2018 Fiscal Year Annual Research Report
Differentiation and time specific gene Identification by the mapping of transcriptional start site
| Project/Area Number |
16H05159
|
|---|
| Research Institution | Nagasaki University |
|---|
Principal Investigator |
吉浦 孝一郎 長崎大学, 原爆後障害医療研究所, 教授 (00304931)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2016-04-01 – 2019-03-31
|
| Keywords | 5'末端 / 全長RNA / 新規遺伝子 |
|---|
| Outline of Annual Research Achievements |
転写量の少ないRNAの５’末端部を効率的にクローニングすることが目的である。利用テクノロジーは，M-MLV（マウス白血病ウイルス）由来の逆転写酵素を利用したswitching 法による5’末端へのリンカー付加（SMART法）である。
当初1年目の予定は，5’末端へのリンカー付加の効率化のみを考えていたが，商品化されたキットではなく自作プライマー等でSwitching 法を行った際に，concatamer形成が大きな問題であることがわかった。concatamer形成をおこさないオリゴヌクレオチド改良や修飾法を試して，技術的な問題の克服を目指した。concatamer形成阻害のために isocytosine，isoguanosine を含んだオリグヌクレオチドの利用が，論文化されている。代替法としてのミスマッチオリゴを利用する方法を探ったが，効率の良い方法を開発することは出来なかった。
市販されている方法によって，5'末端部のクローニングを行う事で，虹彩，眼前方部の発生に関与する新規遺伝子を同定することが出来た。この遺伝子は，疾患の原因遺伝子であるが，同じ遺伝子が原因で，別の病気を発症させる特殊な遺伝子である。短い転写産物が，既存遺伝子のエクソン途中から発現が開始されているようで，特別な5'末端部のクローニングを行わなければ同定することが出来なかった。本成果は，現在論文準備中である。
当初目的としていた，配偶子形成時期の未分化な 生殖堤細胞や，膵B細胞の RNA シーケンスまで達成することは出来なかったが，疾患関連の新規遺伝子を同定する事が出来た。
|
| Research Progress Status |
平成30年度が最終年度であるため、記入しない。
|
| Strategy for Future Research Activity |
平成30年度が最終年度であるため、記入しない。
|
-
[Journal Article] A Hot-spot Mutation in CDC42 (p.Tyr64Cys) and Novel Phenotypes in a Third Patient with Takenouchi-Kosaki Syndrome.2018
Author(s)
Motokawa M, Watanabe S, Nakatomi A, Kondoh T, Matsumoto T, Morifuji K, Sawada H, Nishimura T, Nunoi H, Yoshiura KI, Moriuchi H, Dateki S.
-
Journal Title
Journal of Human Genetics
Volume: 63
Pages: 357-363
DOI
Peer Reviewed
-
-
[Journal Article] MicroRNA-204-3p inhibits lipopolysaccharide-induced cytokines in familial Mediterranean fever via the phosphoinositide 3-kinase γ pathway.2018
Author(s)
Koga T, Migita K, Sato T, Sato S, Umeda M, Nonaka F, Fukui S, Kawashiri SY, Iwamoto N, Ichinose K, Tamai M, Nakamura H, Origuchi T, Ueki Y, Masumoto J, Agematsu K, Yachie A, Yoshiura KI, Eguchi K, Kawakami A.
-
Journal Title
Rheumatology (Oxford)
Volume: 57
Pages: 718-726
DOI
Peer Reviewed
-
[Journal Article] A novel heterozygous GLI2 mutation in a patient with congenital urethral stricture and renal hypoplasia/dysplasia leading to end-stage renal failure.2018
Author(s)
Shirakawa T, Nakashima Y, Watanabe S, Harada S, Kinoshita M, Kihara T, Hamasaki Y, Shishido S, Yoshiura KI, Moriuchi H, Dateki S.
-
Journal Title
CEN Case Rep
Volume: 7
Pages: 94-97
DOI
Peer Reviewed
-
-
[Journal Article] Clonal dynamics in a case of acute monoblastic leukemia that later developed myeloproliferative neoplasm.2018
Author(s)
Sato S, Itonaga H, Taguchi M, Sawayama Y, Imanishi D, Tsushima H, Hata T, Moriuchi Y, Mishima H, Kinoshita A, Yoshiura KI, Miyazaki Y.
-
Journal Title
nt J Hematol
Volume: 108
Pages: 213-217
DOI
Peer Reviewed
-
-
[Journal Article] Patients with SATB2-associated syndrome exhibiting multiple odontomas.2018
Author(s)
Kikuiri T, Mishima H, Imura H, Suzuki S, Matsuzawa Y, Nakamura T, Fukumoto S, Yoshimura Y, Watanabe S, Kinoshita A, Yamada T, Shindoh M, Sugita Y, Maeda H, Yawaka Y, Mikoya T, Natsume N, Yoshiura KI.
-
Journal Title
Am J Med Genet
Volume: 176
Pages: 2614-2622
DOI
Peer Reviewed
-
[Journal Article] Comprehensive methylation analysis of imprinting-associated differentially methylated regions in colorectal cancer.2018
Author(s)
Hidaka H, Higashimoto K, Aoki S, Mishima H, Hayashida C, Maeda T, Koga Y, Yatsuki H, Joh K, Noshiro H, Iwakiri R, Kawaguchi A, Yoshiura KI, Fujimoto K, Soejima H.
-
Journal Title
Clin Epigenetics
Volume: 10
Pages: 150only
DOI
Peer Reviewed
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
[Presentation] Analysis of mice varying a novel mutation in a proteasome subunit gene identified in an autoinflammatory disease -Proteasome-associated autoinflammation and immunodeficiency disease (PRAID)2018
Author(s)
Toshiya Ozasa, Hiroaki Hemmi, Akira Kinoshita, Takashi Kato, Takashi Orimo, Izumi Sasaki, Yuri Fukuda-Ohta, Noriko Kinjo, Koh-Ichiro Yoshiura, Tsunehiro Mizushima, Nobuo Kanazawa, Tsuneyasu Kaisho.
Organizer
第47回日本免疫学会学術集会
-
[Presentation] Impaired development of dendritic cells in proteasome subunit mutant mice．2018
Author(s)
Hiroaki Hemmi, Toshiya Ozasa, Akira Kinoshita, Takashi Kato, Takashi Orimo, Izumi Sasaki, Yuri Fukuda-Ohta, Noriko Kinjo, Koh-Ichiro Yoshiura, Tsunehiro Mizushima, Nobuo Kanazawa, Tsuneyasu Kaisho.
Organizer
第47回日本免疫学会学術集会
-
