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2016 Fiscal Year Annual Research Report

内在性ボルナウイルスによるウイルス感染抑制メカニズムの解明

Research Project

Project/Area Number 16J11448
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

小嶋 将平  京都大学, 生命科学研究科, 特別研究員(DC2)

Project Period (FY) 2016-04-22 – 2018-03-31
Keywords内在性ウイルス様エレメント / 非コードRNA / ヒストンmRNAプロセシング / ウイルス感染抑制
Outline of Annual Research Achievements

ヒトを含む多くの哺乳動物ゲノムにはウイルス由来の配列(内在性ウイルス様エレメント)が存在する。内在性ウイルス様エレメント由来のいくつかは宿主の遺伝子として適応進化し、抗ウイルス作用等の重要な生理機能を担うことが知られている。私たちはこれまでに、ヒトゲノムに存在する内在性ウイルス様エレメントの一つであるhsEBLN-3がヒトの組織および細胞株において非コードRNAとして発現し、新たなボルナ病ウイルス(BDV)感染の抑制に寄与することを明らかとしたが、その分子機序は明らかではない。マイクロアレイを用いた網羅的な遺伝子変動の解析により、hsEBLN-3由来RNAがIL-1ファミリーサイトカインの発現を調節することが示唆されていた。そこで、IL-1ファミリーサイトカインがBDV感染に与える影響を解析するため、BDV感染細胞においてIL-1ファミリーサイトカインの過剰発現を行った。しかしBDV感染への明確な影響は観察されなかった。そこで、IL-1ファミリーサイトカインを同定した際に用いたマイクロアレイによる宿主の遺伝子発現の変化のデータを再解析した。その結果、hsEBLN-3由来RNAはIL-1ファミリーサイトカインだけでなくポリアデニル化されたヒストンmRNA発現量を制御することを見出した。さらに、ポリアデニル化されたヒストンmRNAの発現変化がBDV感染の抑制に寄与することを明らかとした。この分子機序は当初の仮説とは異なるものの、hsEBLN-3によるウイルス感染抑制の機序の一端を明らかとすることができた。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

昨年度の研究では、宿主の遺伝子発現を網羅的に解析することでhsEBLN-3由来RNAがポリアデニル化されたヒストンmRNAの発現量を制御することを見出した。さらに、ポリアデニル化されたヒストンmRNAがウイルス感染の抑制に寄与しうることも明らかとした。この分子機序は当初の仮説とは異なるものの、本研究の目的であるhsEBLN-3によるウイルス感染抑制の分子機序の一端を明らかとすることができた。当初の仮説が真ではないことを示すデータが得られてからは、今までに得ていたデータを随時吟味しこれまで考えていた仮説の再検討を繰り返した。その結果、これまで解明されていなかった新たな宿主とウイルスの関係を明らかとすることができた。これらの過程で、真理を追求する洞察力を磨くことができ質の高い研究を行うことができたと考えている。また、本研究に関して口頭及びポスター発表を行い、3つの国際・国内学会において優秀な発表として評価された。このことから、外部からの研究に対する評価が高いと実感している。学会発表に加え、アウトリーチ活動として内在性ウイルスに関する分野横断的な研究会の企画も行い、学際的に研究に取り組んでいる。現在も精力的に課題に取り組んでおり、今後の成果に結びつくと確信している。

Strategy for Future Research Activity

今後は、「ポリアデニル化されたヒストンmRNAによるBDV感染の分子機序」と「hsEBLN-3の形成及び種間での保存」について解析を行う。BDVは核内での持続感染を成立させるためにヒストンタンパク質を利用することが知られている。そこで、hsEBLN-3由来RNAによるポリアデニル化されたヒストンmRNAの発現調節がBDV感染に必要なヒストンタンパク質の発現量を変化させることによりBDV感染を抑制する可能性が考えられる。この仮説をもとに、ポリアデニル化されたヒストンmRNAの発現量の変化がBDV感染に必要なヒストンタンパク質の発現量を変化させるのかを解析する。この解析によりhsEBLN-3によるBDV感染抑制のより詳細な分子機序を明らかとすることができると考えている。また、hsEBLN-3の形成及び種間での保存について進化学的な解析を行う。ヒトゲノムには複数のボルナウイルス由来の配列が存在するが、hsEBLN-3のみが多くのヒト組織でユビキタスに発現している。このことはhsEBLN-3が進化の過程でプロモーターを獲得し、その後宿主の遺伝子として適応進化したことを示唆する。hsEBLN-3の形成及び種間での保存を進化学的に解析することで、ボルナウイルスから宿主への遺伝子の水平伝搬が宿主の新たな遺伝子獲得及びウイルスとの攻防の歴史にどのように寄与したのかを明らかとすることができると考えられる。

  • Research Products

    (8 results)

All 2017 2016 Other

All Presentation (7 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results) Remarks (1 results)

  • [Presentation] A long non-coding RNA derived from an endogenous bornavirus-like element in human genome restricts exogenous bornavirus infection2017

    • Author(s)
      Shohei Kojima
    • Organizer
      15th International Student Seminar
    • Place of Presentation
      京都大学(京都)
    • Year and Date
      2017-02-23 – 2017-02-24
  • [Presentation] 内在性ボルナウイルス様エレメント由来非コードRNAはヒストンmRNAの3'末端プロセシングを介してボルナウイルス感染を抑制する2017

    • Author(s)
      小嶋将平
    • Organizer
      Sixth Negative Strand Virus-Japan
    • Place of Presentation
      ラグナガーデンホテル(沖縄)
    • Year and Date
      2017-01-16 – 2017-01-18
  • [Presentation] タンパク質?いやいや、「RNA」こそが 内在性ウイルス様エレメント由来の転写産物の中心だ!2016

    • Author(s)
      小嶋将平
    • Organizer
      第一回内在性ウイルス用エレメント研究会
    • Place of Presentation
      京都大学(京都)
    • Year and Date
      2016-12-18 – 2016-12-18
  • [Presentation] Evolution of an antiviral RNA element derived from an endogenous bornavirus-like nucleoprotein2016

    • Author(s)
      小嶋将平、本田知之、朝長啓造
    • Organizer
      第64回日本ウイルス学会学術集会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター (札幌)
    • Year and Date
      2016-10-23 – 2016-10-25
  • [Presentation] A lncRNA derived from an endogenous viral element in human genome suppresses virus infection2016

    • Author(s)
      Shohei Kojima
    • Organizer
      The 23rd East Asia Joint Symposium
    • Place of Presentation
      台北(台湾)
    • Year and Date
      2016-10-17 – 2016-10-20
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] A novel lncRNA derived from an endogenous RNA virus element in human genome is a potent inhibitor against exogenous virus infection2016

    • Author(s)
      Shohei Kojima, Tomoyuki Honda, Keizo Tomonaga
    • Organizer
      CSHL meeting; Regulatory and Non-coding RNAs
    • Place of Presentation
      ニューヨーク(アメリカ合衆国)
    • Year and Date
      2016-09-23 – 2016-09-27
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] A lncRNA derived from an endogenous RNA virus element in human genome functions as a potent inhibitor of exogenous virus infection2016

    • Author(s)
      Shohei Kojima, Tomoyuki Honda, Keizo Tomonaga
    • Organizer
      The RNA Society of Japan 18th Annual Meeting & The 21st Annual Meeting of the RNA Society
    • Place of Presentation
      国立京都国際会館(京都)
    • Year and Date
      2016-06-28 – 2016-07-02
    • Int'l Joint Research
  • [Remarks] 所属研究機関が作成した、国際学会での受賞に関するwebページ

    • URL

      http://www.infront.kyoto-u.ac.jp/news/post-1166/

URL: 

Published: 2018-01-16  

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