2018 Fiscal Year Annual Research Report
骨髄炎感受性の新規遺伝的・免疫学的要因としてのHLA/KIR相互作用の解析
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16J04570
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Research Institution | National Center for Global Health and Medicine |
Principal Investigator |
矢原 寛子 国立研究開発法人国立国際医療研究センター, その他部局等, 特別研究員(SPD)
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Project Period (FY) |
2016-04-22 – 2020-03-31
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Keywords | 顎骨骨髄炎 / HLA / KIR / 次世代シーケンサー / ハプロタイプ / 遺伝多型 / 希少疾患 / 自己免疫 |
Outline of Annual Research Achievements |
自己免疫性と考えられる慢性顎骨骨髄炎について、疾病応答の多様性の要因と考えられるHLA遺伝子群の塩基配列およびKIR遺伝子群の遺伝子型を、ゲノム科学技術を駆使して同時に網羅的に決定し、両者の遺伝子型の組み合わせの観点から、罹患患者の遺伝的個体差を把握することを目指して研究を進めている。まず、全国的な共同研究のネットワークを構築し、倫理委員会の承認を得て、骨髄炎患者から18検体と、それと年齢・性別をできるだけマッチさせたコントロール18検体を収集した。同時に、次世代シーケンサーによるターゲットリシーケンスの方法に関して共同研究者と議論し、HLA35遺伝子のタイピングとKIR16遺伝子に関するハプロタイプの解析を初めて行った。解析結果のデータの取りまとめと解析を進め、健常人検体に比べて骨髄炎患者検体で有意に20%以上の高頻度に存在し、疾患感受性と考えられるHLA遺伝子のアミノ酸置換およびKIR遺伝子群のハプロタイプとHLA遺伝子のアミノ酸置換の組み合わせを同定した。その結果、HLA-Aの抗原ペプチドが結合するgrooveに存在するアミノ酸の置換が疾患感受性に関与している可能性が明らかになった。また、HLA-Cの特定のアミノ酸置換とKIR遺伝子群のハプロタイプの型の組み合わせは、HLA-Cの不安定性と関係する可能性が示唆された。現在、論文作成をほぼ完了し、投稿を行うところである。 その上で、発展的な研究として、骨髄炎の口腔微生物叢および炎症性サイトカインの動態に着目した研究にも着手しているところである。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
本年度は研究機関の異動に伴い、セットアップと新たな職場環境への適応に時間を要したものの、HLAとKIRの遺伝多型と骨髄炎の関連に関する研究成果を論文にまとめ、投稿寸前まで進めることが出来た。その結果から当初期待していた実験を新たに実施することは難しいことが分かったが、その一方、上記の2つの観点から発展的な研究を前に進めることが出来ている。
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Strategy for Future Research Activity |
遺伝多型と骨髄炎の関連に関する論文をオープンアクセス誌に出版する。その一方で、上記の2つの観点からの発展的研究を出来るだけ前に進め、将来的な論文化の見通しを立てる。
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Research Products
(5 results)