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2016 Fiscal Year Annual Research Report

天然基質の官能基の一部として誤認識される小分子を用いた酵素の誤作動と酵素反応制御

Research Project

Project/Area Number 16J02846
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

小野田 浩宜  名古屋大学, 理学研究科, 特別研究員(DC1)

Project Period (FY) 2016-04-22 – 2019-03-31
Keywords生体触媒 / 基質誤認識 / シトクロムP450 / ペルオキシゲナーゼ / 酸化反応 / 反応場制御 / 過酸化水素
Outline of Annual Research Achievements

多くの生体触媒は特定の原料を効率的に目的の分子に変換する為に高い基質特異性を示す。この高い基質特異性により生体触媒の汎用性が制限されている。152ファミリーに分類されているシトクロムP450は過酸化水素を利用して長鎖脂肪酸を特異的に酸化するCYP152ペルオキシゲナーゼである。私たちは長鎖脂肪酸のカルボキシ基を認識するCYP152ペルオキシゲナーゼに短いカルボン酸を誤認識させ、脂肪酸とは構造の異なる非天然基質の酸化反応を触媒させる「基質誤認識システム」を報告している。本申請課題は活性部位の構造が異なる新規のCYP152ペルオキシゲナーゼを準備し、基質誤認識システムを適応することで非天然基質の位置、立体選択的な酸化反応を制御する事を一つの目標にしている。本年度は好熱菌由来CYP152N1が長鎖脂肪酸のカルボキシル基と結合することを結晶構造解析により確認し、長鎖脂肪酸のα-位を(S)-選択的に水酸化することを確認した。また、酢酸存在下で非天然基質の酸化反応を触媒する事を確認した。枯草菌由来CYP152A1はスチレンを(S)-選択的、スフィンゴモナス ・パウシモビリス由来CYP152B1はスチレンを(R)-選択的にエポキシ化してスチレンオキシドを生成したのに対し、CYP152N1はスチレンオキシドよりもフェニルアセトアルデヒドを優先的に生成した。さらに、グルタミン酸のカルボキシル基をヘム上方に配置したCYP152B1 A245E変異体が短いカルボン酸の添加を必要とせずに非天然基質の酸化反応を行う事を報告し、CYP152N1 A243E変異体も同等の性質を示す事を確認した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

本申請課題では、CYP152ペルオキシゲナーゼに対して、位置、立体異性体を持つカルボン酸を誤認識させ、非天然基質の位置選択的な酸化半のを制御する事を第二の目標にしている。その為には、CYP152ペルオキシゲナーゼのカルボキシル基認識部位近傍の構造が酸化反応に影響を与える必要がある。既に、短いカルボン酸を代わりとしてCYP152B1に変異導入した245番目のグルタミン酸によってスチレンエポキシ化反応の立体選択性が反転することを報告している。本年度はCYP152N1 A243E変異体でも同との結果が得られる事を確認できたので、外部添加するカルボン酸の構造による反応場制御は可能であると考えられる。酢酸の代わりに乳酸やアラニン等の立体選択性を持つカルボン酸を用いて非天然基質の酸化反応を試したが、長鎖脂肪酸とはカルボキシル基のpKaが大きく異なる為に非天然基質の酸化反応がほとんど進行しなかった。位置異性体を持ち、置換基によるpKa変化が少ない安息香酸誘導体を用いた場合は、非天然基質を酸化が進行する事を確認した。また、既存のCYP152ペルオキシゲナーゼを鋳型とした非特異的変異導入の共同研究もスタートさせることができているので、当初の計画以上に進展していると考える。

Strategy for Future Research Activity

今後の研究目標は、安息香酸誘導体を用いてCYP152ペルオキシゲナーゼの非天然基質酸化反応を制御する事である。最終的にCYP152ペルオキシゲナーゼの変異導入を用いた反応制御と組み合わせることで、高選択的な酸化反応系を構築する。

  • Research Products

    (10 results)

All 2016 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (8 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 1 results)

  • [Int'l Joint Research] The University of Adelaide(オーストラリア)

    • Country Name
      AUSTRALIA
    • Counterpart Institution
      The University of Adelaide
  • [Journal Article] A substrate-binding-state mimic of H2O2-dependent cytochrome P450 produced by one-point mutagenesis and peroxygenation of non-native substrates2016

    • Author(s)
      Osami Shoji, Takashi Fujishiro, Kousuke Nishio, Yukiko Kano, Hiroshi Kimoto, Shih-Cheng Chien, Hiroki Onoda, Atsushi Muramatsu, Shota Tanaka, Ayumi Hori, Hiroshi Sugimoto, Yoshitsugu Shiro and Yoshihito Watanabe
    • Journal Title

      Catalysis Science & Technology

      Volume: 6 Pages: 5806-5811

    • DOI

      10.1039/C6CY00630B

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Acetate Anion Promoted Oxidation of Aromatic Compounds Catalyzed by Fatty Acid-Specific Peroxygenases2016

    • Author(s)
      Hiroki Onoda, Osami Shoji, Yoshihito Watanabe
    • Organizer
      8th Asian Biological Inorganic Chemistry Conference
    • Place of Presentation
      Auckland, The University of Auckland
    • Year and Date
      2016-12-04 – 2016-12-09
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 酢酸水溶液を用いた脂肪酸特異的ペルオキシゲナーゼの基質特性拡張2016

    • Author(s)
      小野田浩宜、荘司長三、渡辺芳人
    • Organizer
      第49回酸化反応討論会
    • Place of Presentation
      徳島、徳島大学 常三島キャンパス
    • Year and Date
      2016-11-12 – 2016-11-13
  • [Presentation] 脂肪酸特異的ペルオキシゲナーゼの基質結合状態を模した非特異的ペルオキシゲナーゼシステムの開発2016

    • Author(s)
      小野田浩宜
    • Organizer
      生物無機化学夏季セミナー
    • Place of Presentation
      交野市、グリーンビレッジ交野
    • Year and Date
      2016-09-01 – 2016-09-03
    • Invited
  • [Presentation] 長鎖脂肪酸と酢酸の誤認識を用いた脂肪酸ペルオキシゲナーゼの基質特異性変換2016

    • Author(s)
      小野田浩宜、荘司長三、渡辺芳人
    • Organizer
      第26回バイオ・高分子シンポジウム
    • Place of Presentation
      東京、東京工業大学 大岡山キャンパス
    • Year and Date
      2016-07-28 – 2016-07-29
  • [Presentation] 長鎖脂肪酸と酢酸の誤認識を利用した脂肪酸ペルオキシゲナーゼの基質特異性変換2016

    • Author(s)
      小野田浩宜、荘司長三、加納由紀子、渡辺芳人
    • Organizer
      第43回生体分子科学討論会
    • Place of Presentation
      名古屋市、名古屋大学 野依記念学術交流館
    • Year and Date
      2016-06-24 – 2016-06-25
  • [Presentation] 過酸化水素で駆動するシトクロムP450の結晶構造解析と脂肪酸のα-酸化的脱炭酸反応2016

    • Author(s)
      小野田浩宜、荘司長三、簡 士政、杉本 宏、城 宜嗣、渡辺芳人
    • Organizer
      統合物質創製化学研究推進機構 キックオフシンポジウム
    • Place of Presentation
      名古屋市、名古屋大学 野依記念物質科学研究館
    • Year and Date
      2016-06-23 – 2016-06-23
  • [Presentation] 過酸化水素駆動型シトクロムP450による脂肪酸の脱炭酸反応2016

    • Author(s)
      小野田浩宜、荘司長三、簡 士政、杉本 宏、城 宜嗣、渡辺芳人
    • Organizer
      第26回金属の関与する生体関連反応シンポジウム
    • Place of Presentation
      札幌市、北海道大学 学術交流会館
    • Year and Date
      2016-06-17 – 2016-06-18
  • [Presentation] 高濃度酢酸イオンを利用した脂肪酸水酸化酵素の基質特異性変換手法の開発2016

    • Author(s)
      小野田浩宜、荘司長三、杉本 宏、城 宜嗣、渡辺芳人
    • Organizer
      第16回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      福岡市、福岡国際会議場
    • Year and Date
      2016-06-07 – 2016-06-09

URL: 

Published: 2018-01-16  

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