2018 Fiscal Year Annual Research Report
脳リンパ腫のゲノム解析成果を基盤とした分子標的創薬・バイオマーカー研究
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16H05441
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| Research Institution | Kyoto Prefectural University of Medicine |
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Principal Investigator |
山中 龍也 京都府立医科大学, 医学部, 教授 (20323991)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
池中 一裕 生理学研究所, 生体機能調節研究領域, 特別協力研究員 (00144527) [Withdrawn]
高島 康郎 京都府立医科大学, 医学(系)研究科(研究院), 助教 (50621083)
吉田 健一 京都大学, 医学研究科, 助教 (50738226) [Withdrawn]
川口 淳 佐賀大学, 医学部, 教授 (60389319)
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| Project Period (FY) |
2016-04-01 – 2021-03-31
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| Keywords | 脳リンパ腫 / エクソーム解析 / RNA seq 解析 / MTX 耐性 / 標的分子 / 分子標的治療 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
中枢神経系原発悪性リンパ腫の腫瘍組織90例のエクソーム解析と30例トランスクリプトーム解析から、遺伝子変異のLandscapeを明らかにした。変異遺伝子、トランスクリプトームの各プロファイルと患者生存期間および治療反応性との相関の検討から、バイオマーカー、新規の分子標的薬開発のための標的分子の探索を進めている。中枢神経系原発悪性リンパ腫の腫瘍組織の免疫関連遺伝子の遺伝子発現解析から予後と相関を示す免疫チェックポイント分子の同定を進めている。また、腫瘍組織のmiRNA発現プロファイル解析から予後と相関する分子の同定も進めている。さらに、腫瘍組織の免疫関連遺伝子のmiRNAから予後と相関を示す免疫関連miRNAの解析も進めている。
脳リンパ腫細胞株HKBML, TKを用いて、MTX耐性細胞株の樹立を行い、新規の分子標的薬によるMTX耐性細胞の増殖阻害効果等の解析を進めている。MTX耐性細胞株のメタボローム解析、qPCR解析等から耐性の軸となるシグナル伝達経路を同定しつつある。MTX耐性細胞株の分子標的薬によるシグナル阻害による増殖阻害効果を検証している。また、脳リンパ腫細胞株のMTX耐性および非耐性株を用いた、in vivoのモデルを用いて耐性化の機序を確認しつつMTX耐性を克服する治療法の開発を目指した研究を進めている。
今後は、エピゲノム解析を視野に研究を進める。
中枢神経系原発悪性リンパ腫は組織サンプルの収集の困難さから、我々のようなゲノム解析を基盤とした研究を行っている施設は国際的にも少なく、研究の新規制・独自性が期待できる。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
ゲノム解析のデータを用いた統計解析等から標的分子を絞り込む研究は順調に進んでいる。脳リンパ腫のMTX耐性細胞の樹立に成功し、それを用いた解析が順調に進んだ。
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| Strategy for Future Research Activity |
今後は、標的分子の確認をvalidationコホートを用いて解析する。MTX耐性機構の解析は動物実験をさらに進める。
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