2018 Fiscal Year Annual Research Report
Formation model of Bacteroidia bacteria pilus-X-ray crystal structure analysis and molecular reconstruction experiment-
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16H05504
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| Research Institution | Nagasaki University |
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Principal Investigator |
中山 浩次 長崎大学, 医歯薬学総合研究科(歯学系), 客員研究員 (80150473)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
今田 勝巳 大阪大学, 理学研究科, 教授 (40346143)
内藤 真理子 長崎大学, 医歯薬学総合研究科(歯学系), 准教授 (20244072)
庄子 幹郎 長崎大学, 医歯薬学総合研究科(歯学系), 助教 (10336175)
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| Project Period (FY) |
2016-04-01 – 2019-03-31
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| Keywords | 歯周病関連細菌 / 線毛 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
１．平成29年度はP. gingivalis TDC60株（II型Fim線毛）およびATCC33277株（I型Fim線毛）のFimAタンパク質のＸ線結晶構造解析を行い、II型FimAタンパク質では1.6Åの解像度で構造が決定できた。I型FimAタンパク質については2.5Å程度の解像度の結果が得られていたが、本年度はI型FimAタンパク質のＸ線結晶構造解析の解像度を高め、2.1Åの解像度での結果を得た。I型およびII型の立体構造を比較し、分子表面に露出している6つの部分に構造の相違を認めた。現在、どの部分が病原性に重要であるかを調べている。
２．平成29年度は線毛様構造をとるI型FimA重合体をクライオ電子顕微鏡にて観察し、画像処理技術を用いて4.5Å程度の解像度の像を得ていたが、本年度はさらに解析を進め、3.0Åの解像度の結果を得た。I型FimAのX線結晶構造解析の結果をクライオ電顕で得られた像に当てはめたところ、C末端ストランドがドナーストランドとしてドナーストランド交換による重合が生じていることを可視化できた。現在、この成果に関する論文を作成している。
３．Fim線毛のマイナータンパク質（FimC, FimD, FimE）の結晶構造についても解析を進めており、現在、FimCタンパク質の構造が最も進んでいる。その他のタンパク質についても継続して解析を進めている。
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| Research Progress Status |
平成30年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
平成30年度が最終年度であるため、記入しない。
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Research Products
(9 results)
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[Journal Article] Immunoglobulin-like domains of the cargo proteins are essential for protein stability during secretion by the type IX secretion system.2018
Author(s)
Sato K, Kakuda S, Yukitake H, Kondo Y, Shoji M, Takebe K, Narita Y, Naito M, Nakane D, Abiko Y, Hiratsuka K, Suzuki M, Nakayama K.
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Journal Title
Mol Microbiol.
Volume: 110(1)
Pages: 64-81
DOI
Peer Reviewed
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