2016 Fiscal Year Annual Research Report
Mechanistic role of KRAS amplification in gastroesophageal adenocarcinoma
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16H06259
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| Research Institution | Japanese Foundation for Cancer Research |
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Principal Investigator |
今村 裕 公益財団法人がん研究会, 有明病院 消化器外科, 副医長 (70583045)
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| Project Period (FY) |
2016-04-01 – 2019-03-31
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| Keywords | 食道胃接合部腺癌 / KRAS / 遺伝子増幅 / copy number variant |
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| Outline of Annual Research Achievements |
2005年から2014年の期間に、国内4施設にて切除手術を受けた食道胃接合部癌（Siewert type I～III）を対象とした。いずれも術前化学療法や術前放射線化学療法をうけていない症例を選択し、パラフィン包埋切片からDNA抽出が可能となり、以下のcopy number assayが可能となった45症例を対象とした。KRAS遺伝子増幅の評価はReal-time PCR法にて、Taqman copy number assay (KRAS, Human)を用いて検出した。TaqMan Copy Number Reference Assay, (RNase P, Human)、およびTaqMan Copy Number Reference Assay, (TERT, Human)を用い、KRAS copy numberはその比率（KRAS/RNaseP、もしくはKRAS/TERT）を用いて評価した。まず、KRAS/RNasePとKRAS/TERTの検討を行った。KRAS copy numberは3回計測した平均値を採用した。カットオフ値は2.7に設定した。4例を除く41例において、91.1%の高い一致率で、KRAS/RNasePとKRAS/TERTの二つのKRAS遺伝子増幅の有無が一致した。TERTは悪性腫瘍においてその遺伝子コピー数異常が指摘されていることから、今回の検討においてはRNasePをreferenceと用いることとした。次に、我々は、KRAS遺伝子増幅が実際のKRASタンパク発現に関与しているかどうかを検討したところ、KRAS遺伝子増幅あり群35症例のうち、17症例（38%）において免疫染色によるKRASタンパクの過剰発現を認めた。KRAS遺伝子増幅なし群よりも有意に高率であった（P<0.05）。以上より、食道胃接合部腺癌におけるKRAS遺伝子増幅異常を検出する上で、我々のKRAS copy number assayの妥当であると考えられた。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
計画はおおむね順調に推進しており、引き続き推進する。
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| Strategy for Future Research Activity |
国内4施設のサンプルを用い、免疫染色症例を増やし、さらにFISHも追加し、今回の我々のKRAS遺伝子増幅異常検出法が妥当かどうかを検討する。さらには、臨床病理学的因子、他のRAS-RAF系遺伝子異常としてのmutationを検討し、遺伝子増幅との関係性を検討する。
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Research Products
(6 results)
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[Journal Article] Preoperative controlling nutritional status (CONUT) is useful to estimate the prognosis after esophagectomy for esophageal cancer.2017
Author(s)
Yoshida N, Harada K, Baba Y, Kosumi K, Iwatsuki M, Kinoshita K, Nakamura K, Sakamoto Y, Miyamoto Y, Karashima R, Mima K, Sawayama H, Ohuchi M, Chikamoto A, Imamura Y, Watanabe M, Baba H.
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Journal Title
Langenbecks Arch Surg.
Volume: 402
Pages: 333-341
Peer Reviewed
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[Journal Article] Autophagy Inhibition Dysregulates TBK1 Signaling and Promotes Pancreatic Inflammation.2016
Author(s)
Yang S, Imamura Y, Jenkins RW, Canadas I, Kitajima S, Aref A, Brannon A, Oki E, Castoreno A, Zhu Z, Thai T, Reibel J, Qian Z, Ogino S, Wong KK, Baba H, Kimmelman AC, Pasca Di Magliano M, Barbie DA.
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Journal Title
Cancer Immunol Res.
Volume: 4
Pages: 520-530
Peer Reviewed / Int'l Joint Research
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