2017 Fiscal Year Annual Research Report
Investigation of latent pathogenic viruses in Latin America and South-eastern Asia by virome analysis
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16H05805
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| Research Institution | Hokkaido University |
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Principal Investigator |
澤 洋文 北海道大学, 人獣共通感染症リサーチセンター, 教授 (30292006)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
大場 靖子 北海道大学, 人獣共通感染症リサーチセンター, 講師 (60507169)
佐々木 道仁 北海道大学, 人獣共通感染症リサーチセンター, 特任助教 (70609403)
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| Project Period (FY) |
2016-04-01 – 2020-03-31
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| Keywords | ウイルス / ゲノム解析 / 新興・再興感染症 / キューバ / 台湾 / インドネシア / 蚊 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究は現在申請者が有している国際ネットワークを活用し、調査フィールドを線として繋げ、Virome解析手法等を用いて新興・再興感染症の原因となる新規及び既知の病原体の分布状況を把握すること、得られた情報を既得の情報と比較することにより病原性ウイルスの分布・進化・生活環を把握することを目指す。
平成29年度は8月に研究分担者の大場靖子講師、研究協力者のWilliam Hall教授と共にキューバ国を訪問し、ハバナに位置する熱帯医学研究所（Instituto de Medicina Tropical Pedro Kouri）において今後のアルボウイルス感染症に関する共同研究の打ち合わせを実施した。
また、10月には研究分担者の佐々木道仁助教と共に、インドネシアのボゴール農業大学の獣医学部を訪問し、Agus Setiyono博士、Ekowati Handharyani博士と面会して、共同研究を実施するにあたってのインドネシア政府機関への書類の申請の手続きについて確認し、実際に手続きを進めることを合意した。
さらに、平成28年度に台湾中興大学獣医系細菌学研究室のShyu Ching-Lin博士、昆虫学系医学昆虫学研究室のTu Wu-Chun博士との共同研究で実施した調査で採集した蚊から抽出した核酸を用いて、RT-PCR法、および次世代シーケンサーの手法を用いてウイルスの探索を実施し、コガタアカイエカ、ネッタイイエカから新規のブニヤウイルスを検出した。このうち、ネッタイイエカから検出したブニヤウイルスは全ゲノム塩基配列を決定した。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
・平成28年8月12日から18日にかけて、研究分担者の大場靖子講師、研究協力者のWilliam Hall教授と共にキューバ国を訪問し、ハバナに位置する熱帯医学研究所において、アルボウイルスに関する診断法について、またこれまで実施した疫学研究に関する実績を紹介した。また、熱帯医学研究所からも現在の研究内容等についての説明を受け、その状況を把握した上で、今後のアルボウイルス感染症に関する共同研究に関する可能性に関して打ち合わせを実施した。
・佐々木道仁助教と共に、10月16日から10月19日にかけて、インドネシアのボゴール農業大学の獣医学部を訪問して、Agus Setiyono博士、Ekowati Handharyani博士と面会して、両博士との共同研究を実施するにあたってのインドネシア政府機関への書類の申請の手続きについて確認し、実際に手続きを進めることを合意した。また、ボゴール農業大学構内での蚊の発生状況をHandharyani博士と共に確認した。
・平成28年度に台湾中興大学獣医系細菌学研究室のShyu Ching-Lin博士、昆虫学系医学昆虫学研究室のTu Wu-Chun博士との共同研究で実施した疫学調査において採集した蚊から抽出した核酸を用いて、RT-PCR法、および次世代シーケンサーを用いてウイルスゲノムの解析を実施し、新規のフレボウイルス等を検出した。
以上、平成29年度においては研究計画はおおむね順調に進展していると判断される。
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| Strategy for Future Research Activity |
平成30 年度においては、以下の研究を実施する。
・中南米のキューバ国のハバナに位置する熱帯医学研究所、もしくはブラジル国のリオデジャネイロのOswaldo Cruz Foundation (FioCruz)研究所との、アルボウイルス感染症等に関する共同研究計画の実施に向けて交渉を継続する。
・インドネシアのボゴール農業大学獣医学部と進めているウイルスを対象とした疫学調査の共同研究計画の実施許可の認証を受けるべく、共同研究者であるAgus Setiyono博士、Ekowati Handharyani博士と協力して手続きを進める。
・台湾の中興大学と共同研究として実施している蚊を対象としたウイルス疫学調査で得られたフレボウイルスの保有状況について、蚊の採集数を増やして検討する。
・ベトナムの国立衛生疫学研究所内に設置されたThe Ireland Vietnam Blood Borne Virus Initiative (IVVI)で採集している蚊を用いたウイルスの解析の実施に向けた計画を立案する。
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Research Products
(10 results)
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[Journal Article] Detection of novel gammaherpesviruses from fruit bats in Indonesia2018
Author(s)
Wada Yuji、Sasaki Michihito、Setiyono Agus、Handharyani Ekowati、Rahmadani Ibenu、Taha Siswatiana、Adiani Sri、Latief Munira、Kholilullah Zainal Abidin、Subangkit Mawar、Kobayashi Shintaro、Nakamura Ichiro、Kimura Takashi、Orba Yasuko、Sawa Hirofumi
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Journal Title
Journal of Medical Microbiology
Volume: 67
Pages: 415～422
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
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