2018 Fiscal Year Annual Research Report
全ゲノム重複がゲノム構造進化に与える影響の包括的解明
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16H06154
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
岩崎 渉 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 准教授 (50545019)
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| Project Period (FY) |
2016-04-01 – 2020-03-31
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| Keywords | バイオインフォマティクス / ゲノム進化 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
真核生物のゲノム構造進化に「ゲノム重複」はどのような本質的役割を果たすのか。その詳細解明のボトルネックは、全ゲノム重複が“繰り返し実験”をすることができない稀なイベントであることにあった。この背景のもと、本研究では、ゲノム生物学史上極めてユニークなデータである「近縁系統で独立に全ゲノム重複を経験した真菌群」のゲノムデータを徹底的に解析することを目的とした。とりわけ、真核生物のゲノム進化にゲノム重複が果たす役割を、遺伝子セットの進化、遺伝子の並び順（シンテニー）の進化、遺伝子配列の進化の３つの観点から、飛躍的に高い解像度で解明することを目的としている。平成30年度は、一昨年度・昨年度に引き続き、本研究でターゲットとするTrichosporon属４種のゲノムデータの質を向上し、スーパーコンピュータも用いつつ、ゲノムアセンブリおよび遺伝子アノテーションの改善を行った。さらに、昨年度に取得したトランスクリプトームシーケンスデータをゲノムデータに対してマッピングし、遺伝子アノテーションを改善しつつある。また、配列進化解析と発現量解析を組み合わせることで、ゲノム重複後の遺伝子配列の変化がゲノムワイドに遺伝子発現調節メカニズムに与える影響を解析し、現在その結果について精査を行なっている。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
予定通り研究が進展している。
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| Strategy for Future Research Activity |
翌年度も、予定通り研究を推進する。
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