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2018 Fiscal Year Annual Research Report

Response of gas metabolism and microbial community in soil in the permafrost zone of northeastern Siberia to the environmental change

Research Project

Project/Area Number 16H05618
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

村瀬 潤  名古屋大学, 生命農学研究科, 教授 (30285241)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 杉本 敦子  北海道大学, 北極域研究センター, 教授 (50235892)
Project Period (FY) 2016-04-01 – 2019-03-31
Keywords北東シベリア / ガス代謝 / 地球温暖化 / 微生物群集 / 湿地
Outline of Annual Research Achievements

北東シベリア タイガ‐ツンドラ境界域の湿地土壌の原核生物群集を16S rRNAを対象としたアンプリコンシークエンスにより解析した。16S rRNAを発現する活性の高い原核生物群集は、前年度実施したDNA解析に基づく群集とは大きく異なった。また、植生(コケ、スゲ)や土壌層位間でも群集構造は異なった。RNAに基づく群集ではActinobacteriaとユーリアーキオータの優占度が高くなった。特にメタン生成古細菌は、DNAに基づく群集での優占度は0.3-2.4%程度であったが、RNAに基づく群集の中では最大で14%を占めており、メタン生成古細菌の高い活性が示唆された。Methanosarcina, MethanosaetaがRNAを発現する優占グループで、DNAで優占したMethanomicrobiales, MethanocellalesはRNA解析に基づく群集の中では優占度が低かった。メタン酸化細菌は、群集全体の中の優占度はDNA, RNAともに2%以下で、典型的なType I, IIメタン酸化菌の比率は低かった。DNAで優占したMethylacidiphilalesはRNAではそれほど優占度は高くない一方、CrenothrixはRNAレベルの解析でも優占度が高かった。
13C標識メタンを添加した培養した土壌からDNAを抽出、分画後、13Cを取り込んだ群集を解析した。最も優占したのはCrenothrixであり、本グループがメタンを積極的に利用していることが裏付けられた。スゲ植生の土壌ではMethylomonasがCrenothrixに次いで優占することが示された。培養温度を5℃から15℃に上昇するとCrenothrixの優占度は著しく低下し、Methlymomonas, Methylosinusのほか、メタン酸化細菌以外の微生物群によるメタン由来炭素の取り込みが顕著となった。

Research Progress Status

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (5 results)

All 2019 2018 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (2 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 1 results) Presentation (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results)

  • [Int'l Joint Research] Inst for Biol Problems of Cryolithozone/North-Eastern Federal University(ロシア連邦)

    • Country Name
      RUSSIA FEDERATION
    • Counterpart Institution
      Inst for Biol Problems of Cryolithozone/North-Eastern Federal University
  • [Journal Article] Usability of water surface reflectance for the determination of riverine dissolved methane during extreme flooding in northeastern Siberia2019

    • Author(s)
      Morozumi Tomoki、Shingubara Ryo、Murase Jun、Nagai Shin、Kobayashi Hideki、Takano Shinya、Tei Shunsuke、Fan Rong、Maximov Trofim C.、Sugimoto Atsuko
    • Journal Title

      Polar Science

      Volume: 印刷中 Pages: 印刷中

    • DOI

      https://doi.org/10.1016/j.polar.2019.01.005

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Multi-year effect of wetting on CH4 flux at taiga-tundra boundary in northeastern Siberia deduced from stable isotope ratios of CH42019

    • Author(s)
      Shingubara, R. Sugimoto, A. Murase, J. Iwahana, G. Tei, S. Liang, M. Takano, S. Morozumi, T. Maximov, T. C.
    • Journal Title

      Biogeosciences

      Volume: 16 Pages: 755-768

    • DOI

      https://doi.org/10.5194/bg-16-755-2019

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] Microflora in Arctic Wetland Soils of a Taiga-Tundra Ecotone in Northeastern Siberia2018

    • Author(s)
      Jun Murase, Atsuko Sugimoto, Ryo Shingubara, Trofim C. Maximov
    • Organizer
      10th Asian Symposium on Microbial Ecology
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Intra-seasonal variations in CH4 emissions observed by automatic and manual chambers, and in dissolved CH4 concentration at taiga-tundra boundary in northeastern Siberia2018

    • Author(s)
      Ryo Shingubara, Tomoki Morozumi, Shunsuke Tei, Jun Murase, Shinya Takano, Rong Fan, Trofim C. Maximov and Atsuko Sugimoto
    • Organizer
      日本地球惑星科学連合2018年大会

URL: 

Published: 2019-12-27  

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