦、小原有弘
    • Organizer
      第76回日本癌学会学術総会
  • [Presentation] IAPアンタゴニストLCL161誘導体を導入したSNIPERによる効果的なプロテインノックダウン2017

    • Author(s)
      大岡伸通、奥平桂一郎、伊東昌宏、永井克典、柴田識人、服部隆行、宇治川治、下川賢一郎、佐野修、小山亮吉、今枝泰宏、奈良洋、長展生、内藤幹彦
    • Organizer
      第21回日本がん分子標的治療学会 学術集会
  • [Remarks] 国立医薬品食品衛生研究所遺伝子医薬部 研究概要

    • URL

      http://www.nihs.go.jp/mtgt/research.html

URL: 

Published: 2018-12-17  

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