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2017 Fiscal Year Annual Research Report

コヒーシンリングによる姉妹染色体接着形成メカニズムの解明

Research Project

Project/Area Number 16H06160
Research InstitutionNational Institute of Genetics

Principal Investigator

村山 泰斗  国立遺伝学研究所, 新分野創造センター, 准教授 (60531663)

Project Period (FY) 2016-04-01 – 2019-03-31
Keywords染色体動態 / 染色体分配 / 姉妹染色体接着 / SMC複合体 / コヒーシン / 試験管内再構成
Outline of Annual Research Achievements

コヒーシンは、最も重要な染色体構造形成タンパク質のひとつで、姉妹染色体接着を形成し、正確な染色体分配に必須である。SMC サブユニットを中核とする巨大なリング状構造のATPase複合体であるコヒーシンは、そのトポロジーを利用して、リングの内側に通すかたちでDNAと結合し (トポロジカルなDNA結合)、2本以上の DNAを束ねることによって、姉妹染色体接着をはじめとした、染色体高次構造の形成を行うと考えられている。本研究は、我々が構築した精製タンパク質を用いたコヒーシンの機能的なDNA結合反応の試験管内再構成実験を元に、姉妹染色体接着の形成機構について明らかにすることを目指す。
2017本年度は、コヒーシンの新規のDNA結合活性について重点的に解析し、大きな成果があった。つまり、1) コヒーシンはトポロジカルにDNA結合に結合した状態で、もう一本のDNAと結合し、DNAとDNAのつなぎとめを行うこと、2) 2本目のDNA結合は1本目の結合と同様にローダー複合体とATPに依存すること、3) 2本目のDNA結合は単鎖DNAと不安定な結合からスタートし、DNA合成によって安定な2本鎖と2本鎖DNAのつなぎとめに変換されることを示した。このコヒーシンの素活性は、姉妹染色体間接着の形成機構を原理的に説明しうるものである。また、出芽酵母を使った遺伝学的解析から、単鎖DNA領域が姉妹染色体接着の形成にはたらくことを示唆する結果を得た。以上の得られた知見を纏め、論文として発表した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

姉妹染色体間接着は、通常の細胞周期ではDNA複製に共役して形成されるが、一方で、DNA2本鎖切断等のDNA損傷に応答し形成される機構も存在する。本研究で発見したコヒーシンの単鎖DNA依存的な2本目のDNAと結合活性は、これら異なる姉妹染色体接着形成経路について、統一的な分子モデルで説明しうる。すなわち、複製フォークにおいては、リーディング鎖の2本鎖DNAとラギング鎖にできる単鎖DNAとの間で、DNA2本鎖切断においては、切断箇所のプロセシングによって形成される単鎖DNAとドナーとなる無傷の姉妹DNAとの間において、コヒーシンが2本目のDNA結合反応によって姉妹DNA間の繋ぎ止めを形成するというものである。実際に、出芽酵母において、単鎖DNA結合タンパク質複合体RPAを過剰発現させると、姉妹染色体接着の形成が抑制され、逆にRPAの変異によって、ctf18変異株の姉妹染色体接着形成の異常が抑圧された。これらの遺伝学的解析は、単鎖DNAが実際に酵母細胞内において姉妹染色体接着の形成に関与することを示唆している。以上から、本研究の発見は、コヒーシンの姉妹染色体接着形成の分子機構について新たなパライダイムを提唱する。

Strategy for Future Research Activity

コヒーシンによるDNAとDNAのつなぎとめ構造は、姉妹染色体間接着の分子実体であると考えられる。2018年度は、この構造を可視化することに注力する。コヒーシン -DNAの複合体を分離精製し、分子間力顕微鏡によって、その構造を明らかにする。現在、AFM解析に適したサンプルを得るために、現在大きさの異なる環状DNAについてコヒーシンとのトポロジカルな結合反応の効率について検討している。さらに変異コヒーシン・補助タンパク質についても解析を進め、これまでの成果を論文として報告する予定である。

  • Research Products

    (13 results)

All 2018 2017 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (5 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 1 results) Presentation (6 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 3 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] フランシスクリック研究所(英国)

    • Country Name
      UNITED KINGDOM
    • Counterpart Institution
      フランシスクリック研究所
  • [Journal Article] Establishment of DNA-DNA Interactions by the Cohesin Ring2018

    • Author(s)
      Murayama Yasuto、Samora Catarina P.、Kurokawa Yumiko、Iwasaki Hiroshi、Uhlmann Frank
    • Journal Title

      Cell

      Volume: 172 Pages: 465~477

    • DOI

      10.1016/j.cell.2017.12.021

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Two three-strand intermediates are processed during Rad51-driven DNA strand exchange2017

    • Author(s)
      Ito Kentaro、Murayama Yasuto、Takahashi Masayuki、Iwasaki Hiroshi
    • Journal Title

      Nature Structural & Molecular Biology

      Volume: 25 Pages: 29~36

    • DOI

      10.1038/s41594-017-0002-8

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Fundamental cell cycle kinases collaborate to ensure timely destruction of the synaptonemal complex during meiosis2017

    • Author(s)
      Argunhan Bilge、Leung Wing‐Kit、Afshar Negar、Terentyev Yaroslav、Subramanian Vijayalakshmi V、Murayama Yasuto、Hochwagen Andreas、Iwasaki Hiroshi、Tsubouchi Tomomi、Tsubouchi Hideo
    • Journal Title

      The EMBO Journal

      Volume: 36 Pages: 2488-2509

    • DOI

      10.15252/embj.201695895

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] In vitro site-specific recombination mediated by the tyrosine recombinase XerA of Thermoplasma acidophilum2017

    • Author(s)
      Jo Minji、Murayama Yasuto、Tsutsui Yasuhiro、Iwasaki Hiroshi
    • Journal Title

      Genes to Cells

      Volume: 22 Pages: 646~661

    • DOI

      10.1111/gtc.12503

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The differentiated and conserved roles of Swi5-Sfr1 in homologous recombination2017

    • Author(s)
      Argunhan Bilge、Murayama Yasuto、Iwasaki Hiroshi
    • Journal Title

      FEBS Letters

      Volume: 591 Pages: 2035~2047

    • DOI

      10.1002/1873-3468.12656

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Cohesin mediates DNA-DNA tethering in vitro2017

    • Author(s)
      Yasuto Murayama, Catarina P. Samara, Frank Uhlmann.
    • Organizer
      The 2nd meeting on SMC proteins. Chromosome organizers from bacteria to human
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 試験管内再構成から予想される姉妹染色体接着の形成メカニズム2017

    • Author(s)
      村山泰斗
    • Organizer
      平成29年度 若手放射線生物学研究会
    • Invited
  • [Presentation] コヒーシンリングによる姉妹染色体接着形成メカニズムの解明2017

    • Author(s)
      村山泰斗
    • Organizer
      日本遺伝学会 第89回大会
  • [Presentation] コヒーシン複合体は2本のDNAと同時に結合する2017

    • Author(s)
      村山泰斗
    • Organizer
      第24回 DNA複製・組換え・修復ワークショップ
  • [Presentation] 姉妹染色体接着はどのように形成されるか?2017

    • Author(s)
      村山泰斗
    • Organizer
      2017年度 生命科学系学会合同年次大会
    • Invited
  • [Presentation] 精製したコヒーシンはATP依存的に2本のDNAと結合する2017

    • Author(s)
      村山泰斗
    • Organizer
      第35回 染色体ワークショップ・第16回 核ダイナミクス研究会 合同開催
  • [Remarks] 研究室紹介

    • URL

      https://www.nig.ac.jp/nig/ja/research/organization-top/laboratories/murayama

URL: 

Published: 2018-12-17  

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