2017 Fiscal Year Annual Research Report
Development of strategy to clarify pathophysiology of rare autoimmune diseases and lead to novel treatment through genetic studies
| Project/Area Number |
16H06251
|
|---|
| Research Institution | Institute of Physical and Chemical Research |
|---|
Principal Investigator |
寺尾 知可史 国立研究開発法人理化学研究所, 統合生命医科学研究センター, 上級研究員 (60610459)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2016-04-01 – 2018-03-31
|
| Keywords | 高安動脈炎 / 強皮症 / 再発性多発軟骨炎 |
|---|
| Outline of Annual Research Achievements |
本年度は高安動脈炎の解析を主に行った。高安動脈炎患者415人と健常者2170人のDNAを用いてIllumina社のHuman Core Exomeアレイを用いて関連を解析した。HLA領域についてはSNP2HLAソフトウェアを用いて詳細な解析を行った。また、高安動脈炎患者219人と健常人3770人を用いて追認解析を行った。
既知のHLA-B、IL12Bに加えて新規で6領域の関連を同定した(p<2.8x10-8)。HLA領域を詳細に検討した結果、HLA-B領域の関連は関連アレル2つをtagする一つの多型で説明可能である可能性が示された。また、新規疾患感受性領域であるNK細胞受容体であるLILRA3の多型はLILRA3の欠失をtagする多型であり、HLA-B*52存在下でのみ高安動脈炎と関連することが示された(epistasis効果)。HLA-B領域の多型はNK細胞のリガンドであるMICBの発現と関連があった。さらに、非HLA関連領域と細胞特異的enhancerのoverlapに関する解析で、NK細胞における重複が最も強く見られた。さらに、全ゲノムの解析結果を用いたpathway解析でもNK細胞pathwayの関連が強く見られた。
強皮症については新規DNA集積を行い、400例ほどの新規DNAを得た。再発性多発軟骨炎についてもDNA集積を継続している。
研究期間全体を通しては、高安動脈炎について世界最大の疾患DNAを集積して新規遺伝子を６つと責任細胞候補を同定し、国際メタ解析によって強皮症の新規遺伝子を2つ同定し日本最大の強皮症DNAを集積、さらに再発性多発軟骨炎の新規HLA関連アレルを同定した。
|
| Research Progress Status |
29年度が最終年度であるため、記入しない。
|
| Strategy for Future Research Activity |
29年度が最終年度であるため、記入しない。
|
-
[Journal Article] Genetic landscape of interactive effects of HLA-DRB1 alleles on susceptibility to ACPA(+) rheumatoid arthritis and ACPA levels in Japanese population.2017
Author(s)
Terao C, Okada Y, Ikari K, Kochi Y, Suzuki A, Ohmura K, Matsuo K, Taniguchi A, Kubo M, Raychaudhuri S, Yamamoto K, Yamanaka H, Kamatani Y, Mimori T, Matsuda F.
-
Journal Title
Journal of Medical Genetics
Volume: 54(12)
Pages: 853-858
DOI
Peer Reviewed / Int'l Joint Research
-
[Journal Article] Anti-centromere antibody exhibits specific distribution levels among anti-nuclear antibodies and may characterize a distinct subset in rheumatoid arthritis.2017
Author(s)
Kuramoto N, Ohmura K, Ikari K, Yano K, Furu M, Yamakawa N, Hashimoto M, Ito H, Fujii T, Murakami K, Nakashima R, Imura Y, Yukawa N, Yoshifuji H, Taniguchi A, Momohara S, Yamanaka H, Matsuda F, Mimori T, Terao C.
-
Journal Title
Scientific Reports
Volume: 7(1)
Pages: 6911
DOI
Peer Reviewed
-
[Journal Article] HLA-DRB1 Analysis Identified a Genetically Unique Subset within Rheumatoid Arthritis and Distinct Genetic Background of Rheumatoid Factor Levels from Anticyclic Citrullinated Peptide Antibodies.2017
Author(s)
Hiwa R, Ikari K, Ohmura K, Nakabo S, Matsuo K, Saji H, Yurugi K, Miura Y, Maekawa T, Taniguchi A, Yamanaka H, Matsuda F, Mimori T, Terao C.
-
Journal Title
Journal of Rheumatology
Volume: 45(4)
Pages: 470-480
DOI
Peer Reviewed
-
[Journal Article] Time-averaged disease activity fits better joint destruction in rheumatoid arthritis.2017
Author(s)
Tsuji H, Yano K, Furu M, Yamakawa N, Ikari K, Hashimoto M, Ito H, Fujii T, Yamamoto W, Ohmura K, Taniguchi A, Momohara S, Matsuda F, Allaart CF, Yamanaka H, Mimori T, Terao C.
-
Journal Title
Scientific Reports
Volume: 7(1)
Pages: 5856
DOI
Peer Reviewed
-
-
-
-
-
