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2018 Fiscal Year Annual Research Report

オメガ3脂肪酸代謝酵素は海産魚にとって本当に必要か?

Research Project

Project/Area Number 16J06812
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

壁谷 尚樹  東京大学, 農学生命科学研究科, 特別研究員(PD)

Project Period (FY) 2016-04-22 – 2019-03-31
Keywords多価不飽和脂肪酸代謝 / 不飽和化酵素 / 遺伝子ノックアウト / ゲノム編集
Outline of Annual Research Achievements

海産魚への変異導入を実施するため、その準備から採卵、マイクロインジェクションによる第一世代の作出、およびその解析まで行った。実験魚には、ニベ Nibea mitsukuriiを用いた。まず、Crispr/Cas9システムを利用したゲノム編集に必要なガイドRNAのデザインを行った。不飽和化酵素遺伝子2(Fads2)をターゲットとし、3種のガイドRNAをデザインした。まず、これらガイドRNAをニベ受精卵にマイクロインジェクションし、得られた孵化仔魚に目的の変異が導入されているか確認した。その結果、75%の個体において予想した領域への変異導入が確認され、用いたガイドRNAの切断効率は良好であると判断された。その後、8月から9月にかけて親魚作出のためのインジェクションを連続して行った。この際のインジェクション翌日の浮上卵率は40~60%であり、インジェクションを行わない卵(80%以上)と比較すると低下はするものの、浮上卵の孵化率は90%以上を維持したため、十分に生残させることが可能な水準であると判断した。得られた浮上卵は100 L水槽に収容し、EPA・DHA強化したワムシおよびアルテミアを順次給餌した。なおこの間、同ロット内においても大きな体長差が現れ始めたため、状況に応じて成長の遅れが激しい個体を別水槽に移動させるなどして対応した。体長が約20 mmを超え始めた段階で配合飼料への餌付けを行い、体長が30 mm程度を超えた段階で500 L水槽への移動を行った。ここまでの生残数は41尾であった。作出した第一世代の変異導入率を解析するため、胸鰭の一部から抽出したゲノムDNAを用いて、変異導入の有無を確認した。その結果、初期ロットでは56%(9/16)の個体で目的の箇所への変異導入が確認された。今後は初期ロット以降のロットも合わせて解析を続け、次世代を作出する予定である。

Research Progress Status

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

平成30年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (20 results)

All 2019 2018 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (8 results) (of which Int'l Joint Research: 8 results,  Peer Reviewed: 8 results,  Open Access: 4 results) Presentation (11 results) (of which Int'l Joint Research: 6 results,  Invited: 2 results)

  • [Int'l Joint Research] University of Stirling(英国)

    • Country Name
      UNITED KINGDOM
    • Counterpart Institution
      University of Stirling
  • [Journal Article] A complete enzymatic capacity for long-chain polyunsaturated fatty acid biosynthesis is present in the Amazonian teleost tambaqui, Colossoma macropomum2019

    • Author(s)
      Renato B Ferraz, Naoki Kabeya, Monica Lopes-Marques, Andre M Machado, Ricardo A Ribeiro, Ana L Salaro, Rodrigo Ozorio, L Filipe C Castro, Oscar Monroig
    • Journal Title

      Comparative Biochemistry and Physiology Part B: Biochemistry and Molecular Biology

      Volume: 227 Pages: 90~97

    • DOI

      10.1016/j.cbpb.2018.09.003

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Methyl-end desaturases with ?12 and ω3 regioselectivities enable the de novo PUFA biosynthesis in the cephalopod Octopus vulgaris2019

    • Author(s)
      Diego Garrido, Naoki Kabeya, Francisco Hontoria, Juan C Navarro, Diana B Reis, M Virginia Martin, Covadonga Rodriguez, Eduardo Almansa, Oscar Monroig
    • Journal Title

      Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular and Cell Biology of Lipids

      Volume: 1864 Pages: 1134~1144

    • DOI

      10.1016/j.bbalip.2019.04.012

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] A key metabolic gene for recurrent freshwater colonization and radiation in fishes.2019

    • Author(s)
      Ishikawa, A, N Kabeya, K Ikeya, R Kakioka, JN Cech, N Osada, MC Leal, J Inoue, M Kume, A Toyoda, A Tezuka, AJ Nagano, YY Yamasaki, Y Suzuki, T Kokita, H Takahashi, K Lucek, D Marques, Y Takehana, K Naruse, S Mori, O Monroig, N Ladd, CJ Schubert, B Matthews, CL Peichel, O Seehausen, G Yoshizaki, J Kitano
    • Journal Title

      Science

      Volume: 印刷中 Pages: 印刷中

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Functional characterisation of two Δ12-desaturases demonstrates targeted production of linoleic acid as pheromone precursor in Nasonia2019

    • Author(s)
      Florian Semmelmann, Naoki Kabeya, Miriama Malcicka, Astrid Bruckmann, Bastian Broschwitz, Kristina Straub, Rainer Merkl, Oscar Monroig, Reinhard Sterner, Joachim Ruther, Jacintha Ellers
    • Journal Title

      The Journal of Experimental Biology

      Volume: 印刷中 Pages: 印刷中

    • DOI

      10.1242/jeb.201038

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] “Out of the can”: A draft genome assembly, liver transcriptome and nutrigenomics of the European sardine, Sardina pilchardus.2018

    • Author(s)
      Andre M. Machado, Ole K. Torresen, Naoki Kabeya, Alvarina Couto, Bent Petersen, Monica Felicio, Paula F. Campos, Elza Fonseca, Narcisa Bandarra, Monica Lopes-Marques, Renato Ferraz, Raquel Ruivo, Miguel M. Fonseca, Sissel Jentoft, Oscar Monroig, Rute R. da Fonseca, L. Filipe C. Castro
    • Journal Title

      Genes

      Volume: 9 Pages: 485~485

    • DOI

      10.3390/genes9100485

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Desaturases and elongases involved in polyunsaturated fatty acid biosynthesis in aquatic invertebrates: a comprehensive review2018

    • Author(s)
      Oscar Monroig, Naoki Kabeya
    • Journal Title

      Fisheries Science

      Volume: 84 Pages: 911~928

    • DOI

      10.1007/s12562-018-1254-x

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Genes for de novo biosynthesis of omega-3 polyunsaturated fatty acids are widespread in animals2018

    • Author(s)
      Naoki Kabeya, Miguel M. Fonseca, David E. K. Ferrier, Juan C. Navarro, Line K. Bay, David S. Francis, Douglas R. Tocher, L. Filipe C. Castro, Oscar Monroig
    • Journal Title

      Science Advances

      Volume: 4 Pages: eaar6849

    • DOI

      10.1126/sciadv.aar6849

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Retention of fatty acyl desaturase 1 (fads1) in Elopomorpha and Cyclostomata provides novel insights into the evolution of long-chain polyunsaturated fatty acid biosynthesis in vertebrates2018

    • Author(s)
      Monica Lopes-Marques, Naoki Kabeya, Yu Qian, Raquel Ruivo, Miguel M Santos, Byrappa Venkatesh, Douglas R. Tocher, L Filipe C Castro, Oscar Monroig
    • Journal Title

      BMC Evolutionary Biology

      Volume: 18 Pages: 157

    • DOI

      10.1186/s12862-018-1271-5

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] 水産生物の脂肪酸代謝酵素の機能解析とその利用2019

    • Author(s)
      壁谷尚樹
    • Organizer
      日本水産学会大会春季大会
    • Invited
  • [Presentation] 魚類fads2遺伝子の改変による脂肪酸合成系改良の試み2019

    • Author(s)
      柿本貴広, 潮 秀樹, 壁谷尚樹, 吉崎悟朗, 木下政人
    • Organizer
      日本水産学会大会春季大会
  • [Presentation] 様々な動物種がオメガ3多価不飽和脂肪酸のde novo生合成を可能にする遺伝子を保持する2018

    • Author(s)
      壁谷尚樹, Fonseca, M.M., Ferrier, D.E.K., Navarro, J.C., Bay, L.K., Francis, D.S., Tocher, D.R., Castro, L.F.C., Monroig O.
    • Organizer
      マリンバイオテクノロジー学会
  • [Presentation] マダコにおけるオメガ3多価不飽和脂肪酸のde novo生合成2018

    • Author(s)
      壁谷尚樹, Garrido, D., Hontoria, F., Navarro, J.C., Reis, D.B., Martin, M.V., Rodriguez, C.R., Almansa, E., Monroig, O.
    • Organizer
      日本水産学会大会秋季大会
  • [Presentation] ゲノム編集技術を用いたfads2ノックインマダイの作出2018

    • Author(s)
      柿本貴広, 鷲尾洋平, 大濱光希, 壁谷尚樹, 吉崎悟朗, 家戸敬太郎, 木下政人
    • Organizer
      日本水産学会大会秋季大会
  • [Presentation] Desaturase genes enabling de novo biosynthesis of omega-3 polyunsaturated fatty acids are widespread in animals.2018

    • Author(s)
      Kabeya, N., Fonseca, M.F., Ferrier, D.E.K., Navarro, J.C., Bay, L.K., Francis, D., Tocher, D.R., Castro, L.F.C., Monroig, O.
    • Organizer
      Aoshan Forum - The 4th Workshop on Lipid Nutrition and Metabolism in Aquatic Animals
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Retracing the evolution of long-chain polyunsaturated fatty acids biosynthesis in vertebrates.2018

    • Author(s)
      Lopes-Marques, M., Kabeya, N., Qian, Y., Ruivo, R.F., Santos, M., Venkatesh, B., Tocher, D.R., Castro, L.F.C., Monroig, O.
    • Organizer
      31st Congress New European Society for Comparative Physiology and Biochemistry
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Creeping up to freshwater: complementation of the DHA biosynthetic pathway in the lineage of freshwater sole (Pleuronectiformes: Achiridae).2018

    • Author(s)
      Matsushita, Y., Sanada, S., Kabeya, N., Haga, Y., Satoh, S., Yazawa, R., Yoshizaki, G.
    • Organizer
      18th International Symposium on Fish Nutrition and Feeding
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Long-chain polyunsaturated fatty acid biosynthesis in Japanese eel Anguilla japonica: Cloning and functional characterization of fatty acid desaturase 1 (Fads1).2018

    • Author(s)
      Kabeya, N., Lopes-Marques, M., Santos, M., Tocher, D.R., Castro, L.F.C., Monroig, O.
    • Organizer
      18th International Symposium on Fish Nutrition and Feeding
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Essential fatty acid metabolism and requirements of the cleaner fish, ballan wrasse Labrus bergylta: Defining pathways of long-chain polyunsaturated fatty acid biosynthesis.2018

    • Author(s)
      Monroig, O., Yevzelman, S., Oboh, A. Tocher, D.R., Kabeya, N.
    • Organizer
      18th International Symposium on Fish Nutrition and Feeding
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Elucidating the biosynthesis of long-chain polyunsaturated fatty acid in a freshwater fish species, Clarias gariepinus.2018

    • Author(s)
      Oboh, A., Betancor, M.B., Kabeya, N., Navarro, J.C., Tocher, D.R., Monroig, O.
    • Organizer
      18th International Symposium on Fish Nutrition and Feeding
    • Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2019-12-27  

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